HIST1H2BB - HIST1H2BB

H2BC3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3X1S, 3X1U
Identifikátory
Aliasy	H2BC3, H2B.1, H2B / f, H2BFF, histonová klastr 1, H2bb, histonová klastr 1 člen rodiny H2B b, HIST1H2BB, H2B klastrovaný histon 3
Externí ID	OMIM: 602803 MGI: 2448377 HomoloGene: 137348 Genové karty: H2BC3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	26,043,657 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	23,747,241 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita heterodimerizace proteinu; • Vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• nukleosom; • buněčné jádro; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • chromozóm; • nukleoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• shromáždění nukleosomů; • ubikvitinace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3018
	319178
	ENSG00000276410
	ENSMUSG00000075031
	P33778
	Q64475
	NM_021062
	NM_175664
	NP_066406
	NP_783595
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Histon H2B typ 1-B je protein že u lidí je kódován HIST1H2BB gen.^[5]^[6]^[7]

Histony jsou základní jaderné proteiny, které jsou odpovědné za strukturu nukleosomů chromozomálních vláken u eukaryot. Nukleosomy sestávají z přibližně 146 bp DNA obalené kolem histonového oktameru složeného z párů každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3 a H4). Chromatinové vlákno se dále zhutňuje prostřednictvím interakce linkeru histonu H1 s DNA mezi nukleosomy za vzniku chromatinových struktur vyššího řádu. Tento gen je intronless a kóduje člena rodiny histonů H2B. V přepisech z tohoto genu chybí polyA ocasy; místo toho obsahují palindromický ukončovací prvek. Tento gen se nachází ve velkém klastru histonových genů na chromozomu 6p22-p21.3.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000276410 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000075031 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kardalinou E, Eick S, Albig W, Doenecke D (prosinec 1993). „Sdružení lidského genu histonu H1 s pseudogenem H2A a geny kódujícími histony H2B.1 a H3.1“. J Cell Biochem. 52 (4): 375–83. doi:10.1002 / jcb.240520402. PMID 8227173. S2CID 42454232.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIST1H2BB histonová klastr 1, H2bb“.

Další čtení

Albig W, Kardalinou E, Drabent B a kol. (1991). "Izolace a charakterizace dvou lidských H1 histonových genů v klastrech hlavních histonových genů". Genomika. 10 (4): 940–8. doi:10.1016 / 0888-7543 (91) 90183-F. PMID 1916825.
Albig W, Kioschis P, Poustka A a kol. (1997). "Organizace genu pro lidský histon: neregulérní uspořádání ve velkém klastru". Genomika. 40 (2): 314–22. doi:10.1006 / geno.1996.4592. PMID 9119399.
Albig W, Doenecke D (1998). "Lidský histonový genový klastr na lokusu D6S105". Hučení. Genet. 101 (3): 284–94. doi:10,1007 / s004390050630. PMID 9439656. S2CID 38539096.
El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Deng L, de la Fuente C, Fu P a kol. (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na hlavní histony“. Virologie. 277 (2): 278–95. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Deng L, Wang D, de la Fuente C a kol. (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–26. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Galasinski SC, Louie DF, Gloour KK a kol. (2002). „Globální regulace posttranslačních modifikací hlavních histonů“. J. Biol. Chem. 277 (4): 2579–88. doi:10,1074 / jbc.M107894200. PMID 11709551.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Cheung WL, Ajiro K, Samejima K a kol. (2003). „Apoptotická fosforylace histonu H2B je zprostředkována sterilní dvacetinovou kinázou savců“. Buňka. 113 (4): 507–17. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00355-6. PMID 12757711. S2CID 21854.
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). „Regulace exprese genu HIV-1 acetylací histonu a nábor faktorů u promotoru LTR“. EMBO J.. 22 (24): 6550–61. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.
Citterio E, Papait R, Nicassio F a kol. (2004). „Np95 je protein vázající histon vybavený aktivitou ubikvitin ligázy“. Mol. Buňka. Biol. 24 (6): 2526–35. doi:10.1128 / MCB.24.6.2526-2535.2004. PMC 355858. PMID 14993289.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Golebiowski F, Kasprzak KS (2007). „Inhibice acetylace jádrových histonů karcinogenním niklem (II)“. Mol. Buňka. Biochem. 279 (1–2): 133–9. doi:10.1007 / s11010-005-8285-1. PMID 16283522. S2CID 25071586.
Zhu B, Zheng Y, Pham AD a kol. (2006). „Monoubikvitinace lidského histonu H2B: zúčastněné faktory a jejich role v regulaci genu HOX“. Mol. Buňka. 20 (4): 601–11. doi:10.1016 / j.molcel.2005.09.025. PMID 16307923.
Bonenfant D, Coulot M, Towbin H a kol. (2006). „Charakterizace variant histonu H2A a H2B a jejich posttranslační úpravy hmotnostní spektrometrií“. Mol. Buňka. Proteomika. 5 (3): 541–52. doi:10,1074 / mcp.M500288-MCP200. PMID 16319397.
Pavri R, Zhu B, Li G a kol. (2006). „Histon H2B monoubikvitinace funguje kooperativně s FACT k regulaci prodloužení pomocí RNA polymerázy II“. Buňka. 125 (4): 703–17. doi:10.1016 / j.cell.2006.04.029. PMID 16713563. S2CID 2614680.
Kim SC, Sprung R, Chen Y a kol. (2006). „Substrátová a funkční rozmanitost acetylace lysinu odhalena proteomickým průzkumem“. Mol. Buňka. 23 (4): 607–18. doi:10.1016 / j.molcel.2006.06.026. PMID 16916647.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000276410 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000075031 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8227173-5] Kardalinou E, Eick S, Albig W, Doenecke D (prosinec 1993). „Sdružení lidského genu histonu H1 s pseudogenem H2A a geny kódujícími histony H2B.1 a H3.1“. J Cell Biochem. 52 (4): 375–83. doi:10.1002 / jcb.240520402. PMID 8227173. S2CID 42454232.

[pmid12408966-6] Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: HIST1H2BB histonová klastr 1, H2bb“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]