Symptomatikum glukonát-proton - Gluconate-proton symporter

Glukonát: H+ Symporter
Identifikátory
SymbolGntP
PfamPF02447
InterProIPR003474

The glukonát: H+ rodina symporterů (GntP) (TC # 2.A.8 ) je rodina transportních proteinů patřících do nadrodina iontových transportérů (IT).[1] Členové rodiny GntP jsou známí glukonát permeaty z E-coli a Bacil druhy, jako je D-glukonát: H+ symporter of Bacillus subtillus (GntP; TC # 2.A.8.1.1 ) a D-frukturonát / D-glukonát: H+ symporter of E-coli (GntP; TC # 2.A.8.1.3 ).[2][3][4] Reprezentativní seznam proteinů patřících do rodiny GntP lze nalézt v Databáze klasifikace transportérů.[5]

Struktura

Bioinformatická analýza naznačuje, že tyto proteiny mají asi 450 zbytků a mají 12 nebo 14 domnělých transmembránových α-šroubovicových klíčů. Počátkem roku 2016 nejsou pro proteiny GntP k dispozici žádné údaje o krystalové struktuře.

Funkce

Čtyři ze sedmi E-coli Bylo zjištěno, že paralogy mají aktivní absorpční aktivitu glukonátu a jeden z nich (GntW; TC # 2.A.8.1.2 ) může pojmout jak L-idonát, tak D-glukonát, i když L-idonát je fyziologický substrát. Další (GntP) transportuje D-glukonát s vysokou afinitou, ale je specificky indukován a transportuje D-frukturonát.[4] GntT z E-coli je fyziologická glukonátová permeáza.[6]

Transportní reakce

Generalizovaná transportní reakce katalyzovaná proteiny rodiny GntP je:

Kyselina sacharidová (out) + nH+ (out) → Kyselina sacharidová (in) + nH+ (v)

Reference

  1. ^ Prakash S, Cooper G, Singhi S, Saier MH (prosinec 2003). „Nadrodina iontových transportérů“. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - biomembrány. 1618 (1): 79–92. doi:10.1016 / j.bbamem.2003.10.010. PMID  14643936.
  2. ^ Peekhaus N, Tong S, Reizer J, Saier MH, Murray E, Conway T (únor 1997). „Charakterizace nové rodiny transportérů, která zahrnuje více transportérů glukonátu Escherichia coli a jejich homologů“. Mikrobiologické dopisy FEMS. 147 (2): 233–8. doi:10.1016 / s0378-1097 (96) 00532-0. PMID  9119199.
  3. ^ Reizer A, Deutscher J, Saier MH, Reizer J (květen 1991). "Analýza glukonátového (gnt) operonu Bacillus subtilis". Molekulární mikrobiologie. 5 (5): 1081–9. doi:10.1111 / j.1365-2958.1991.tb01880.x. PMID  1659648. S2CID  2006623.
  4. ^ A b Bates Utz C, Nguyen AB, Smalley DJ, Anderson AB, Conway T (listopad 2004). „GntP je transportér kyseliny frukturonové Escherichia coli a patří do regulonu UxuR“. Journal of Bacteriology. 186 (22): 7690–6. doi:10.1128 / JB.186.22.7690-7696.2004. PMC  524916. PMID  15516583.
  5. ^ „2.A.8 Glukonát: rodina H + Symporter (GntP)“. Databáze klasifikace transportérů. Citováno 2016-03-04.
  6. ^ Porco A, Peekhaus N, Bausch C, Tong S, Isturiz T, Conway T (březen 1997). „Molekulárně genetická charakterizace genu gntT Escherichia coli z GntI, hlavního systému metabolismu glukonátu“. Journal of Bacteriology. 179 (5): 1584–90. doi:10.1128 / jb.179.5.1584-1590.1997. PMC  178870. PMID  9045817.

Od 9. března 2016 je tento článek zcela nebo zčásti odvozen od Databáze klasifikace transportérů. Držitel autorských práv licencoval obsah způsobem, který umožňuje jeho opětovné použití pod CC BY-SA 3.0 a GFDL. Je třeba dodržovat všechny příslušné podmínky. Původní text byl v „Glukonát: rodina H + Symporter (GntP)“