GALNT6 - GALNT6

GALNT6
Identifikátory
Aliasy	GALNT6, GALNAC-T6, GalNAcT6, polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferáza 6
Externí ID	OMIM: 605148 MGI: 1891640 HomoloGene: 5218 Genové karty: GALNT6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	51,392,867 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	100,729,376 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vázání sacharidů; • aktivita transferázy, přenos glykosylových skupin; • vazba kovových iontů; • aktivita transferázy; • aktivita polypeptidu N-acetylgalaktosaminyltransferázy;
Buněčná složka	• membrána; • perinukleární oblast cytoplazmy; • Golgiho membrána; • integrální součást membrány; • Golgiho aparát;
Biologický proces	• Zpracování O-glykanu; • glykosylace vázaná na protein O; • glykosylace proteinů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	11226
	207839
	ENSG00000139629
	ENSMUSG00000037280
	Q8NCL4
	Q8C7U7
	NM_007210
	NM_001161767; NM_001161768; NM_172451
	NP_009141
	NP_001155239; NP_001155240; NP_766039
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferáza 6 je enzym že u lidí je kódován GALNT6 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje člena rodiny enzymů UDP-N-acetyl-alfa-D-galaktosamin: polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferáza (GalNAc-T). GalNAc-Ts iniciuje O-vázanou glykosylaci mucinového typu v Golgiho aparátu katalyzováním přenosu GalNAc na serinové a threoninové zbytky na cílových proteinech. Vyznačují se N-koncovou transmembránovou doménou, kmenovou oblastí, lumenální katalytickou doménou obsahující motiv GT1 a motiv Gal / GalNAc transferázy a C-koncovou doménu podobnou ricinu / lektinu. GalNAc-Ts mají různé, ale překrývající se substrátové specificity a vzorce exprese. Kódovaný protein je schopen glykosylovat fibronektinový peptid in vitro a je exprimován v buněčné linii fibroblastů, což naznačuje, že se může podílet na syntéze onkofetálního fibronektinu.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139629 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037280 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Bennett EP, Hassan H, Mandel U, Hollingsworth MA, Akisawa N, Ikematsu Y, Merkx G, van Kessel AG, Olofsson S, Clausen H (říjen 1999). „Klonování a charakterizace blízkého homologu lidského UDP-N-acetyl-alfa-D-galaktosaminu: Polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferáza-T3, označený jako GalNAc-T6. Důkaz genetické, ale ne funkční redundance“. J Biol Chem. 274 (36): 25362–70. doi:10.1074 / jbc.274.36.25362. PMID 10464263.
^ ^A ^b "Entrez Gene: GALNT6 UDP-N-acetyl-alfa-D-galaktosamin: polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferáza 6 (GalNAc-T6)".

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Argüeso P, Tisdale A, Mandel U a kol. (2003). „Distribuce GalNAc-transferáz specifická pro buněčnou vrstvu a buněčný typ v epitelu očního povrchu se během keratinizace mění“. Investovat. Oftalmol. Vis. Sci. 44 (1): 86–92. doi:10.1167 / iovs.02-0181. PMID 12506059.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Otsuki T, Ota T, Nishikawa T a kol. (2007). "Signální sekvence a klíčové slovo trap in silico pro výběr lidských cDNA plné délky kódujících sekreci nebo membránové proteiny z knihoven cDNA opatřených oligo". DNA Res. 12 (2): 117–26. doi:10.1093 / dnares / 12.2.117. PMID 16303743.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000139629 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000037280 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10464263-5] Bennett EP, Hassan H, Mandel U, Hollingsworth MA, Akisawa N, Ikematsu Y, Merkx G, van Kessel AG, Olofsson S, Clausen H (říjen 1999). „Klonování a charakterizace blízkého homologu lidského UDP-N-acetyl-alfa-D-galaktosaminu: Polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferáza-T3, označený jako GalNAc-T6. Důkaz genetické, ale ne funkční redundance“. J Biol Chem. 274 (36): 25362–70. doi:10.1074 / jbc.274.36.25362. PMID 10464263.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: GALNT6 UDP-N-acetyl-alfa-D-galaktosamin: polypeptid N-acetylgalaktosaminyltransferáza 6 (GalNAc-T6)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]