HDLBP - HDLBP - Wikipedia

HDLBP
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1 VIG, 1VIH, 2CTE, 2CTF, 2CTJ, 2CTK, 2CTL, 2CTM
Identifikátory
Aliasy	HDLBP, HBP, PRO2900, VGL, protein vázající lipoproteiny s vysokou hustotou
Externí ID	OMIM: 142695 MGI: 99256 HomoloGene: 38035 Genové karty: HDLBP
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	241,317,061 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	93,478,815 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba lipidů; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA; • kadherinová vazba;
Buněčná složka	• buněčná membrána; • buněčné jádro; • lipoproteinová částice s vysokou hustotou; • cytoplazma; • cytosol;
Biologický proces	• metabolismus lipidů; • metabolický proces steroidů; • transport lipidů; • metabolický proces cholesterolu; • clearance lipoproteinů s vysokou hustotou; • doprava;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	3069
	110611
	ENSG00000115677
	ENSMUSG00000034088
	Q00341
	Q8VDJ3
NM_001243900; NM_005336; NM_203346; NM_001320965; NM_001320966;
	NM_001320967
	NM_001301364; NM_133808; NM_001357556
NP_001230829; NP_001307894; NP_001307895; NP_001307896; NP_005327;
	NP_976221
	NP_001288293; NP_598569; NP_001344485
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Vigilin je 110 kDa protein že u lidí je kódován HDLBP gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115677 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034088 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ McKnight GL, Reasoner J, Gilbert T, Sundquist KO, Hokland B, McKernan PA, Champagne J, Johnson CJ, Bailey MC, Holly R a kol. (Červenec 1992). „Klonování a exprese buněčného proteinu vázajícího lipoproteiny o vysoké hustotě, který je regulován zvýšenou dávkou cholesterolu do buněk“. J Biol Chem. 267 (17): 12131–41. PMID 1318310.
^ Xia YR, Klisak I, Sparkes RS, Oram J, Lusis AJ (červenec 1993). „Lokalizace genu pro protein vázající lipoproteiny o vysoké hustotě (HDLBP) na lidský chromozom 2q37“. Genomika. 16 (2): 524–5. doi:10.1006 / geno.1993.1221. PMID 8390966.
^ „Entrez Gene: HDLBP protein s vysokou hustotou vázající lipoproteiny (vigilin)“.

