Halorhodospira neutriphila - Halorhodospira neutriphila - Wikipedia

Halorhodospira neutriphila je bakterie z rodu Halorhodospira který byl izolován z mikrobiální podložky z mořského solivarna z Rhone Delta v Francie.[1][2][3][4][5] Mikrobiální rohož se tvoří na povrchu sedimentu a je tlustá mezi 10 a 20 mm, pod jemnou vrstvou (2–3 cm) sádrové kůry.[6] Rohož se skládá z červené vrstvy kmenů fialových bakterií pod zelenou vrstvou sinic, proložené sírovými kuličkami a občas pokryté ložisky halitů.[6] Tyto mikroby tvořící rohož žijí v anoxických bahnech a sedimentech a tvoří bentickou rohož v prostředí hypersalinní laguny, kde se slanost vody pohybuje v rozmezí 240–320% celkové slanosti.[6] H. neutriphila byl izolován z červené vrstvy mikrobiální vrstvy a bylo zjištěno, že je extrémně halofilní a dobře přizpůsobený tak, aby odolal extrémním solným podmínkám jejich upraveného mořského prostředí. Typový kmen byl identifikován jako kmen SG 3301T.[6]

Fenotypové vlastnosti

H. neutriphila je fototrofní, fialová bakterie se spirilloidní morfologií a pohyblivá s polárními bičíky. Tento druh bakterie je gramnegativní a velikost buněk se pohybuje (šířka po délce) od 1-1,2 μm x 2-5 μm.[6]  H. neutriphila má fotosyntetický intracelulární membránový systém, který se skládá z lamelárních komínů se spirilloxanthanem a BCI A jako hlavní karotenoidy.[6]

Optimální růst

Optimální růst pro H. neutriphila dochází s 9-12% (hmotn./obj.) přítomností NaCl v kultuře a médiem doplněným 1 mM Na2S.9H20, 2mM acetátem, 1mM sukcinátem a 0,05% kvasinkovým extraktem.[6] Jejich metabolismus je nejúčinnější, přičemž jako donory elektronů slouží sulfid a acetát a jako zdroj uhlíku CO2. K maximálnímu růstu dochází při rozmezí pH 6,8 - 7 při 30-35 ° C při intenzitě světla 5 000 luxů s cyklem 16h: 8h světlo-tma.[6] Zaznamenává se rychlost růstu pro typový kmen 0,034 h ^ -1 a replikace buněk probíhá prostřednictvím binárního štěpení.[6]

Genetické vlastnosti

Složení bází DNA pro typový kmen je 74,5 mol% G + C.[6] Gen 16S rDNA s částečnou délkou genomu 1357 párů bází byl použit ke stanovení příbuznosti H. neutriphila kmen typu k jiným kmenům, včetně SG 3304, se kterým sdílí 100% homologii.[7][6] Kmen typu úzce souvisí s druhem Rhodovibrio sodomensis s 98,8% homologií a Halorhodospira halophila s 94,6% homologií.[6] U kmenů SG 3301T a SG 3304 bylo stanoveno, že jsou dostatečně geneticky, morfologicky a fyziologicky odlišné od ostatních druhů rodu Halorhodospira být klasifikován jako nový druh; oni byli jmenováni Halorhodospira neutriphila sp. listopad.[6]

Reference

  1. ^ Hirschler-Réa, A; Matheron, R; Riffaud, C; Mouné, S; Eatock, C; Herbert, RA; Willison, JC; Caumette, P (leden 2003). "Izolace a charakterizace spirilloidních purpurových fototrofních bakterií tvořících červené vrstvy v mikrobiálních podložkách středomořských salternů: popis Halorhodospira neutriphila sp. Nov. A emendace rodu Halorhodospira". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 53 (Pt 1): 153–63. doi:10.1099 / ijs.0.02226-0. PMID  12656167.
  2. ^ „Halorhodospira“. LPSN.
  3. ^ "Halorhodospira neutriphila". www.uniprot.org.
  4. ^ Parker, Charles Thomas; Garrity, George M. (19. ledna 2017). "Taxonomický abstrakt pro tento druh". NamesforLife, LLC. doi:10,1601 / tx.2175. Citovat deník vyžaduje | deník = (Pomoc)
  5. ^ „Podrobnosti: DSM-15116“. www.dsmz.de.
  6. ^ A b C d E F G h i j k l m Citovat chybu: Pojmenovaná reference :0 bylo vyvoláno, ale nikdy nebylo definováno (viz stránka nápovědy).
  7. ^ Sayers; et al. (2018). „Národní centrum pro biotechnologické informace“. NCBI.

externí odkazy