HERC5 - HERC5 - Wikipedia

HERC5
Identifikátory
Aliasy	HERC5, CEB1, CEBP1, HECT a RLD doména obsahující E3 ubikvitinovou proteinovou ligázu 5
Externí ID	OMIM: 608242 HomoloGene: 81848 Genové karty: HERC5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	88,506,163 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita ISG15 transferázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita transferázy; • Vazba RNA; • aktivita ubikvitin-protein transferázy; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy;
Buněčná složka	• perinukleární oblast cytoplazmy; • cytosol; • cytoplazma;
Biologický proces	• Konjugace ISG15-protein; • negativní regulace produkce interferonu typu I.; • regulace aktivity cyklin-dependentního proteinu serin / threonin kináza; • regulace obranné reakce na virus; • obranná reakce na virus; • proces imunitního systému; • polyubikvitinace bílkovin; • vrozený imunitní systém;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51191
	n / a
	ENSG00000138646
	n / a
	Q9UII4
	n / a
	NM_016323
	n / a
	NP_057407
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka

Pravděpodobná E3 ubikvitin-protein ligáza HERC5 je enzym že u lidí je kódován HERC5 gen.^[3]^[4]

Tento gen je členem rodiny HERC ubikvitinových ligáz a kóduje protein s Doména HECT a pět RCC1 opakování. Prozánětlivé cytokiny zvyšují expresi tohoto genu v endoteliálních buňkách. Protein se lokalizuje do cytoplazmy a perinukleární oblasti a funguje jako interferonem indukovaná E3 proteinová ligáza, která zprostředkovává ISGylaci proteinových cílů. Gen leží v klastru genů rodiny HERC na chromozomu 4.^[4] Bylo prokázáno, že HERC5 vykazuje antivirovou aktivitu vůči HIV-1, viru chřipky A a lidskému papilomaviru.^[5]^[6]^[7]

Interakce

HERC5 bylo prokázáno komunikovat s NME2^[8] a Cyklin E1.^[3]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138646 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Mitsui K, Nakanishi M, Ohtsuka S, Norwood TH, Okabayashi K, Miyamoto C, Tanaka K, Yoshimura A, Ohtsubo M (leden 2000). „Nový lidský gen kódující doménu HECT a opakování podobná RCC1 interaguje s cykliny a je potenciálně regulován proteiny potlačujícími nádor“. Biochem Biophys Res Commun. 266 (1): 115–22. doi:10.1006 / bbrc.1999.1777. PMID 10581175.
^ ^A ^b „Entrez Gene: HERC5 hect domain and RLD 5“.
^ Woods MW, Kelly JN, Hattlmann CJ, Tong JG, Xu LS, Coleman MD, Quest GR, Smiley JR, Barr SD (listopad 2011). „Lidský HERC5 omezuje rané stádium shromáždění HIV-1 mechanismem korelujícím s ISGylací Gag“. Retrovirologie. 8: 95. doi:10.1186/1742-4690-8-95. PMC 3228677. PMID 22093708.
^ Tang Y, Zhong G, Zhu L, Liu X, Shan Y, Feng H, Bu Z, Chen H, Wang C (květen 2010). „Herc5 tlumí virus chřipky A katalyzováním ISGylace virového proteinu NS1“. J. Immunol. 184 (10): 5777–90. doi:10,4049 / jimmunol.0903588. PMID 20385878.
^ Durfee LA, Lyon N, Seo K, Huibregtse JM (červen 2010). „Konjugační systém ISG15 se obecně zaměřuje na nově syntetizované proteiny: důsledky pro antivirovou funkci ISG15“. Mol Cell. 38 (5): 722–32. doi:10.1016 / j.molcel.2010.05.002. PMC 2887317. PMID 20542004.
^ Hochrainer, K; Kroismayr R; Baranyi U; Pojivo B R; Lipp J (červenec 2008). „Vysoce homologní proteiny HERC se lokalizují do endosomů a vykazují specifické interakce s hPLIC a Nm23B“. Buňka. Mol. Life Sci. Švýcarsko. 65 (13): 2105–17. doi:10.1007 / s00018-008-8148-5. ISSN 1420-682X. PMID 18535780. S2CID 6897759.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138646 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10581175-3] A ^b Mitsui K, Nakanishi M, Ohtsuka S, Norwood TH, Okabayashi K, Miyamoto C, Tanaka K, Yoshimura A, Ohtsubo M (leden 2000). „Nový lidský gen kódující doménu HECT a opakování podobná RCC1 interaguje s cykliny a je potenciálně regulován proteiny potlačujícími nádor“. Biochem Biophys Res Commun. 266 (1): 115–22. doi:10.1006 / bbrc.1999.1777. PMID 10581175.

[entrez-4] A ^b „Entrez Gene: HERC5 hect domain and RLD 5“.

[pmid22093708-5] Woods MW, Kelly JN, Hattlmann CJ, Tong JG, Xu LS, Coleman MD, Quest GR, Smiley JR, Barr SD (listopad 2011). „Lidský HERC5 omezuje rané stádium shromáždění HIV-1 mechanismem korelujícím s ISGylací Gag“. Retrovirologie. 8: 95. doi:10.1186/1742-4690-8-95. PMC 3228677. PMID 22093708.

[pmid_20385878-6] Tang Y, Zhong G, Zhu L, Liu X, Shan Y, Feng H, Bu Z, Chen H, Wang C (květen 2010). „Herc5 tlumí virus chřipky A katalyzováním ISGylace virového proteinu NS1“. J. Immunol. 184 (10): 5777–90. doi:10,4049 / jimmunol.0903588. PMID 20385878.

[pmid_20542004-7] Durfee LA, Lyon N, Seo K, Huibregtse JM (červen 2010). „Konjugační systém ISG15 se obecně zaměřuje na nově syntetizované proteiny: důsledky pro antivirovou funkci ISG15“. Mol Cell. 38 (5): 722–32. doi:10.1016 / j.molcel.2010.05.002. PMC 2887317. PMID 20542004.

[pmid18535780-8] Hochrainer, K; Kroismayr R; Baranyi U; Pojivo B R; Lipp J (červenec 2008). „Vysoce homologní proteiny HERC se lokalizují do endosomů a vykazují specifické interakce s hPLIC a Nm23B“. Buňka. Mol. Life Sci. Švýcarsko. 65 (13): 2105–17. doi:10.1007 / s00018-008-8148-5. ISSN 1420-682X. PMID 18535780. S2CID 6897759.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]