HNRPUL1 - HNRPUL1

HNRNPUL1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1ZRJ
Identifikátory
Aliasy	HNRNPUL1, E1B-AP5, E1BAP5, HNRPUL1, heterogenní nukleární ribonukleoprotein U jako 1
Externí ID	OMIM: 605800 MGI: 2443517 HomoloGene: 31419 Genové karty: HNRNPUL1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 19 (lidský)
Konec	41,307,787 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 7 (myš)
Konec	25,754,757 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba enzymu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • reakce na virus; • Zpracování RNA; • regulace transkripce, DNA-šablony; • transkripce, chráněná DNA;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	11100
	232989
	ENSG00000105323
	ENSMUSG00000040725
	Q9BUJ2
	Q8VDM6
NM_001301016; NM_007040; NM_144732; NM_144733; NM_144734;
	NM_001321208; NM_001321211
	NM_144922; NM_178089; NM_001360789
	NP_001287945; NP_001308137; NP_001308140; NP_008971; NP_653333
	NP_659171; NP_835190; NP_001347718
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Heterogenní jaderný ribonukleoprotein protein podobný U 1 je protein že u lidí je kódován HNRNPUL1 gen.^[5]^[6]^[7]

Tento gen kóduje protein vázající nukleární RNA z rodiny heterogenních nukleárních ribonukleoproteinů (hnRNP). Tento protein se specificky váže na onkoprotein adenoviru E1B-55kDa. Může hrát důležitou roli v transportu nukleocytoplazmatických RNA a jeho funkce je modulována E1B-55kDa v buňkách infikovaných adenovirem. HNRPUL1 se také účastní signálních drah proteinkinázy ATR během adenovirové infekce. Pro tento gen byly nalezeny dvě varianty transkriptu kódující různé izoformy. Byly také nalezeny další varianty, ale jejich celovečerní povaha nebyla stanovena.^[7]

