HHIPL1 - HHIPL1 - Wikipedia

HHIPL1
Identifikátory
AliasyHHIPL1, KIAA1822, UNQ9245, HHIP jako 1
Externí IDMGI: 1919265 HomoloGene: 81985 Genové karty: HHIPL1
Umístění genu (člověk)
Chromozom 14 (lidský)
Chr.Chromozom 14 (lidský)[1]
Chromozom 14 (lidský)
Genomická poloha pro HHIPL1
Genomická poloha pro HHIPL1
Kapela14q32.2Start99,645,110 bp[1]
Konec99,680,569 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

84439

214305

Ensembl

ENSG00000182218

ENSMUSG00000021260

UniProt

Q96JK4

Q14DK5

RefSeq (mRNA)

NM_001127258
NM_032425
NM_001329411

NM_001044380

RefSeq (protein)

NP_001120730
NP_001316340
NP_115801

NP_001037845

Místo (UCSC)Chr 14: 99,65 - 99,68 MbChr 12: 108,31 - 108,33 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protein podobný HHIP 1 (HHIPL1), také známý jako HHIP2, je a protein že u lidí je kódován HHIPL1 gen zapnutý chromozom 14.[5] Není významně exprimován v mnoha tkáních a typech buněk,[6] ačkoli HHIPL1 mRNA byl zjištěn v trabekulární kost buňky.[7] O přesné biologické funkci HHIPL1 je známo jen málo, ale s tímto proteinem bylo spojeno adenomy.[8] The HHIPL1 gen také obsahuje jeden z 27 SNP spojené se zvýšeným rizikem ischemická choroba srdeční.[9]

Struktura

Gen

The HHIPL1 gen leží na chromozomu 14 v pásu 14q32 a obsahuje 13 exony.[5] Tento gen produkuje 2 izoformy přes alternativní sestřih.[10]

Protein

Tento protein patří k HHIP rodiny a je jedním ze tří členů nalezených u lidí.[10] HHIPL1 obsahuje SRCR doména a N-terminál signální peptid.[7][10] zpracovává se signálního peptidu vede k tomuto proteinu vylučování. Jako člen HHIP obsahuje také konzervovanou HHIP homologní doménu (HIPH) složenou z 18 cystein zbytky.[7]

Funkce

Funkce HHIPL1 není známa. Následující část se týká funkce HHIP.

Funkce HHIP není dobře známa, ale bylo prokázáno, že je úzce spojena s funkcí plic. Vyřazení HHIP u myší je neonatálně smrtelné kvůli vadnému rozvětvení v plicích.[11][12] Ukázalo se, že heterozygotní vyřazení HHIP přispívá k závažnějšímu emfyzém indukovaný cigaretovým kouřem ve srovnání s divokými myšími.[13] Dále zvýšený spontánní emfyzém a oxidační stres hladiny byly nalezeny v plicích HHIP heterozygotní myši.[14] Úroveň exprese i aktivita zesilovače HHIP je snížena chronická obstrukční plicní nemoc (CHOPN) plic, což naznačuje ochrannou roli HHIP v patogenezi CHOPN.[15]

Klinický význam

Methylace DNA je jednou z několika epigenetických modifikací uznávaných jako charakteristické znaky tumorigeneze. V celogenomovém průzkumu subtypově specifických epigenomických změn v adenomu byl gen HHIPL1 hypermethylován u 12 ze 13 nefunkčních (NF) adenomů a také v adenomech vylučujících růstový hormon (GH) a prolektin. HHIPL1 má tedy potenciál sloužit jako biomarker k předpovědi nebo charakterizaci nádorových růstových vzorců.[8] Na rozdíl od jiného člena rodiny lidských genů HHIP, HHIP, který je považován za farmakogenomický cíl v oblasti onkologie a vaskulární medicíny, dosud byl HHIPL1 popsán s takovým potenciálem.[7]

V kardiovaskulární oblasti byl navíc HHIPL1 spojován s CAD u Evropanů, Jihoasijců a populace Japonců.[16][17] V jiné studii založené na japonské populaci se však asociace nepodařilo replikovat, což naznačuje, že tato asociace je specifická pro populaci.[18]

Klinický marker

Studie multi-lokusového skóre genetického rizika založená na kombinaci 27 lokusů, včetně genu HHIFL1, identifikovala jedince se zvýšeným rizikem jak příhodných, tak rekurentních příhod ischemické choroby srdeční, stejně jako zvýšený klinický přínos léčby statiny. Studie byla založena na komunitní kohortní studii (Malmova dieta a rakovina) a čtyřech dalších randomizovaných kontrolovaných studiích kohort primární prevence (JUPITER a ASCOT) a kohort sekundární prevence (CARE a PROVE IT-TIMI 22).[9]

