GCM1 - GCM1

GCM1
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	1ODH
Identifikátory
Aliasy	GCM1, GCMA, hGCMa, gliové buňky chybí homolog 1, gliové buňky chybí transkripční faktor 1
Externí ID	OMIM: 603715 MGI: 108045 HomoloGene: 2702 Genové karty: GCM1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	53,148,841 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	78,065,624 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • GO: 0001131, GO: 0001151, GO: 0001130, GO: 0001204 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA; • vazba iontů zinku; • GO: 0001077, GO: 0001212, GO: 0001213, GO: 0001211, GO: 0001205 Aktivita aktivátoru transkripce vázající DNA, specifická pro RNA polymerázu II; • vazba transkripčního faktoru; • vazba histon-deacetylázy; • vazba kovových iontů; • GO: 0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická vazba DNA; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • GO: 0001200, GO: 0001133, GO: 0001201 Aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA, specifická pro RNA polymerázu II;
Buněčná složka	• komplex regulátoru transkripce; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • anatomická struktura morfogeneze; • pozitivní regulace tvorby syncytia fúzí plazmatické membrány; • transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • transkripce, chráněná DNA; • vývoj mnohobuněčných organismů; • větvení účastnící se morfogeneze labyrintové vrstvy; • závazek k osudu astrocytů; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • gliogeneze; • regulace buněčné diferenciace podílející se na vývoji embryonální placenty; • buněčná diferenciace podílející se na vývoji embryonální placenty;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8521
	14531
	ENSG00000137270
	ENSMUSG00000023333
	Q9NP62
	P70348
	NM_003643
	NM_008103
	NP_003634
	NP_032129
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Chorion-specifický transkripční faktor GCMa je protein že v lidé, je kódován GCM1 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje a Protein vázající DNA s motivem gcm (gliové buňky chybí motiv ). Kódovaný protein je homologem Drosophila v gliových buňkách chybí gen (gcm). Tento protein se váže na GCM-motiv (A / G) CCCGCAT, novou sekvenci mezi známými cíli proteinů vázajících DNA. N-koncová doména vázající DNA uděluje jedinečnou aktivitu DNA vázající tento protein.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137270 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023333 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Akiyama Y, Hosoya T, Poole AM, Hotta Y (leden 1997). „Motiv gcm: nový motiv vázající DNA konzervovaný u Drosophila a savců“. Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (25): 14912–6. doi:10.1073 / pnas.93.25.14912. PMC 26236. PMID 8962155.
^ ^A ^b "Entrez Gene: GCM1 gliové buňky chybí homolog 1 (Drosophila)".

Další čtení

Yamada K, Ogawa H, Honda S a kol. (1999). „GCM motivový protein se podílí na expresi lidského aromatázového genu specifické pro placentu“. J. Biol. Chem. 274 (45): 32279–86. doi:10.1074 / jbc.274.45.32279. PMID 10542267.
Nait-Oumesmar B, Copperman AB, Lazzarini RA (2000). "Placentární exprese a chromozomální lokalizace lidského genu Gcm 1". J. Histochem. Cytochem. 48 (7): 915–22. doi:10.1177/002215540004800704. PMID 10858268.
Yamada K, Ogawa H, Tamiya G a kol. (2001). „Genomická organizace, chromozomální lokalizace a kompletní 22kb sekvence DNA lidského GCMa / GCM1, gen pro transkripční faktor specifický pro placentu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 278 (1): 134–9. doi:10,1006 / bbrc.2000.3775. PMID 11071865.
Yu C, Shen K, Lin M a kol. (2003). „GCMa reguluje trofoblastickou fúzi zprostředkovanou syncytiny“. J. Biol. Chem. 277 (51): 50062–8. doi:10,1074 / jbc.M209316200. PMID 12397062.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK a kol. (2003). „Sekvence DNA a analýza lidského chromozomu 6“. Příroda. 425 (6960): 805–11. Bibcode:2003 Natur.425..805M. doi:10.1038 / nature02055. PMID 14574404.
Chen CP, Chen CY, Yang YC a kol. (2005). "Snížená genová exprese placentárního GCM1 (chybí gliové buňky) v preeklampsii". Placenta. 25 (5): 413–21. doi:10.1016 / j.placenta.2003.10.014. PMID 15081636.
Baczyk D, Satkunaratnam A, Nait-Oumesmar B a kol. (2004). „Složité vzorce mRNA a proteinu GCM1 ve vilózních a extravilózních trofoblastových buňkách lidské placenty“. Placenta. 25 (6): 553–9. doi:10.1016 / j.placenta.2003.12.004. PMID 15135239.
Schubert SW, Kardash E, Khan MA a kol. (2005). „Interakce, modulace kooperativního promotoru a renální kolokalizace GCMa a Pitx2“. J. Biol. Chem. 279 (48): 50358–65. doi:10,1074 / jbc.M404587200. PMID 15385555.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Yang CS, Yu C, Chuang HC a kol. (2005). „FBW2 cílí na GCMa do systému degradace ubikvitin-proteazomu“. J. Biol. Chem. 280 (11): 10083–90. doi:10,1074 / jbc.M413986200. PMID 15640526.
Knerr I, Schubert SW, Wich C a kol. (2005). "Stimulace GCMa a syncytinu prostřednictvím cAMP zprostředkované PKA signalizace v lidských trofoblastických buňkách za normoxických a hypoxických podmínek". FEBS Lett. 579 (18): 3991–8. doi:10.1016 / j.febslet.2005.06.029. PMID 16004993. S2CID 46648257.
Chang CW, Chuang HC, Yu C a kol. (2005). „Stimulace transkripční aktivity GCMa cyklickou signalizací AMP / protein kinázy A se připisuje acetylaci GCMa zprostředkované CBP“. Mol. Buňka. Biol. 25 (19): 8401–14. doi:10.1128 / MCB.25.19.8401-8414.2005. PMC 1265739. PMID 16166624.
Chuang HC, Chang CW, Chang GD a kol. (2006). „Histon deacetyláza 3 se váže na transkripční faktor GCMa a reguluje jej“. Nucleic Acids Res. 34 (5): 1459–69. doi:10.1093 / nar / gkl048. PMC 1401512. PMID 16528103.
Fujito N, Samura O, Miharu N a kol. (2007). „Zvýšené plazmové mRNA placenty specifické 1 (PLAC1) a gliových buněk chybí 1 (GCM1) u matek s preeklampsií“. Hirošima J. Med. Sci. 55 (1): 9–15. PMID 16594548.
Chou CC, Chang C, Liu JH a kol. (2007). „Malá modifikace modifikátoru podobná ubikvitinu reguluje vazebnou aktivitu DNA gliových buněk s chybějícím homologem Drosophila a.“ J. Biol. Chem. 282 (37): 27239–49. doi:10,1074 / jbc.M700351200. PMID 17646165.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000137270 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000023333 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid8962155-5] Akiyama Y, Hosoya T, Poole AM, Hotta Y (leden 1997). „Motiv gcm: nový motiv vázající DNA konzervovaný u Drosophila a savců“. Proc Natl Acad Sci U S A. 93 (25): 14912–6. doi:10.1073 / pnas.93.25.14912. PMC 26236. PMID 8962155.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: GCM1 gliové buňky chybí homolog 1 (Drosophila)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]