Hsromega - Hsromega
| HSR omega konzervovaná oblast 1 | |
|---|---|
 Konzervované sekundární struktura HSR-omega 1 | |
| Identifikátory | |
| Symbol | HSR omega 1 |
| Rfam | RF01885 |
| Další údaje | |
| RNA typ | Gen |
| PDB struktur | PDBe |
Vývojově aktivní a indukovatelný tepelným šokem hsromega nebo hsrω gen v Drosophila produkuje více dlouhá nekódující RNA přepisy. Tento gen je transkripčně aktivní téměř ve všech typech buněk Drosophila a je nejaktivněji indukovaným sledováním tepelný šok. Jedinečnou vlastností genu hsromega, která vedla k objevení obláčku 93D v roce 1970, je jeho jedinečná indukovatelnost s benzamid a řadu dalších amidů.
Několik transkriptů tohoto genu zahrnuje a jaderný > 10kb dlouhý jaderný přepis, hsromega-n a 1,9kb jaderný přepis, který po sestřihu produkuje 1,2kb cytoplazmatický přepis. Transkript nukleární hsromega-n> 10kb organizuje nukleoplazmatické omega skvrny, s nimiž heterogenní proteiny vázající nukleární RNA (hnRNP) a některé další proteiny se lokalizují společně. Omega skvrny se doporučují, aby fungovaly jako úložiště pro hnRNP atd., Které nejsou v daném čase aktivně zapojeny.[1]
Genomová architektura tohoto genu a vazebné vlastnosti hnRNP jeho velkého jaderného transkriptu jsou zachovány u různých druhů, i když sekvence primární báze se rychle rozcházely. Tepelný šok způsobí, že zmizí omega skvrny a všechny proteiny spojené s omega skvrnami a transkript hsrω-n se hromadí na lokusu 93D. Transkript hsrω-n přímo nebo nepřímo ovlivňuje lokalizaci / stabilitu / aktivitu různých proteinů včetně hnRNPs, Sxl, Hsp83, cAMP element vazby vázající vazebný protein (CBP), Drosophila inhibitor apoptóza protein 1 (DIAP1), členové signalizující JNK, proteazom složky, lamin C, ISWI, HP1 a poly (ADP) -ribóza polymeráza. S ohledem na interakce této velké jaderné energie nekódující RNA s různými regulačními proteiny se zdá, že funguje jako rozbočovač, který integruje více regulačních sítí v buňce.[2][3][4]
Reference
- ^ Prasanth KV, Rajendra TK, Lal AK, Lakhotia SC (říjen 2000). „Omega tečky - nová třída jaderných teček obsahujících hnRNP spojené s nekódující hsr-omega RNA v Drosophila". Journal of Cell Science. 113 (19): 3485–3497. PMID 10984439.
- ^ Mallik M, Lakhotia SC (listopad 2009). „Vývojově aktivní a stresem indukovatelný nekódující gen hsrω je novým regulátorem apoptózy u Drosophila". Genetika. 183 (3): 831–852. doi:10.1534 / genetika.109.108571. PMC 2778980. PMID 19737742.
- ^ Mallik M, Lakhotia SC (duben 2010). „Vylepšené aktivity vazebného proteinu CREB, heterogenních jaderných ribonukleoproteinů a proteazomu po downregulaci nekódujících transkriptů hsrω pomáhají potlačovat poly (Q) patogenezi v modelech létání“. Genetika. 184 (4): 927–945. doi:10.1534 / genetika.109.113696. PMC 2865928. PMID 20065067.
- ^ Lakhotia SC (2011). „Čtyřicet let obláčku 93D Drosophila melanogaster" (PDF). Journal of Biosciences. 36 (3): 399–423. doi:10.1007 / s12038-011-9078-1. PMID 21799254.
Další čtení
- Mallik M, Lakhotia SC (2009). „RNAi pro velké nekódující transkripty hsrω potlačuje polyglutaminovou patogenezi v Drosophila modely " (PDF). RNA Biology. 6 (4): 464–478. doi:10,4161 / rna.6.4.9268. PMID 19667761.
- Akanksha, Mallik M, Fatima R, Lakhotia SC (duben 2008). „The hsrω05241 alela nekódujícího hsrω gen Drosophila melanogaster není odpovědná za mužskou sterilitu, jak bylo uvedeno dříve " (PDF). Journal of Genetics. 87 (1): 87–90. doi:10.1007 / s12041-008-0012-8. PMID 18560179.
- Sengupta S, Lakhotia SC (2006). „Změněné exprese nekódujícího genu hsromega zvyšují neurotoxicitu vyvolanou poly-Q Drosophila" (PDF). RNA Biology. 3 (1): 28–35. doi:10,4161 / rna.3.1.2559. PMID 17114940.
- Chowdhuri DK, Nazir A, Saxena DK (2001). "Účinek tří chlorovaných pesticidů na gen hsrω stresu v transgenním prostředí Drosophila melanogaster". Journal of Biochemical and Molecular Toxicology. 15 (4): 173–186. doi:10,1002 / jbt.15.abs. PMID 11673846.
- Lakhotia SC, Tapadia MG (květen 1998). Msgstr "Genetické mapování amidových odezvových prvků v hsr omega lokusu Drosophila melanogaster". Chromozom. 107 (2): 127–135. doi:10.1007 / s004120050288. PMID 9601981.
- Drosopoulou E, Konstantopoulou I, Scouras ZG (1996). "Geny tepelného šoku v Drosophila montium podskupina: chromozomální lokalizace a evoluční důsledky ". Chromozom. 105 (2): 104–110. doi:10.1007 / BF02509520. PMID 8753700.
- Jolly C, Lakhotia SC (2006). „Lidský sat III a Drosophila transkripty hsrω: společné paradigma pro regulaci zpracování nukleární RNA ve stresových buňkách ". Výzkum nukleových kyselin. 34 (19): 5508–5514. doi:10.1093 / nar / gkl711. PMC 1636489. PMID 17020918.
- Onorati MC, Lazzaro S, Mallik M, Ingrassia AM, Carreca AP, Singh AK, Chaturvedi DP, Lakhotia SC, Corona DF (květen 2011). "ISWI chromatin remodeler organizuje hsrω ncRNA obsahující omega skvrnité jaderné oddíly". PLoS Genetics. 7 (5): e1002096. doi:10.1371 / journal.pgen.1002096. PMC 3102753. PMID 21637796.
- Mallik M, Lakhotia SC (červen 2011). „Pleiotropní důsledky misexprese vývojově aktivního a stresem indukovatelného nekódujícího genu hsrω v Drosophila" (PDF). Journal of Biosciences. 36 (2): 265–280. doi:10.1007 / s12038-011-9061-x. PMID 21654081.