FSCN1 - FSCN1

FSCN1

Protein FSCN1 PDB 1dfc.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
1DFC, 4GP0, 4GP3, 3P53, 4GOY, 4GOV, 3LLP

Identifikátory

FSCN1, FAN1, HSN, SNL, p55, protein vázající aktin 1

Externí ID

OMIM: 602689 MGI: 1352745 HomoloGene: 48164 Genové karty: FSCN1

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 7 (lidský)^[1]

Kapela	7p22.1	Start	5,592,816 bp^[1]
Kapela	7p22.1	Konec	5,606,655 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 5 (myš)^[2]

Kapela	5 G2 \| 5 81,84 cM	Start	142,960,343 bp^[2]
Kapela	5 G2 \| 5 81,84 cM	Konec	142,973,185 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba na bílkoviny, přemostění • vazba aktinového vlákna • GO: 0001948 vazba na proteiny • vazba na léky • aktinová vazba • Vazba RNA • kadherinová vazba
Buněčná složka	• cytoplazma • buněčná projekce • mezibuněčné spojení • filopodium • prohrábnout • myelin • stresové vlákno • mikrovilli • buněčné spojení • Invadopodia • mikrospike • buněčná projekční membrána • aktinový cytoskelet • podosomy • extracelulární exosom • cytoskelet • růstový kužel • lamellipodium • vláknitý aktin • cytosol
Biologický proces	• regulace sestavy microvillus • stanovení apikální / bazální buněčné polarity • regulace organizace aktinového cytoskeletu • organizace aktinových vláken • pohyblivost buněk • pozitivní regulace sestavy podosomu • sestava svazku aktinových vláken • pozitivní regulace demontáže extracelulární matrice • sestava spojení buňka-buňka • montáž mikrospiků • buněčná proliferace • pozitivní regulace sestavy lamellipodia • migrace buněk • pozitivní regulace sestavy filopodia • organizace aktinového cytoskeletu • anatomická struktura morfogeneze • vytvoření nebo udržování polarity buněk • cytokiny zprostředkovanou signální cestu
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


6624


14086


ENSG00000075618


ENSMUSG00000029581


Q16658


Q61553

RefSeq (mRNA)


NM_003088


NM_007984

RefSeq (protein)


NP_003079


NP_032010

Místo (UCSC)

Chr 7: 5,59 - 5,61 Mb

Chr 5: 142,96 - 142,97 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Fascin je protein že u lidí je kódován FSCN1 gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

FSCN1 bylo prokázáno komunikovat s Receptor nervového růstového faktoru s nízkou afinitou^[8] a PKC alfa.^[9]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000075618 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000029581 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Duh FM, Latif F, Weng Y, Geil L, Modi W, Stackhouse T, Matsumura F, Duan DR, Linehan WM, Lerman MI (září 1994). "cDNA klonování a exprese lidského homologu mořského ježka fascinuje a Drosophila zpívá geny, které kódují protein vázající aktin". DNA Cell Biol. 13 (8): 821–7. doi:10.1089 / dna.1994.13.821. PMID 8068206.
^ Tubb BE, Bardien-Kruger S, Kashork CD, Shaffer LG, Ramagli LS, Xu J, Siciliano MJ, Bryan J (červenec 2000). "Charakterizace lidského retinálního fascinujícího genu (FSCN2) v 17q25: úzká fyzická vazba fascinujících a cytoplazmatických aktinových genů". Genomika. 65 (2): 146–56. doi:10,1006 / geno.2000.6156. PMID 10783262.
^ "Entrez Gene: FSCN1 fascinující homolog 1, protein vázající aktiny (Strongylocentrotus purpuratus)".
^ Shonukan O, Bagayogo I, McCrea P, Chao M, Hempstead B (červen 2003). „Migrace buněk melanomu vyvolaná neurotropinem je zprostředkována fascinujícím proteinem vázajícím aktin“. Onkogen. 22 (23): 3616–23. doi:10.1038 / sj.onc.1206561. PMID 12789270.
^ Anilkumar N, Parsons M, Monk R, Ng T, Adams JC (říjen 2003). „Interakce fascinující a proteinové kinázy Ca: nový průnik v buněčné adhezi a motilitě“. EMBO J.. 22 (20): 5390–402. doi:10.1093 / emboj / cdg521. PMC 213775. PMID 14532112.

