Přepis spojený s HLA-B 3 - HLA-B associated transcript 3

BAG6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1WX9, 4DWF, 4EEW, 4WWR, 4X86, 2N9P
Identifikátory
Aliasy	BAG6, BAG-6, BAT3, D6S52E, G3, transkript 3 asociovaný s HLA-B, athanogen asociovaný s BCL2 6, kochaperon BAG 6
Externí ID	OMIM: 142590 MGI: 1919439 HomoloGene: 3409 Genové karty: BAG6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	31,652,705 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	35,147,322 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba ribozomu; • špatně složená vazba na bílkoviny; • Vazba na protein Hsp70; • vázání proteinu závislé na modifikaci polyubikvitinu; • vazba proteazomu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba na proteázu specifickou pro ubikvitin; • vazba ubikvitinové proteinové ligázy; • vazba na receptory; • identická vazba na protein;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • membrána; • intracelulární membránou vázaná organela; • nukleoplazma; • Komplex BAT3; • buněčné jádro; • extracelulární oblast; • extracelulární exosom;
Biologický proces	• regulace apoptotického procesu; • negativní regulace proteolýzy; • vnitřní apoptotická signální cesta v reakci na poškození DNA mediátorem třídy p53; • diferenciace buněk; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • vývoj ledvin; • vývoj embryí; • vývoj plic; • proces imunitního systému; • pozitivní regulace dráhy ERAD; • stabilizace bílkovin; • negativní regulace apoptotického procesu; • interní acetylace peptidyl-lysinu; • vývoj mozku; • vnitřní apoptotická signální dráha v reakci na stres endoplazmatického retikula; • regulace buněčné proliferace; • synaptonemální komplexní sestava; • spermatogeneze; • negativní regulace katabolického procesu proteinu závislého na proteinu ubikvitinu; • lokalizace proteinu do komplexu cytosolického proteazomu zapojeného do dráhy ERAD; • udržování rozloženého proteinu zapojeného do dráhy ERAD; • inzerce membránového proteinu zakotveného ocasem do membrány ER; • kovalentní modifikace chromatinu; • Špatně složený proteinový katabolický proces spojený s ER; • signální dráha receptoru buněčného povrchu aktivující imunitní odpověď; • apoptotický proces; • aktivace přirozených zabijáckých buněk; • proteazomální proteinový katabolický proces; • cesta ERAD závislá na ubikvitinu; • preventivní kontrola kvality vyvolaná stresem vyvolaná endoplazmatickým retikulem; • doprava; • organizace chromatinu; • proteazomem zprostředkovaný katabolický proces proteinu závislý na ubikvitinu; • regulace embryonálního vývoje;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	7917
	224727
ENSG00000204463; ENSG00000228760; ENSG00000234651; ENSG00000229524; ENSG00000096155;
	ENSG00000227761; ENSG00000233348
	ENSMUSG00000024392
	P46379
	Q9Z1R2
NM_001098534; NM_001199697; NM_001199698; NM_004639; NM_080702;
	NM_080703
	NM_001252468; NM_001252469; NM_057171
	NP_001092004; NP_001186626; NP_001186627; NP_542433; NP_542434
NP_001239397; NP_001239398; NP_476512; NP_001359189; NP_001359190;
	NP_001359191; NP_001359194; NP_001359195; NP_001359196; NP_001359197; NP_001359198; NP_001359199; NP_001359200; NP_001359201; NP_001359202; NP_001359203; NP_001359204; NP_001359205; NP_001359206; NP_001359207; NP_001359208; NP_001359209; NP_001359210; NP_001359211; NP_001359212; NP_001359213; NP_001359214; NP_001359215; NP_001359216; NP_001359217; NP_001359218; NP_001359219; NP_001359220
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Velký protein BAT3 bohatý na prolin je protein že u lidí je kódován BAT3 gen.^[5]^[6]

A shluk genů, BAT1-BAT5, byl lokalizován v blízkosti genů pro TNF alfa a TNF beta. Všechny tyto geny jsou uvnitř člověka hlavní komplex histokompatibility region třídy III. Protein kódovaný tímto genem je a jaderný protein. Zapojilo se to do kontroly apoptóza a regulační protein tepelného šoku. Existují tři alternativně spojené varianty přepisu popsáno pro tento gen.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000228760, ENSG00000234651, ENSG00000229524, ENSG00000096155, ENSG00000227761, ENSG00000233348 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000204463, ENSG00000228760, ENSG00000234651, EN00000234651, EN00000234651, EN00000234651, EN00 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024392 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Banerji J, Sands J, Strominger JL, Spies T (duben 1990). „Genový pár z lidského hlavního histokompatibilního komplexu kóduje velké proteiny bohaté na prolin s více opakovanými motivy a jednou doménou podobnou ubikvitinu“. Proc Natl Acad Sci U S A. 87 (6): 2374–8. Bibcode:1990PNAS ... 87.2374B. doi:10.1073 / pnas.87.6.2374. PMC 53689. PMID 2156268.
^ ^A ^b „Entrez Gene: BAT3 HLA-B associated transkript 3“.

