HIST4H4 - HIST4H4

H4-16
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4H9O, 3 WKJ, 3AYW, 3WA9, 5B0Z, 5AVB, 2CV5, 5AV5, 3AV2, 3 WTP, 3AV1, 3AZK, 3X1V, 5AV8, 1F66, 4QUU, 3CFS, 4YYK, 4QUT, 3NQJ, 3A6N, 3W99, 5AVC, 2RS9, 3F9Z, 3QZT, 3QBY, 3W97, 4M38, 4RM6, 3CFV, 4HGA, 1EQZ, 2RJE, 3QZV, 1HQ3, 4H9P, 3AZL, 3AFA, 1TZY, 3UVY, 5 CPK, 3JPX, 4U9W, 4N3W, 4YYJ, 4RR, 4H9N, 4H9R, 3AZI, 4LD9, 3UVX, 3AZH, 5BNX, 4N4F, 1U35, 4YYG, 3O36, 2ARO, 5AV9, 4H9S, 3AZF, 3W98, 4GQB, 4H9Q, 5BNV, 3WAA, 3AZG, 3AZE, 2RNY, 1 ZKK, 2QQS, 2LVM, 3X1T, 3AN2, 2 KWO, 3QZS, 3F9W, 5FFW, 5CPJ, 3F9X, 3IJ1, 4RM5, 3AZJ, 4RR6, 3AZN, 2IG0, 4YYH, 4RRR, 5CPI, 3W96, 3R45, 2 KWN, 3F9Y, 5AV6, 3AZM, 5BO0, 3X1S, 4QYD, 4KGC, 3UVW, 4YYN, 3X1U, 3UW9, 2F8N, 3NQU, 5B0Y, 4RRM, 5C3I, 4Z5T, 5B24, 5FA5, 4Z2M, 5E5A, 5FWE, 5B2I, 5B40, 5B2J, 5JA4, 5AY8, 4ZUX
Identifikátory
Aliasy	H4-16, H4 / p, histonová klastr 4, H4, histonová klastr 4 H4, HIST4H4, H4 histon 16, H4C5, H4C4, H4C9, H4C12, H4C3, H4C13, H4C11, H4C1, H4C14, H4C15, H4C8, H4C6, H4C2
Externí ID	OMIM: 615069 MGI: 2448432 HomoloGene: 134468 Genové karty: H4-16
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	14,771,131 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• specifické vazby na proteinovou doménu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita heterodimerizace proteinu; • Vazba DNA; • histonová vazba; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• membrána; • chromozóm; • nukleoplazma; • extracelulární oblast; • nukleární chromozom; • nukleosom; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • extracelulární matrix; • nukleární nukleosom; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• organizace telomer; • buněčný proteinový metabolický proces; • pozitivní regulace genové exprese, epigenetická; • heterotetramerizace proteinů; • negativní regulace diferenciace megakaryocytů; • Sestava nukleosomů obsahující CENP-A; • Sestavení nukleosomů závislé na replikaci DNA; • umlčování chromatinu při rDNA; • negativní regulace genové exprese, epigenetická; • Transkripce s templátem DNA, iniciace; • Sestava nukleosomů nezávislá na replikaci; • oprava dvouvláknového zlomu pomocí nehomologního spojování konců; • komplexní sestava beta-katenin-TCF; • omezení telomer; • shromáždění nukleosomů; • regulace umlčování genů miRNA; • regulace diferenciace megakaryocytů; • regulace diferenciace hematopoetických kmenových buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	121504
	319158
	ENSG00000197837
	n / a
	P62805
	P62806
	NM_175054
	NM_175656
NP_003537; NP_003486; NP_003535; NP_003539; NP_003531;
	NP_003536
NP_783585; NP_783588; NP_835583; NP_783583; NP_835499;
	NP_835500; NP_291074; NP_783586; NP_694813; NP_835515; NP_783587; NP_835582; NP_001182350
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Histon H4 je protein že u lidí je kódován HIST4H4 gen.^[4]

Histony jsou základní jaderné proteiny, které jsou odpovědné za strukturu nukleosomů chromozomálního vlákna eukaryoty. Nukleosomy sestávají z přibližně 146 bp DNA obalené kolem histonového oktameru složeného z párů každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3 a H4). Chromatinové vlákno je dále zhutňováno prostřednictvím interakce spojovacího histonu H1 s DNA mezi nukleosomy za vzniku chromatinových struktur vyššího řádu. Tento gen je intronless a kóduje člena rodiny histonů H4. Transkripty z tohoto genu postrádají polyA ocasy; místo toho obsahují palindromický ukončovací prvek.^[5]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000197837 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ „Entrez Gene: HIST4H4 histonová klastr 4, H4“.

