HIST1H2BJ - HIST1H2BJ - Wikipedia

H2BC11
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3A6N, 3AFA, 3AN2, 3AV1, 3AV2, 3AYW, 3AZE, 3AZF, 3AZG, 3AZH, 3AZI, 3AZJ, 3AZK, 3AZL, 3AZM, 3AZN, 3W96, 3W97, 3W98, 3W99, 3WA9, 3WAA, 3 WTP, 4CAY, 5CPJ, 5B0Z, 4RM5, 5AV9, 5AVB, 5AV5, 4RM6, 5CPI, 5AV6, 5AV8, 5 CPK, 5AVC, 5B0Y, 4Z5T, 5FUG, 5B24, 2RVQ, 5AY8, 5B2I, 5B40, 5B2J
Identifikátory
Aliasy	H2BC11, H2B / r, H2BFR, H2BJ, histonová klastr 1, H2bj, histonová klastr 1 Člen rodiny H2B j, H2B klastrovaný histon 11, HIST1H2BJ
Externí ID	OMIM: 615044 MGI: 2448415 HomoloGene: 128594 Genové karty: H2BC11
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	27,132,750 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	96,223,738 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita heterodimerizace proteinu; • Vazba DNA; • vázání lipopolysacharidů; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• nukleosom; • buněčné jádro; • chromozóm; • nukleoplazma; • extracelulární; • cytosol; • buněčná membrána;
Biologický proces	• shromáždění nukleosomů; • vrozená imunitní odpověď na sliznici; • obranná reakce na bakterii; • ubikvitinace bílkovin; • negativní regulace signální dráhy zprostředkované faktorem nekrózy nádorů; • antimikrobiální humorální imunitní odpověď zprostředkovaná antimikrobiálním peptidem;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8970
	319190
	ENSG00000124635
	ENSMUSG00000068854
	P06899
	Q64524
	NM_021058
	NM_178214
	NP_066402
	NP_835586
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Histon H2B typ 1-J je protein že u lidí je kódován HIST1H2BJ gen.^[5]^[6]^[7]

Histony jsou základní jaderné proteiny, které jsou odpovědné za strukturu nukleosomů chromozomálních vláken u eukaryot. Dvě molekuly každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3 a H4) tvoří oktamer, kolem kterého je přibližně 146 bp DNA zabaleno do opakujících se jednotek, nazývaných nukleosomy. Linkonový histon, H1, interaguje s linkerovou DNA mezi nukleosomy a funguje při zhutňování chromatinu do struktur vyššího řádu. Tento gen je intronless a kóduje člena rodiny histonů H2B. Transkripty z tohoto genu postrádají polyA ocasy, ale místo toho obsahují palindromický terminační prvek. Tento gen se nachází v histonovém mikroklastru na chromozomu 6p21.33.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124635 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000068854 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zhong R, Roeder RG, Heintz N (leden 1984). „Primární struktura a exprese čtyř klonovaných lidských histonových genů“. Nucleic Acids Res. 11 (21): 7409–7425. doi:10.1093 / nar / 11.21.7409. PMC 326492. PMID 6647026.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–498. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIST1H2BJ histon cluster 1, H2bj“.

Další čtení

Alnemri ES, Litwack G (1989). „Glykokortikoidy indukovaná lymfocytóza není zprostředkována indukovanou endonukleázou“. J. Biol. Chem. 264 (7): 4104–11. PMID 2917990.
Frohm M, Gunne H, Bergman AC a kol. (1996). „Biochemická a antibakteriální analýza lidských ran a puchýřků“. Eur. J. Biochem. 237 (1): 86–92. doi:10.1111 / j.1432-1033.1996.0086n.x. PMID 8620898.
Albig W, Doenecke D (1998). "Lidský histonový genový klastr na lokusu D6S105". Hučení. Genet. 101 (3): 284–294. doi:10,1007 / s004390050630. PMID 9439656. S2CID 38539096.
El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Albig W, Trappe R, Kardalinou E a kol. (1999). "Komplement lidského genu pro H2A a H2B histon". Biol. Chem. 380 (1): 7–18. doi:10.1515 / BC.1999.002. PMID 10064132. S2CID 12807248.
Ahn J, Gruen JR (1999). "Genomická organizace histonových shluků na lidském 6p21.3". Mamm. Genom. 10 (7): 768–770. doi:10,1007 / s003359901089. PMID 10384058. S2CID 28275496.
Deng L, de la Fuente C, Fu P a kol. (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na hlavní histony“. Virologie. 277 (2): 278–295. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Deng L, Wang D, de la Fuente C a kol. (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–326. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Galasinski SC, Louie DF, Gloour KK a kol. (2002). „Globální regulace posttranslačních modifikací hlavních histonů“. J. Biol. Chem. 277 (4): 2579–2588. doi:10,1074 / jbc.M107894200. PMID 11709551.
Weinmann AS, Yan PS, Oberley MJ a kol. (2002). „Izolace cílů lidského transkripčního faktoru spojením imunoprecipitace chromatinu a analýzy mikročipů ostrova CpG“. Genes Dev. 16 (2): 235–244. doi:10,1101 / gad.943102. PMC 155318. PMID 11799066.
Kim HS, Cho JH, Park HW a kol. (2002). "Endotoxin neutralizující antimikrobiální proteiny lidské placenty". J. Immunol. 168 (5): 2356–64. doi:10,4049 / jimmunol.168.5.2356. PMID 11859126.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–16903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Giampuzzi M, Oleggini R, Di Donato A (2003). „Demonstrace in vitro interakce mezi tumor supresorovou lysyl oxidázou a histony H1 a H2: definice zúčastněných oblastí“. Biochim. Biophys. Acta. 1647 (1–2): 245–51. doi:10.1016 / s1570-9639 (03) 00059-1. PMID 12686141.
Cheung WL, Ajiro K, Samejima K a kol. (2003). „Apoptotická fosforylace histonu H2B je zprostředkována sterilní dvacetinovou kinázou savců“. Buňka. 113 (4): 507–517. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00355-6. PMID 12757711. S2CID 21854.
Tollin M, Bergman P, Svenberg T a kol. (2004). "Antimikrobiální peptidy v obraně první linie lidské sliznice tlustého střeva". Peptidy. 24 (4): 523–530. doi:10.1016 / S0196-9781 (03) 00114-1. PMID 12860195. S2CID 7435936.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–811. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). „Regulace exprese genu HIV-1 acetylací histonu a nábor faktorů u promotoru LTR“. EMBO J.. 22 (24): 6550–6561. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.
Howell SJ, Wilk D, Yadav SP, Bevins CL (2004). "Antimikrobiální polypeptidy lidského epitelu tlustého střeva". Peptidy. 24 (11): 1763–1770. doi:10.1016 / j.peptides.2003.07.028. PMID 15019208. S2CID 28953527.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000124635 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000068854 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid6647026-5] Zhong R, Roeder RG, Heintz N (leden 1984). „Primární struktura a exprese čtyř klonovaných lidských histonových genů“. Nucleic Acids Res. 11 (21): 7409–7425. doi:10.1093 / nar / 11.21.7409. PMC 326492. PMID 6647026.

[pmid12408966-6] Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–498. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: HIST1H2BJ histon cluster 1, H2bj“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]