Skupinová bílkovina s vysokou mobilitou HMG14 a HMG17 - High mobility group protein HMG14 and HMG17
| HMG14 a HMG17 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | HMG14_17 | ||||||||
| Pfam | PF01101 | ||||||||
| InterPro | IPR000079 | ||||||||
| STRÁNKA | PDOC00307 | ||||||||
| |||||||||
Skupinová bílkovina s vysokou mobilitou HMG14 a HMG17 také známý jako nukleosomální vazebná doména je rodina evolučně příbuzných proteinů.
Proteiny skupiny s vysokou mobilitou (HMG) tvoří rodinu relativně nízkomolekulárníchhiston komponenty v chromatin. HMG14 a HMG17 jsou vysoce podobné proteiny s přibližně 100 aminokyselinovými zbytky; sekvence kuřecího HMG14 je téměř stejná jako kuřecí HMG17 jako u savčích polypeptidů HMG14.[1] Proteiny se vážou na vnitřní stranu nukleosomální DNA a mění interakci mezi DNA a DNA histonový oktamer. Předpokládá se, že mohou být zapojeni do procesu, který uděluje specifické konformace chromatinu transkribovatelným oblastem v genomu.[2]
Signatura SMART popisuje nukleosomální vazebnou doménu, která usnadňuje vazbu proteinů na nukleosomy v chromatinu. Doména se nejčastěji vyskytuje v proteinech skupiny s vysokou mobilitou (HMG), HMG14 a HMG17, ale nachází se také v jiných proteinech, které se vážou na nukleosomy, např. NBP-45. NBP-45 je nukleosomální vazebný protein, poprvé identifikovaný u myší,[3] který souvisí s HMG14 a HMG17. NBP-45 se váže specificky na částice jádra nukleosomu a může fungovat jako transkripční aktivátor. Tato zjištění vedla k domněnce, že tato doména, běžná pro NBP-45, HMG14 a HMG17, je zodpovědná za vazbu proteinů na nukleosomy v chromatinu.
Příklady
Lidské proteiny obsahující tuto doménu zahrnují:
Reference
- ^ Dodgson JB, Browne DL, Black AJ (1988). „Kuřecí chromozomální protein HMG-14 a HMG-17 klony cDNA: izolace, charakterizace a srovnání sekvencí“. Gen. 63 (2): 287–295. doi:10.1016 / 0378-1119 (88) 90532-X. PMID 3384337.
- ^ Gonzalez FJ, Bustin M, Landsman D, Soares N (1986). "Chromozomální protein HMG-17. Kompletní lidská cDNA sekvence a důkazy o multigenové rodině". J. Biol. Chem. 261 (16): 7479–7484. PMID 3754870.
- ^ Bustin M, Landsman D, Shirakawa H, Postnikov YV (2000). „NBP-45, nový nukleosomální vazebný protein s tkáňově specifickou a vývojově regulovanou expresí“. J. Biol. Chem. 275 (9): 6368–6374. doi:10.1074 / jbc.275.9.6368. PMID 10692437.