Další čtení

Pauli U, Chrysogelos S, Stein G a kol. (1987). „Interakce protein-DNA in vivo proti proudu od lidského genu histonu H4 regulovaného buněčným cyklem“. Věda. 236 (4806): 1308–11. doi:10.1126 / science.3035717. PMID 3035717.
Borowski P, Heiland M, Oehlmann K, et al. (1996). „Nestrukturální protein 3 viru hepatitidy C inhibuje fosforylaci zprostředkovanou proteinkinázou závislou na cAMP“. Eur. J. Biochem. 237 (3): 611–8. doi:10.1111 / j.1432-1033.1996.0611p.x. PMID 8647104.
El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Zhang Y, Sun ZW, Iratni R a kol. (1998). „SAP30, nový protein konzervovaný mezi člověkem a kvasinkami, je součástí komplexu histon-deacetylázy“. Mol. Buňka. 1 (7): 1021–31. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80102-1. PMID 9651585.
Carrier F, Georgel PT, Pourquier P a kol. (1999). „Gadd45, stresový protein reagující na p53, upravuje dostupnost DNA na poškozeném chromatinu“. Mol. Buňka. Biol. 19 (3): 1673–85. doi:10.1128 / MCB.19.3.1673. PMC 83961. PMID 10022855.
Buggy JJ, Sideris ML, Mak P a kol. (2001). „Klonování a charakterizace nové lidské histonové deacetylázy, HDAC8“. Biochem. J. 350 (1): 199–205. doi:10.1042/0264-6021:3500199. PMC 1221242. PMID 10926844.
Deng L, de la Fuente C, Fu P a kol. (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na hlavní histony“. Virologie. 277 (2): 278–95. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Chadwick BP, Willard HF (2001). „Nový chromatinový protein, který je vzdáleně příbuzný histonu H2a, je z neaktivního X chromozomu značně vyloučen“. J. Cell Biol. 152 (2): 375–84. doi:10.1083 / jcb.152.2.375. PMC 2199617. PMID 11266453.
Kovalsky O, Lung FD, Roller PP, Fornace AJ (2001). „Oligomerizace lidského proteinu Gadd45a“. J. Biol. Chem. 276 (42): 39330–9. doi:10,1074 / jbc.M105115200. PMID 11498536.
Deng L, Wang D, de la Fuente C a kol. (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–26. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Lahn BT, Tang ZL, Zhou J a kol. (2002). „Dříve necharakterizované histonové acetyltransferázy podílející se na spermatogenezi savců“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (13): 8707–12. doi:10.1073 / pnas.082248899. PMC 124363. PMID 12072557.
Ono S, Oue N, Kuniyasu H a kol. (2003). „Acetylovaný histon H4 je redukován v lidských žaludečních adenomech a karcinomech.“ J. Exp. Clin. Cancer Res. 21 (3): 377–82. PMID 12385581.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Kzhyshkowska J, Rusch A, Wolf H, Dobner T (2003). „Regulace transkripce heterogenním jaderným ribonukleoproteinem E1B-AP5 je zprostředkována tvorbou komplexu s novým proteinem BRD7 obsahujícím bromodoménu“. Biochem. J. 371 (Pt 2): 385–93. doi:10.1042 / BJ20021281. PMC 1223277. PMID 12489984.
Fujita K, Shimazaki N, Ohta Y a kol. (2004). „Terminální deoxynukleotidyltransferáza tvoří ternární komplex s novým proteinem pro remodelaci chromatinu s 82 kDa a jádrovým histonem“. Geny buňky. 8 (6): 559–71. doi:10.1046 / j.1365-2443.2003.00656.x. PMID 12786946. S2CID 25223336.
Shiio Y, Eisenman RN (2004). „Sumonizace histonu je spojena s transkripční represí“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 100 (23): 13225–30. doi:10.1073 / pnas.1735528100. PMC 263760. PMID 14578449.
Coleman MA, Miller KA, Beernink PT a kol. (2004). "Identifikace proteinových interakcí souvisejících s chromatinem pomocí proteinových čipů". Proteomika. 3 (11): 2101–7. doi:10.1002 / pmic.200300593. PMID 14595808. S2CID 23471253.
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). „Regulace exprese genu HIV-1 acetylací histonu a nábor faktorů u promotoru LTR“. EMBO J.. 22 (24): 6550–61. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.
Kanno T, Kanno Y, Siegel RM a kol. (2004). "Selektivní rozpoznávání acetylovaných histonů proteiny bromodomény vizualizované v živých buňkách". Mol. Buňka. 13 (1): 33–43. doi:10.1016 / S1097-2765 (03) 00482-9. PMID 14731392.

Tento protein související článek je a pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000197837 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12408966-4] Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.

[entrez-5] „Entrez Gene: HIST4H4 histonová klastr 4, H4“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]