Další čtení

Takayama S, Reed JC (2001). "Cílení a regulace molekulárních chaperonů pomocí proteinů rodiny BAG". Nat. Cell Biol. 3 (10): E237–41. doi:10.1038 / ncb1001-e237. PMID 11584289. S2CID 24466133.
Cross SJ, Tonks S, Trowsdale J, Campbell RD (1992). "Nová detekce polymorfismů délky restrikčních fragmentů v lidském hlavním histokompatibilním komplexu". Imunogenetika. 34 (6): 376–84. doi:10.1007 / BF01787488. PMID 1684176. S2CID 29262131.
Spies T, Bresnahan M, Strominger JL (1989). „Hlavní lidský histokompatibilní komplex obsahuje minimálně 19 genů mezi shlukem komplementu a HLA-B“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 86 (22): 8955–8. Bibcode:1989PNAS ... 86,8955S. doi:10.1073 / pnas.86.22.8955. PMC 298409. PMID 2813433.
Spies T, Blanck G, Bresnahan M a kol. (1989). "Nová shluk genů v lidském hlavním histokompatibilním komplexu". Věda. 243 (4888): 214–7. Bibcode:1989Sci ... 243..214S. doi:10.1126 / science.2911734. PMID 2911734.
Ozaki T, Hanaoka E, Naka M a kol. (1999). "Klonování a charakterizace krysí BAT3 cDNA". DNA Cell Biol. 18 (6): 503–12. doi:10.1089/104454999315222. PMID 10390159.
Thress K, Song J, Morimoto RI, Kornbluth S (2001). „Reverzibilní inhibice chaperonové funkce Hsp70 pomocí Scythe a Reaper“. EMBO J.. 20 (5): 1033–41. doi:10.1093 / emboj / 20.5.1033. PMC 145500. PMID 11230127.
Manchen ST, Hubberstey AV (2001). „Human Scythe obsahuje funkční nukleární lokalizační sekvenci a zůstává v jádře během apoptózy vyvolané staurosporinem“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 287 (5): 1075–82. doi:10.1006 / bbrc.2001.5701. PMID 11587531.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Xie T, Rowen L, Aguado B a kol. (2004). „Analýza genově hustého hlavního histokompatibilního komplexního regionu třídy III a jeho srovnání s myší“. Genome Res. 13 (12): 2621–36. doi:10,1101 / gr. 1736803. PMC 403804. PMID 14656967.
Lehner B, Semple JI, Brown SE a kol. (2004). „Analýza vysoce výkonného kvasinkového dvouhybridního systému a jeho použití k predikci funkce intracelulárních proteinů kódovaných v humánní oblasti MHC třídy III“. Genomika. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
Wu YH, Shih SF, Lin JY (2004). „Ricin spouští apoptotické morfologické změny štěpením BAT3 kaspázou-3“. J. Biol. Chem. 279 (18): 19264–75. doi:10,1074 / jbc.M307049200. PMID 14960581.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomika mapující cestu lidské signalizace". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Kumar R, Lutz W, Frank E, Im HJ (2004). „Okamžitý časný gen X-1 interaguje s proteiny, které modulují apoptózu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 323 (4): 1293–8. doi:10.1016 / j.bbrc.2004.09.006. PMC 2895269. PMID 15451437.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Stelzl U, Worm U, Lalowski M a kol. (2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. hdl:11858 / 00-001M-0000-0010-8592-0. PMID 16169070. S2CID 8235923.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000228760, ENSG00000234651, ENSG00000229524, ENSG00000096155, ENSG00000227761, ENSG00000233348 GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000204463, ENSG00000228760, ENSG00000234651, EN00000234651, EN00000234651, EN00000234651, EN00 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024392 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid2156268-5] Banerji J, Sands J, Strominger JL, Spies T (duben 1990). „Genový pár z lidského hlavního histokompatibilního komplexu kóduje velké proteiny bohaté na prolin s více opakovanými motivy a jednou doménou podobnou ubikvitinu“. Proc Natl Acad Sci U S A. 87 (6): 2374–8. Bibcode:1990PNAS ... 87.2374B. doi:10.1073 / pnas.87.6.2374. PMC 53689. PMID 2156268.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: BAT3 HLA-B associated transkript 3“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]