HRB (gen) - HRB (gene)

AGFG1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2D9L, 2OLM, 2VX8
Identifikátory
Aliasy	AGFG1, HRB, RAB, RIP, ArfGAP s opakováním FG 1
Externí ID	OMIM: 600862 MGI: 1333754 HomoloGene: 37929 Genové karty: AGFG1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	227,561,214 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	82,901,182 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0005097, GO: 0005099, GO: 0005100 Aktivátor aktivity GTPázy; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• buněčná projekce; • intracelulární membránou vázaná organela; • jaderný pór; • tělo neuronových buněk; • cytoplazmatický váček; • buněčné jádro; • cytosol;
Biologický proces	• zprostředkující organizace vláken; • diferenciace buněk; • transport mRNA; • export mRNA z jádra; • vývoj mnohobuněčných organismů; • GO: 0032320, GO: 0032321, GO: 0032855, GO: 0043089, GO: 0032854 pozitivní regulace aktivity GTPázy; • sestava akrozomu; • spermatogeneze; • diferenciace spermatidových jader; • membránová organizace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3267
	15463
	ENSG00000173744
	ENSMUSG00000026159
	P52594
	Q8K2K6
	NM_001135187; NM_001135188; NM_001135189; NM_004504
	NM_010472; NM_001310713; NM_001347077; NM_001368850
	NP_001128659; NP_001128660; NP_001128661; NP_004495
	NP_001297642; NP_001334006; NP_034602; NP_001355779
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Arf-GAP doména a FG repetice obsahující protein 1 je protein že u lidí je kódován AGFG1 gen.^[5]^[6]

Funkce

Protein kódovaný tímto genem souvisí s nukleoporiny, třídou proteinů, které zprostředkovávají nukleocytoplazmatický transport. Tento kódovaný protein váže aktivační doménu Rev, když je Rev sestaven na svůj cíl RNA, a může výrazně zvýšit aktivitu Rev, když je nadměrně exprimován. Bylo popsáno několik alternativně sestřižených variant transkriptu tohoto genu, ale povaha celé délky některých z těchto variant nebyla stanovena.^[6]

Interakce

Bylo prokázáno, že HRB (gen) komunikovat s EPS15L1^[7] a EPS15.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000173744 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026159 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Fritz CC, Zapp ML, Green MR (září 1995). „Protein podobný lidskému nukleoporinu, který specificky interaguje s HIV Rev“. Příroda. 376 (6540): 530–3. doi:10.1038 / 376530a0. PMID 7637788. S2CID 4252707.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HRB HIV-1 Rev binding protein“.
^ ^A ^b Doria M, Salcini AE, Colombo E, Parslow TG, Pelicci PG, Di Fiore PP (prosinec 1999). „Interakce založená na doméně eps15 homologie (EH) mezi eps15 a hrb spojuje molekulární aparát endocytózy s nukleocytosolickým transportem“. J. Cell Biol. 147 (7): 1379–84. doi:10.1083 / jcb.147.7.1379. PMC 2174238. PMID 10613896.