Interakce

HNRPUL1 bylo prokázáno komunikovat s BRD7^[6] a PRMT2.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105323 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040725 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Gabler S, Schutt H, Groitl P, Wolf H, Shenk T, Dobner T (říjen 1998). „Protein asociovaný s 55 kilodaltony E1B: buněčný protein s vazebnou aktivitou pro RNA zapojený do nukleocytoplazmatického transportu adenoviru a buněčných mRNA“. J Virol. 72 (10): 7960–71. doi:10.1128 / JVI.72.10.7960-7971.1998. PMC 110131. PMID 9733834.
^ ^A ^b Kzhyshkowska J, Rusch A, Wolf H, Dobner T (duben 2003). „Regulace transkripce heterogenním jaderným ribonukleoproteinem E1B-AP5 je zprostředkována tvorbou komplexu s novým proteinem BRD7 obsahujícím bromodoménu“. Biochem J.. 371 (Pt 2): 385–93. doi:10.1042 / BJ20021281. PMC 1223277. PMID 12489984.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HNRPUL1 heterogenní jaderný ribonukleoprotein podobný U“.
^ Kzhyshkowska, J; Schütt H; Liss M; Kremmer E; Stauber R; Vlk H; Dobner T (září 2001). „Heterogenní jaderný ribonukleoprotein E1B-AP5 je methylován ve svém boxu Arg-Gly-Gly (RGG) a interaguje s lidskou argininmethyltransferázou HRMT1L1“. Biochem. J. 358 (Pt 2): 305–14. doi:10.1042/0264-6021:3580305. ISSN 0264-6021. PMC 1222062. PMID 11513728.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Bachi A, Braun IC, Rodrigues JP a kol. (2000). „C-koncová doména TAP interaguje s komplexem jaderných pórů a podporuje export specifických substrátů RNA nesoucích CTE“. RNA. 6 (1): 136–58. doi:10.1017 / S1355838200991994. PMC 1369901. PMID 10668806.
Herold A, Suyama M, Rodrigues JP a kol. (2000). „TAP (NXF1) patří do multigenní rodiny domnělých faktorů exportu RNA se zachovanou modulární architekturou“. Mol. Buňka. Biol. 20 (23): 8996–9008. doi:10.1128 / MCB.20.23.8996-9008.2000. PMC 86553. PMID 11073998.
Kzhyshkowska J, Schütt H, Liss M a kol. (2001). „Heterogenní jaderný ribonukleoprotein E1B-AP5 je methylován ve svém boxu Arg-Gly-Gly (RGG) a interaguje s lidskou argininmethyltransferázou HRMT1L1“. Biochem. J. 358 (Pt 2): 305–14. doi:10.1042/0264-6021:3580305. PMC 1222062. PMID 11513728.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Brill LM, Salomon AR, Ficarro SB a kol. (2004). „Robustní fosfoproteomické profilování míst fosforylace tyrosinu z lidských T buněk pomocí imobilizované kovové afinitní chromatografie a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Anální. Chem. 76 (10): 2763–72. doi:10.1021 / ac035352d. PMID 15144186.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomické mapování lidské signální dráhy". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Kzhyshkowska J, Kremmer E, Hofmann M, et al. (2005). "Methylace proteinu a argininu během infekce lytickým adenovirem". Biochem. J. 383 (Pt 2): 259–65. doi:10.1042 / BJ20040210. PMC 1134066. PMID 15242333.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Barral PM, Rusch A, Turnell AS a kol. (2005). "Interakce člena rodiny hnRNP E1B-AP5 s p53". FEBS Lett. 579 (13): 2752–8. doi:10.1016 / j.febslet.2005.03.095. PMID 15907477. S2CID 28875660.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M a kol. (2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. PMID 16169070.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. Bibcode:2005 Natur.437.1173R. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Shiffman D, Rowland CM, Louie JZ a kol. (2006). „Genové varianty VAMP8 a HNRPUL1 jsou spojeny s časným nástupem infarktu myokardu“. Arterioskler. Tromb. Vasc. Biol. 26 (7): 1613–8. doi:10.1161 / 01.ATV.0000226543.77214.e4. PMID 16690874.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Kollers S, Musilova P, Rubes J, Rocha D (2007). "Srovnávací mapování odhaluje mnohonásobné přeskupení mezi prasatovým chromozomem 6 a lidským 19q13". Anim. Genet. 37 (6): 595–6. doi:10.1111 / j.1365-2052.2006.01516.x. PMID 17121608.

Tento článek o gen na lidský chromozom 19 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000105323 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000040725 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9733834-5] Gabler S, Schutt H, Groitl P, Wolf H, Shenk T, Dobner T (říjen 1998). „Protein asociovaný s 55 kilodaltony E1B: buněčný protein s vazebnou aktivitou pro RNA zapojený do nukleocytoplazmatického transportu adenoviru a buněčných mRNA“. J Virol. 72 (10): 7960–71. doi:10.1128 / JVI.72.10.7960-7971.1998. PMC 110131. PMID 9733834.

[pmid12489984-6] A ^b Kzhyshkowska J, Rusch A, Wolf H, Dobner T (duben 2003). „Regulace transkripce heterogenním jaderným ribonukleoproteinem E1B-AP5 je zprostředkována tvorbou komplexu s novým proteinem BRD7 obsahujícím bromodoménu“. Biochem J.. 371 (Pt 2): 385–93. doi:10.1042 / BJ20021281. PMC 1223277. PMID 12489984.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: HNRPUL1 heterogenní jaderný ribonukleoprotein podobný U“.

[pmid11513728-8] Kzhyshkowska, J; Schütt H; Liss M; Kremmer E; Stauber R; Vlk H; Dobner T (září 2001). „Heterogenní jaderný ribonukleoprotein E1B-AP5 je methylován ve svém boxu Arg-Gly-Gly (RGG) a interaguje s lidskou argininmethyltransferázou HRMT1L1“. Biochem. J. 358 (Pt 2): 305–14. doi:10.1042/0264-6021:3580305. ISSN 0264-6021. PMC 1222062. PMID 11513728.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]