HIST1H2BA - HIST1H2BA

H2BC1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3 WKJ
Identifikátory
Aliasy	H2BC1, H2BFU, STBP, TSH2B, TSH2B.1, bA317E16.3, TH2B, histonová klastr 1, H2ba, histonová klastr 1 Člen rodiny H2B a, hTSH2B, HIST1H2BA, H2B klastrovaný histon 1
Externí ID	OMIM: 609904 MGI: 2448375 HomoloGene: 69356 Genové karty: H2BC1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	25,727,292 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita heterodimerizace proteinu; • Vazba DNA; • histonová vazba; • molekulární funkce;
Buněčná složka	• nukleosom; • vnější složka plazmatické membrány; • buněčné jádro; • jaderný chromozom, telomerická oblast; • chromozóm; • nukleoplazma; • nukleární nukleosom; • DNA obalový komplex;
Biologický proces	• migrace mononukleárních buněk; • shromáždění nukleosomů; • pozitivní regulace vazby; • demontáž nukleosomu; • aktivace plazminogenu; • zánětlivá reakce; • spermatogeneze, výměna chromozomálních proteinů; • organizace chromatinu; • ubikvitinace bílkovin; • DNA balení;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	255626
	319177
	ENSG00000146047
	n / a
	Q96A08
	P70696
	NM_170610
	NM_175663
	NP_733759
	NP_783594
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Histon H2B typ 1-A je protein že u lidí je kódován HIST1H2BA gen.^[4]^[5]^[6]

Histony jsou základní jaderné proteiny, které jsou odpovědné za strukturu nukleosomů chromozomálních vláken u eukaryot. Nukleosomy sestávají z přibližně 146 bp DNA obalené kolem histonového oktameru složeného z párů každého ze čtyř hlavních histonů (H2A, H2B, H3 a H4). Chromatinové vlákno se dále zhutňuje prostřednictvím interakce linkeru histonu H1 s DNA mezi nukleosomy za vzniku chromatinových struktur vyššího řádu. Tento gen je intronless a kóduje varlata / spermie specifického člena rodiny histonů H2B. Transkripty z tohoto genu obsahují palindromický terminační prvek.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000146047 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.
^ Zalensky AO, Siino JS, Gineitis AA, Zalenskaya IA, Tomilin NV, Yau P, Bradbury EM (listopad 2002). "Lidský varle / spermie specifický histon H2B (hTSH2B). Molekulární klonování a charakterizace". J Biol Chem. 277 (45): 43474–80. doi:10,1074 / jbc.M206065200. PMID 12213818.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HIST1H2BA histonový klastr 1, H2ba“.

Další čtení

El Kharroubi A, Piras G, Zensen R, Martin MA (1998). „Transkripční aktivace integrovaného promotoru viru lidské imunodeficience typu 1 spojeného s chromatinem“. Mol. Buňka. Biol. 18 (5): 2535–44. doi:10,1128 / mcb.18.5.2535. PMC 110633. PMID 9566873.
Deng L, de la Fuente C, Fu P a kol. (2001). „Acetylace HIV-1 Tat pomocí CBP / P300 zvyšuje transkripci integrovaného genomu HIV-1 a zvyšuje vazbu na hlavní histony“. Virologie. 277 (2): 278–95. doi:10.1006 / viro.2000.0593. PMID 11080476.
Deng L, Wang D, de la Fuente C a kol. (2001). "Zlepšení aktivity p300 HAT pomocí HIV-1 Tat na chromatinové DNA". Virologie. 289 (2): 312–26. doi:10.1006 / viro.2001.1129. PMID 11689053.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Lusic M, Marcello A, Cereseto A, Giacca M (2004). „Regulace exprese genu HIV-1 acetylací histonu a nábor faktorů u promotoru LTR“. EMBO J.. 22 (24): 6550–61. doi:10.1093 / emboj / cdg631. PMC 291826. PMID 14657027.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Li A, Maffey AH, Abbott WD a kol. (2005). "Charakterizace nukleosomů sestávající z varianty lidského varlete / spermatu specifické pro H2B (hTSH2B)". Biochemie. 44 (7): 2529–35. doi:10.1021 / bi048061n. PMID 15709765.
Golebiowski F, Kasprzak KS (2007). „Inhibice acetylace jádrových histonů karcinogenním niklem (II)“. Mol. Buňka. Biochem. 279 (1–2): 133–9. doi:10.1007 / s11010-005-8285-1. PMID 16283522. S2CID 25071586.
Zhu B, Zheng Y, Pham AD a kol. (2006). „Monoubikvitinace lidského histonu H2B: zúčastněné faktory a jejich role v regulaci genu HOX“. Mol. Buňka. 20 (4): 601–11. doi:10.1016 / j.molcel.2005.09.025. PMID 16307923.
Pavri R, Zhu B, Li G a kol. (2006). „Histon H2B monoubikvitinace funguje kooperativně s FACT k regulaci prodloužení pomocí RNA polymerázy II“. Buňka. 125 (4): 703–17. doi:10.1016 / j.cell.2006.04.029. PMID 16713563. S2CID 2614680.
Kim SC, Sprung R, Chen Y a kol. (2006). „Substrátová a funkční rozmanitost acetylace lysinu odhalena proteomickým průzkumem“. Mol. Buňka. 23 (4): 607–18. doi:10.1016 / j.molcel.2006.06.026. PMID 16916647.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000146047 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid12408966-4] Marzluff WF, Gongidi P, Woods KR, Jin J, Maltais LJ (říjen 2002). "Lidské a myší replikačně závislé histonové geny". Genomika. 80 (5): 487–98. doi:10.1016 / S0888-7543 (02) 96850-3. PMID 12408966.

[pmid12213818-5] Zalensky AO, Siino JS, Gineitis AA, Zalenskaya IA, Tomilin NV, Yau P, Bradbury EM (listopad 2002). "Lidský varle / spermie specifický histon H2B (hTSH2B). Molekulární klonování a charakterizace". J Biol Chem. 277 (45): 43474–80. doi:10,1074 / jbc.M206065200. PMID 12213818.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: HIST1H2BA histonový klastr 1, H2ba“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]