Další čtení

Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). "Role pomocných proteinů HIV-1 ve virové patogenezi a interakcích hostitel-patogen". Cell Res. 15 (11–12): 923–34. doi:10.1038 / sj.cr.7290370. PMID 16354571.
Bogerd HP, Fridell RA, Madore S, Cullen BR (1995). "Identifikace nového buněčného kofaktoru pro třídu Rev / Rex retrovirových regulačních proteinů". Buňka. 82 (3): 485–94. doi:10.1016/0092-8674(95)90437-9. PMID 7634337. S2CID 18962536.
Fridell RA, Bogerd HP, Cullen BR (1996). „Jaderný export pozdních HIV-1 mRNA probíhá prostřednictvím cesty exportu buněčných proteinů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 93 (9): 4421–4. doi:10.1073 / pnas.93.9.4421. PMC 39553. PMID 8633082.
Fritz CC, Green MR (1997). „HIV Rev používá konzervovanou cestu exportu buněčných proteinů pro nukleocytoplazmatický transport virových RNA“. Curr. Biol. 6 (7): 848–54. doi:10.1016 / S0960-9822 (02) 00608-5. PMID 8805303. S2CID 16705807.
Stutz F, Izaurralde E, Mattaj IW, Rosbash M (1997). „Role opakujících se domén nukleoporinových FG při exportu proteinu a RNA viru lidské imunodeficience typu 1 a RNA z jádra“. Mol. Buňka. Biol. 16 (12): 7144–50. doi:10,1128 / mcb.16.12.7144. PMC 231718. PMID 8943370.
Jones T, Sheer D, Bevec D, Kappel B, Hauber J, Steinkasserer A (1997). „Lidský HIV-1 Rev vazebný protein hRIP / Rab (HRB) se mapuje na chromozom 2q36“. Genomika. 40 (1): 198–9. doi:10.1006 / geno.1996.4457. PMID 9070945.
Salcini AE, Confalonieri S, Doria M, Santolini E, Tassi E, Minenkova O, Cesareni G, Pelicci PG, Di Fiore PP (1997). „Vazebná specificita a in vivo cíle EH domény, nový modul interakce protein-protein“. Genes Dev. 11 (17): 2239–49. doi:10.1101 / gad.11.17.2239. PMC 275390. PMID 9303539.
Neville M, Stutz F, Lee L, Davis LI, Rosbash M (1998). „Člen rodiny importin-beta Crm1p přemosťuje interakci mezi Rev a komplexem jaderných pórů během jaderného exportu“. Curr. Biol. 7 (10): 767–75. doi:10.1016 / S0960-9822 (06) 00335-6. PMID 9368759. S2CID 6827586.
Güre AO, Altorki NK, Stockert E, Scanlan MJ, Old LJ, Chen YT (1998). „Antigeny lidské rakoviny plic rozpoznané autologními protilátkami: definice nové cDNA odvozené od lokusu supresorového genu na chromozomu 3p21.3.“ Cancer Res. 58 (5): 1034–41. PMID 9500467.
Farjot G, seržant A, Mikaélian I. (1999). „Nový protein podobný nukleoporinu interaguje jak s HIV-1 Rev jaderným exportním signálem, tak s CRM-1“. J. Biol. Chem. 274 (24): 17309–17. doi:10.1074 / jbc.274.24.17309. PMID 10358091.
Doria M, Salcini AE, Colombo E, Parslow TG, Pelicci PG, Di Fiore PP (2000). „Interakce založená na doméně eps15 homologie (EH) mezi eps15 a hrb spojuje molekulární aparát endocytózy s nukleocytosolickým transportem“. J. Cell Biol. 147 (7): 1379–84. doi:10.1083 / jcb.147.7.1379. PMC 2174238. PMID 10613896.
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Carvalho AF, Matsukuma A, Baia GS, Simpson DH, Brunstein A, de Oliveira PS, Bucher P, Jongeneel CV, O'Hare MJ, Soares F, Brentani RR, Reis LF, de Souza SJ, Simpson AJ (2000). "Brokovnicové sekvenování lidského transkriptomu se značkami sekvencí exprimovanými ORF". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (7): 3491–6. doi:10.1073 / pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
Yang J, Bogerd HP, Wang PJ, Page DC, Cullen BR (2001). "Dva úzce související lidské jaderné exportní faktory využívají zcela odlišné cesty exportu". Mol. Buňka. 8 (2): 397–406. doi:10.1016 / S1097-2765 (01) 00303-3. PMID 11545741.
Chen D, Li X, Zhai Z, Shu HB (2002). „Nový protein se zinkovým prstem interaguje s proteinem interagujícím s receptorem (RIP) a inhibuje aktivaci tumor nekrotizujícího faktoru (TNF) - a IL1 indukovanou aktivaci NF-kappa B“. J. Biol. Chem. 277 (18): 15985–91. doi:10,1074 / jbc.M108675200. PMID 11854271.
Scherl A, Couté Y, Déon C, Callé A, Kindbeiter K, Sanchez JC, Greco A, Hochstrasser D, Diaz JJ (2003). "Funkční proteomická analýza lidského nukleolu". Mol. Biol. Buňka. 13 (11): 4100–9. doi:10,1091 / mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849.
Kiss A, Li L, Gettemeier T, Venkatesh LK (2003). „Funkční analýza interakce jaderného exportního signálu viru lidské imunodeficience typu 1 Rev s jeho kofaktory“. Virologie. 314 (2): 591–600. doi:10.1016 / S0042-6822 (03) 00531-2. PMID 14554087.
Sánchez-Velar N, Udofia EB, Yu Z, Zapp ML (2004). „hRIP, buněčný kofaktor pro funkci Rev, podporuje uvolňování HIV RNA z perinukleární oblasti“. Genes Dev. 18 (1): 23–34. doi:10.1101 / gad.1149704. PMC 314270. PMID 14701878.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000173744 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026159 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7637788-5] Fritz CC, Zapp ML, Green MR (září 1995). „Protein podobný lidskému nukleoporinu, který specificky interaguje s HIV Rev“. Příroda. 376 (6540): 530–3. doi:10.1038 / 376530a0. PMID 7637788. S2CID 4252707.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: HRB HIV-1 Rev binding protein“.

[pmid10613896-7] A ^b Doria M, Salcini AE, Colombo E, Parslow TG, Pelicci PG, Di Fiore PP (prosinec 1999). „Interakce založená na doméně eps15 homologie (EH) mezi eps15 a hrb spojuje molekulární aparát endocytózy s nukleocytosolickým transportem“. J. Cell Biol. 147 (7): 1379–84. doi:10.1083 / jcb.147.7.1379. PMC 2174238. PMID 10613896.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]