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000182218 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021260 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ A b „HHIPL1 HHIP jako 1 [Homo sapiens] - gen“. Národní centrum pro biotechnologické informace (NCBI). Citováno 2016-10-06.
  6. ^ „BioGPS - váš systém Gene Portal“. biogps.org. Citováno 2016-10-06.
  7. ^ A b C d Katoh Y, Katoh M (únor 2006). „Srovnávací genomika na ortologech rodiny HHIP“. International Journal of Molecular Medicine. 17 (2): 391–5. doi:10,3892 / ijmm.17.2.391. PMID  16391842.
  8. ^ A b Duong CV, Emes RD, Wessely F, Yacqub-Usman K, Clayton RN, Farrell WE (prosinec 2012). „Kvantitativní analýza methylomu DNA u sporadických adenomů hypofýzy v celém genomu“. Rakovina související s endokrinním systémem. 19 (6): 805–16. doi:10.1530 / ERC-12-0251. PMID  23045325.
  9. ^ A b Mega JL, Stitziel NO, Smith JG, Chasman DI, Caulfield MJ, Devlin JJ a kol. (Červen 2015). „Genetické riziko, příhody ischemické choroby srdeční a klinický přínos léčby statiny: analýza studií primární a sekundární prevence“. Lanceta. 385 (9984): 2264–71. doi:10.1016 / S0140-6736 (14) 61730-X. PMC  4608367. PMID  25748612.
  10. ^ A b C „HHIPL1 - prekurzor proteinu 1 podobný HHIP - Homo sapiens (člověk) - gen a protein HHIPL1“. UniProt. Citováno 2016-10-06.
  11. ^ Chuang PT, Kawcak T, McMahon AP (únor 2003). „Řízení zpětné vazby na savčí signalizaci ježka pomocí proteinu vázajícího na ježek, Hip1, moduluje signalizaci Fgf během větvené morfogeneze plic“. Geny a vývoj. 17 (3): 342–7. doi:10.1101 / gad.1026303. PMC  195990. PMID  12569124.
  12. ^ Chuang PT, McMahon AP (únor 1999). "Signalizace obratlovců ježek modulovaná indukcí proteinu vázajícího ježek". Příroda. 397 (6720): 617–21. Bibcode:1999 Natur.397..617C. doi:10.1038/17611. PMID  10050855.
  13. ^ Lao T, Glass K, Qiu W, Polverino F, Gupta K, Morrow J a kol. (01.01.2015). „Haploinsufficiita proteinu interagujícího s Ježkem způsobuje zvýšené emfyzém vyvolané cigaretovým kouřem prostřednictvím opětovného zapojení sítě“. Genomová medicína. 7 (1): 12. doi:10.1186 / s13073-015-0137-3. PMC  4355149. PMID  25763110.
  14. ^ Lao T, Jiang Z, Yun J, Qiu W, Guo F, Huang C a kol. (Srpen 2016). „Hhip haploinsufficiency senzibilizuje myši na emfyzém související s věkem“. Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 113 (32): E4681-7. doi:10.1073 / pnas.1602342113. PMC  4987811. PMID  27444019.
  15. ^ Zhou X, Baron RM, Hardin M, Cho MH, Zielinski J, Hawrylkiewicz I a kol. (Březen 2012). „Identifikace genetického determinantu chronické obstrukční plicní nemoci, který reguluje HHIP“. Lidská molekulární genetika. 21 (6): 1325–35. doi:10,1093 / hmg / ddr569. PMC  3284120. PMID  22140090.
  16. ^ Schunkert H, König IR, Kathiresan S, Reilly MP, Assimes TL, Holm H a kol. (Duben 2011). „Rozsáhlá asociační analýza identifikuje 13 nových lokusů citlivosti na ischemickou chorobu srdeční“. Genetika přírody. 43 (4): 333–8. doi:10,1038 / ng.784. PMC  3119261. PMID  21378990.
  17. ^ Peden JF (duben 2011). „Celomanomová asociační studie u Evropanů a Jihoasijců identifikovala pět nových lokusů pro onemocnění koronárních tepen“. Genetika přírody. 43 (4): 339–44. doi:10.1038 / ng.782. PMID  21378988.
  18. ^ Dechamethakun S, Ikeda S, Arai T, Sato N, Sawabe M, Muramatsu M (01.01.2014). „Sdružení mezi polymorfismy CDKN2A / B, ADTRP a PDGFD a rozvoj koronární aterosklerózy u japonských pacientů“. Journal of Atherosclerosis and Trombosis. 21 (7): 680–90. doi:10,5551 / jat.22640. PMID  24573017.