Další čtení

Dawson SJ, White LA (1992). „Léčba endokarditidy Haemophilus aphrophilus ciprofloxacinem“. J. Infect. 24 (3): 317–20. doi:10.1016 / S0163-4453 (05) 80037-4. PMID 1602151.
Yamashiro-Matsumura S, Matsumura F (1985). "Čištění a charakterizace 55-kilodaltonového proteinu svazujícího F-aktiny z buněk HeLa". J. Biol. Chem. 260 (8): 5087–97. PMID 3886649.
Mosialos G, Yamashiro S, Baughman RW, Matsudaira P, Vara L, Matsumura F, Kieff E, Birkenbach M (1994). „Infekce virem Epstein-Barrové indukuje expresi nového genu kódujícího evolučně konzervovaný protein vážící 55 kilodaltonů na aktin v B lymfocytech“. J. Virol. 68 (11): 7320–8. doi:10.1128 / JVI.68.11.7320-7328.1994. PMC 237173. PMID 7933116.
Mosialos G, Birkenbach M, Ayehunie S, Matsumura F, Pinkus GS, Kieff E, Langhoff E (1996). „Cirkulující lidské dendritické buňky odlišně exprimují vysoké hladiny proteinu vázajícího aktin 55 kd“. Dopoledne. J. Pathol. 148 (2): 593–600. PMC 1861678. PMID 8579121.
Yamakita Y, Ono S, Matsumura F, Yamashiro S (1996). „Fosforylace lidské fascinace inhibuje jeho aktivity vázání aktinů a svazování“. J. Biol. Chem. 271 (21): 12632–8. doi:10.1074 / jbc.271.21.12632. PMID 8647875.
Lin XH, Grako KA, Burg MA, Stallcup WB (1997). „NG2 proteoglykan a protein vázající aktin definují oddělené populace filopodií a lamellipodií obsahujících aktin během šíření a migrace buněk“. Mol. Biol. Buňka. 7 (12): 1977–93. doi:10,1091 / mbc.7.12.1977. PMC 276044. PMID 8970159.
Ono S, Yamakita Y, Yamashiro S, Matsudaira PT, Gnarra JR, Obinata T, Matsumura F (1997). "Identifikace oblasti vázající aktin a místo fosforylace proteinkinázy C na lidské fascinaci". J. Biol. Chem. 272 (4): 2527–33. doi:10.1074 / jbc.272.4.2527. PMID 8999969.
Pinkus GS, Pinkus JL, Langhoff E, Matsumura F, Yamashiro S, Mosialos G, Said JW (1997). „Fascin, nový citlivý marker pro Reed-Sternbergovy buňky Hodgkinovy nemoci. Důkaz pro derivaci dendritických nebo B buněk?“. Dopoledne. J. Pathol. 150 (2): 543–62. PMC 1858289. PMID 9033270.
Ross R, Ross XL, Schwing J, Längin T, Reske-Kunz AB (1998). „Fascinující protein vázající aktiny se podílí na tvorbě dendritických procesů ve zrání epidermálních Langerhansových buněk“. J. Immunol. 160 (8): 3776–82. PMID 9558080.
Sonderbye L, Meehan S, Palsson R, Ahsan N, Ladefoged J, Langhoff E (1998). "Imunohistochemická studie proteinu vázajícího aktin (p55) v lidské ledvině". Transplantace. 65 (7): 1004–8. doi:10.1097/00007890-199804150-00025. PMID 9565110.
Kempf W, Levi E, Kamarashev J, Kutzner H, Pfeifer W, Petrogiannis-Haliotis T, Burg G, Kadin ME (2003). "Fascinová exprese u CD30-pozitivních kožních lymfoproliferativních poruch". J. Cutan. Pathol. 29 (5): 295–300. doi:10.1034 / j.1600-0560.2002.290507.x. PMID 12100631. S2CID 31623792.
Goncharuk VN, Ross JS, Carlson JA (2003). "Aktin vázající protein fascinující exprese v neoplasii kůže". J. Cutan. Pathol. 29 (7): 430–8. doi:10.1034 / j.1600-0560.2002.290708.x. PMID 12139639. S2CID 26565797.
Pelosi G, Pastorino U, Pasini F, Maissoneuve P, Fraggetta F, Iannucci A, Sonzogni A, De Manzoni G, Terzi A, Durante E, Bresaola E, Pezzella F, Viale G (2003). „Nezávislá prognostická hodnota fascinující imunoreaktivity v I. stupni nemalobuněčného karcinomu plic“. Br. J. Cancer. 88 (4): 537–47. doi:10.1038 / sj.bjc.6600731. PMC 2377175. PMID 12592367.
Shonukan O, Bagayogo I, McCrea P, Chao M, Hempstead B (2003). „Migrace buněk melanomu vyvolaná neurotropinem je zprostředkována fascinujícím proteinem vázajícím aktin“. Onkogen. 22 (23): 3616–23. doi:10.1038 / sj.onc.1206561. PMID 12789270.
Bros M, Ross XL, Pautz A, Reske-Kunz AB, Ross R (2003). „Promotor lidského fascinujícího genu je vysoce aktivní ve zralých dendritických buňkách díky zesilovači specifickému pro daný stupeň“. J. Immunol. 171 (4): 1825–34. doi:10,4049 / jimmunol.171.4.1825. PMID 12902483.
Anilkumar N, Parsons M, Monk R, Ng T, Adams JC (2004). „Interakce fascinující a proteinové kinázy Ca: nový průnik v buněčné adhezi a motilitě“. EMBO J.. 22 (20): 5390–402. doi:10.1093 / emboj / cdg521. PMC 213775. PMID 14532112.
Ishikawa R, Sakamoto T, Ando T, Higashi-Fujime S, Kohama K (2003). „Polarizované svazky aktinů vytvořené lidským fascinátem 1: jejich klouzání a demontáž na myosinu II a myosinu V in vitro“. J. Neurochem. 87 (3): 676–85. doi:10.1046 / j.1471-4159.2003.02058.x. PMID 14535950. S2CID 927239.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.