Další čtení

Anderson NL, Anderson NG (2003). „Proteom lidské plazmy: historie, charakter a diagnostické vyhlídky“. Mol. Buňka. Proteomika. 1 (11): 845–67. doi:10,1074 / mcp.R200007-MCP200. PMID 12488461.
Graham DL, Oram JF (1987). „Identifikace a charakterizace proteinu vázajícího lipoproteiny o vysoké hustotě v buněčných membránách blotováním ligandu“. J. Biol. Chem. 262 (16): 7439–42. PMID 3034894.
Plenz G, Kügler S, Schnittger S a kol. (1994). "Gen lidského vigilinu: identifikace, chromozomální lokalizace a vzor exprese". Hučení. Genet. 93 (5): 575–82. doi:10.1007 / BF00202827. PMID 8168838. S2CID 25536273.
Neu-Yilik G, Zorbas H, Gloe TR a kol. (1993). „Vigilin je cytoplazmatický protein. Studie jeho exprese v primárních buňkách a v zavedených buněčných liniích různých druhů“. Eur. J. Biochem. 213 (2): 727–36. doi:10.1111 / j.1432-1033.1993.tb17813.x. PMID 8477745.
Kügler S, Grünweller A, Probst C a kol. (1996). „Vigilin obsahuje funkční sekvenci nukleární lokalizace a je přítomen jak v cytoplazmě, tak v jádře“. FEBS Lett. 382 (3): 330–4. doi:10.1016/0014-5793(96)00204-9. PMID 8605996. S2CID 42740112.
Kügler S, Plenz G, Müller PK (1996). „Dva další 5 'exony v lidském genu pro vigilin jej odlišují od kuřecího genu a poskytují strukturální základ pro rozdílné cesty genové exprese.“ Eur. J. Biochem. 238 (2): 410–7. doi:10.1111 / j.1432-1033.1996.0410z.x. PMID 8681952.
Chiu DS, Oram JF, LeBoeuf RC a kol. (1998). „Protein vázající se na lipoproteiny s vysokou hustotou (HBP) / vigilin je exprimován v lidských aterosklerotických lézích a kolokalizuje apolipoproteinem E.“. Arterioskler. Tromb. Vasc. Biol. 17 (11): 2350–8. doi:10.1161 / 01.ATV.17.11.2350. PMID 9409201.
Kruse C, Willkomm DK, Grünweller A, et al. (2000). „Export a transport tRNA jsou spojeny s komplexem více proteinů“. Biochem. J. 346 (Pt 1): 107–15. doi:10.1042/0264-6021:3460107. PMC 1220829. PMID 10657246.
Bocharov AV, Vishnyakova TG, Baranova IN, et al. (2001). „Charakterizace lidského proteinu vázajícího lipoproteiny s vysokou afinitou na 95 kDa s vysokou afinitou“. Biochemie. 40 (14): 4407–16. doi:10.1021 / bi001503k. PMID 11284697.
Wistow G, Bernstein SL, Ray S a kol. (2002). „Expresní analýza sekvenční značky dospělé lidské duhovky pro projekt NEIBank: faktory reakce na steroidy a podobnosti s pigmentovým epitelem sítnice“. Mol. Vis. 8: 185–95. PMID 12107412.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Adkins JN, Varnum SM, Auberry KJ a kol. (2003). „Směrem k proteomu lidského krevního séra: analýza multidimenzionální separací ve spojení s hmotnostní spektrometrií“. Mol. Buňka. Proteomika. 1 (12): 947–55. doi:10,1074 / mcp.M200066-MCP200. PMID 12543931.
Goolsby KM, Shapiro DJ (2003). „Vyčerpání RNAi zprostředkovaného proteinu domény 15 KH, vigilinu, indukuje smrt dělících se a nedělících se lidských buněk, ale zpočátku neinhibuje syntézu proteinů“. Nucleic Acids Res. 31 (19): 5644–53. doi:10,1093 / nar / gkg768. PMC 206468. PMID 14500828.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Vollbrandt T, Willkomm D, Stossberg H, Kruse C (2004). „Vigilin je lokalizován společně s 80S ribozomy a váže se na ribozomální komplex prostřednictvím své C-terminální domény.“ Int. J. Biochem. Cell Biol. 36 (7): 1306–18. doi:10.1016 / j.biocel.2003.11.006. PMID 15109574.
Colland F, Jacq X, Trouplin V a kol. (2004). "Funkční proteomika mapující cestu lidské signalizace". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10,1101 / gr. 2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000115677 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034088 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid1318310-5] McKnight GL, Reasoner J, Gilbert T, Sundquist KO, Hokland B, McKernan PA, Champagne J, Johnson CJ, Bailey MC, Holly R a kol. (Červenec 1992). „Klonování a exprese buněčného proteinu vázajícího lipoproteiny o vysoké hustotě, který je regulován zvýšenou dávkou cholesterolu do buněk“. J Biol Chem. 267 (17): 12131–41. PMID 1318310.

[pmid8390966-6] Xia YR, Klisak I, Sparkes RS, Oram J, Lusis AJ (červenec 1993). „Lokalizace genu pro protein vázající lipoproteiny o vysoké hustotě (HDLBP) na lidský chromozom 2q37“. Genomika. 16 (2): 524–5. doi:10.1006 / geno.1993.1221. PMID 8390966.

[entrez-7] „Entrez Gene: HDLBP protein s vysokou hustotou vázající lipoproteiny (vigilin)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]