Daleko upstream protein vázající prvek 1 - Far upstream element-binding protein 1
Daleko upstream protein vázající prvek 1 je protein že u lidí je kódován FUBP1 gen.[5][6]
Tento gen kóduje protein vázající ssDNA, který aktivuje prvek proti směru (FUSE) c-myc a stimuluje expresi c-myc v nediferencovaných buňkách. Regulace FUSE pomocí FUBP nastává prostřednictvím jednořetězcové vazby FUBP na nekódující vlákno. Ukázalo se, že tento protein funguje jako ATP-dependentní DNA helikáza.[6]
Interakce
Bylo prokázáno, že protein 1 vázající se daleko proti proudu komunikovat s MAPK14[7] a SMN1.[8]
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000162613 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000028034 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Duncan R, Bazar L, Michelotti G, Tomonaga T, Krutzsch H, Avigan M, Levens D (duben 1994). „Sekvenčně specifický jednořetězcový vazebný protein aktivuje prvek proti směru c-myc a definuje nový motiv vázající DNA“. Genes Dev. 8 (4): 465–80. doi:10,1101 / gad. 8.4.465. PMID 8125259.
- ^ A b „Entrez Gene: FUBP1 protein daleko vzhůru (FUSE) vázající protein 1“.
- ^ Kim, Min Jung; Park Bum-Joon; Kang Young-Sun; Kim Hyoung June; Park Jae-Hyun; Kang Jung Woo; Lee Sang Won; Han Jung Min; Lee Han-Woong; Kim Sunghoon (červenec 2003). „K diferenciaci plicních buněk je nutná downregulace proteinu vázajícího FUSE a c-myc kofaktorem t38NA tRNA syntetázy p38.“ Nat. Genet. Spojené státy. 34 (3): 330–6. doi:10.1038 / ng1182. ISSN 1061-4036. PMID 12819782.
- ^ Williams, B Y; Hamilton SL; Sarkar H K (březen 2000). „Přežívající motorický neuronový protein interaguje s proteinem vázajícím transaktivátor FUSE z mozku lidského plodu“. FEBS Lett. HOLANDSKO. 470 (2): 207–10. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01320-X. ISSN 0014-5793. PMID 10734235.
Další čtení
- Williams BY, Hamilton SL, Sarkar HK (2000). „Přežívající motorický neuronový protein interaguje s proteinem vázajícím transaktivátor FUSE z lidského mozku plodu“. FEBS Lett. 470 (2): 207–10. doi:10.1016 / S0014-5793 (00) 01320-X. PMID 10734235.
- Liu J, He L, Collins I a kol. (2000). "FBP interagující represor cílí na TFIIH, aby inhiboval aktivovanou transkripci". Mol. Buňka. 5 (2): 331–41. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 80428-1. PMID 10882074.
- Markovtsov V, Nikolic JM, Goldman JA a kol. (2000). „Kooperativní sestava komplexu hnRNP indukovaná tkáňově specifickým homologem proteinu vázajícího polypyrimidinový trakt“. Mol. Buňka. Biol. 20 (20): 7463–79. doi:10.1128 / MCB.20.20.7463-7479.2000. PMC 86300. PMID 11003644.
- He L, Weber A, Levens D (2000). „Jaderné cílené determinanty proteinu vázajícího prvek daleko proti proudu, transkripční faktor c-myc“. Nucleic Acids Res. 28 (22): 4558–65. doi:10.1093 / nar / 28.22.4558. PMC 113884. PMID 11071946.
- Vindigni A, Ochem A, Triolo G, Falaschi A (2001). „Identifikace lidské DNA helikázy V pomocí proteinu vázajícího prvek daleko proti proudu“. Nucleic Acids Res. 29 (5): 1061–7. doi:10.1093 / nar / 29.5.1061. PMC 29729. PMID 11222755.
- Liu J, Akoulitchev S, Weber A a kol. (2001). „Vadná souhra aktivátorů a represorů s TFIH v xeroderma pigmentosum“. Buňka. 104 (3): 353–63. doi:10.1016 / S0092-8674 (01) 00223-9. PMID 11239393.
- Braddock DT, Louis JM, Baber JL a kol. (2002). "Struktura a dynamika KH domén z FBP navázaných na jednovláknovou DNA". Příroda. 415 (6875): 1051–6. doi:10.1038 / 4151051a. PMID 11875576.
- Rappsilber J, Ryder U, Lamond AI, Mann M (2002). „Proteomická analýza lidského spliceosomu ve velkém měřítku“. Genome Res. 12 (8): 1231–45. doi:10,1101 / gr. 473902. PMC 186633. PMID 12176931.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. Bibcode:2002PNAS ... 9916899M. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
- Kim MJ, Park BJ, Kang YS a kol. (2003). „K diferenciaci plicních buněk je nutná downregulace proteinu vázajícího FUSE a c-myc kofaktorem t38NA tRNA syntetázy p38.“ Nat. Genet. 34 (3): 330–6. doi:10.1038 / ng1182. PMID 12819782.
- Brandenberger R, Wei H, Zhang S a kol. (2005). „Charakterizace transkriptomu objasňuje signalizační sítě, které řídí růst a diferenciaci lidských ES buněk“. Nat. Biotechnol. 22 (6): 707–16. doi:10.1038 / nbt971. PMID 15146197.
- Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
- Kouzine F, Liu J, Sanford S a kol. (2004). „Dynamická reakce upstream DNA na torzní napětí generované transkripcí“. Nat. Struct. Mol. Biol. 11 (11): 1092–100. doi:10.1038 / nsmb848. PMID 15502847.
- Rush J, Moritz A, Lee KA a kol. (2005). "Imunoafinitní profil fosforylace tyrosinu v rakovinných buňkách". Nat. Biotechnol. 23 (1): 94–101. doi:10.1038 / nbt1046. PMID 15592455.
- Stelzl U, Worm U, Lalowski M a kol. (2005). „Síť interakce lidský protein-protein: zdroj pro anotování proteomu“. Buňka. 122 (6): 957–68. doi:10.1016 / j.cell.2005.08.029. PMID 16169070.
- Fautsch MP, Vrabel AM, Johnson DH (2006). "Identifikace proteinů asociovaných s myociliny v lidské trabekulární síti". Exp. Eye Res. 82 (6): 1046–52. doi:10.1016 / j.exer.2005.09.016. PMID 16289162.
- Liu J, Kouzine F, Nie Z a kol. (2006). „Systém FUSE / FBP / FIR / TFIIH je molekulární stroj programující pulz výrazu c-myc“. EMBO J.. 25 (10): 2119–30. doi:10.1038 / sj.emboj.7601101. PMC 1462968. PMID 16628215.
- Ko HS, Kim SW, Sriram SR a kol. (2006). „Identifikace proteinu vázajícího se na daleký upstream prvek jako autentického Parkinova substrátu“. J. Biol. Chem. 281 (24): 16193–6. doi:10,1074 / jbc.C600041200. PMID 16672220.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
 | Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to. |