FBXO4 - FBXO4

FBXO4
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3L2O, 3L82
Identifikátory
Aliasy	FBXO4, FBX4, F-box protein 4
Externí ID	OMIM: 609090 MGI: 2146220 HomoloGene: 8134 Genové karty: FBXO4
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	41,941,743 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita homodimerizace proteinu; • GO: 1904264, GO: 1904822, GO: 0090622, GO: 0090302 aktivita ubikvitinové proteinové ligázy; • aktivita ubikvitin-protein transferázy;
Buněčná složka	• komplex ubikvitin ligázy; • cytosol; • Komplex ubikvitin ligázy SCF; • cytoplazma;
Biologický proces	• SCF-závislý proteazomální ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • údržba telomer; • pozitivní regulace ubikvitinace bílkovin; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • polyubikvitinace bílkovin; • běžná proliferace myeloidních progenitorových buněk; • destabilizace bílkovin; • pozitivní regulace polyubikvitinace bílkovin; • stárnutí; • negativní regulace proliferace fibroblastů; • buněčná reakce na ionizující záření; • buněčná homeostáza; • regulace kontrolního bodu poškození DNA; • negativní regulace lokalizace proteinu do jádra; • posttranskripční regulace genové exprese; • ubikvitinace bílkovin; • regulace stability proteinu; • pozitivní regulace udržování telomer prostřednictvím telomerázy; • posttranslační modifikace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	26272
	106052
	ENSG00000151876
	ENSMUSG00000022184
	Q9UKT5
	Q8CHQ0
	NM_001297437; NM_012176; NM_033484
	NM_134099
	NP_001284366; NP_036308; NP_277019
	NP_598860
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

F-box pouze protein 4 je protein že u lidí je kódován FBXO4 gen.^[4]^[5]^[6]

Funkce

Tento gen kóduje člena rodiny proteinů F-box, který se vyznačuje přibližně 40 aminokyselinovým motivem, F-boxem. F-box proteiny tvoří jednu ze čtyř podjednotek ubikvitin ligáza komplex zvaný SCF (SKP1-cullin-F-box), které fungují v fosforylace -závislá ubikvitinace. F-box proteiny jsou rozděleny do 3 tříd: Fbws obsahující WD-40 domény, Fbls obsahující repetice bohaté na leucin a Fbxs obsahující buď různé moduly interakce protein-protein nebo žádné rozpoznatelné motivy. Protein kódovaný tímto genem patří do třídy Fbxs. Alternativní sestřih tohoto genu generuje 2 varianty transkriptu.^[6]

Interakce

FBXO4 bylo prokázáno komunikovat s:

CUL1,^[4]^[7] a
SKP1A.^[7]^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000151876 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (prosinec 1999). "Identifikace rodiny lidských proteinů F-boxu". Curr Biol. 9 (20): 1177–9. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2. PMID 10531035. S2CID 7467493.
^ Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (prosinec 1999). "Rodina savčích proteinů F-boxu". Curr Biol. 9 (20): 1180–2. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4. PMID 10531037. S2CID 14341845.
^ ^A ^b "Entrez Gene: FBXO4 F-box protein 4".
^ ^A ^b Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
^ Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (říjen 1999). "Identifikace rodiny lidských proteinů F-boxu". Curr. Biol. 9 (20): 1177–9. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2. PMID 10531035. S2CID 7467493.

Další čtení

Chiaur DS, Murthy S, Cenciarelli C, Parks W, Loda M, Inghirami G, Demetrick D, Pagano M (2000). „Pět lidských genů kódujících proteiny F-boxu: mapování a analýza chromozomů v lidských nádorech“. Cytogenet. Cell Genet. 88 (3–4): 255–8. doi:10.1159/000015532. PMID 10828603. S2CID 431704.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Jin J, Cardozo T, Lovering RC, Elledge SJ, Pagano M, Harper JW (2005). "Systematická analýza a nomenklatura savčích proteinů F-boxu". Genes Dev. 18 (21): 2573–80. doi:10.1101 / gad.1255304. PMC 525538. PMID 15520277.
Lee TH, Perrem K, Harper JW, Lu KP, Zhou XZ (2006). „Protein F-box FBX4 cílí na PIN2 / TRF1 pro degradaci zprostředkovanou ubikvitinem a reguluje údržbu telomer“. J. Biol. Chem. 281 (2): 759–68. doi:10,1074 / jbc.M509855200. PMID 16275645.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Diverzifikace transkripční modulace: identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů ve velkém měřítku“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Liu Y, Hedvat CV, Mao S, Zhu XH, Yao J, Nguyen H, Koff A, Nimer SD (2006). „ETS Protein MEF je regulován fosforylačně závislou proteolýzou prostřednictvím SCFSkp2 protein-ubikvitinová ligáza“. Mol. Buňka. Biol. 26 (8): 3114–23. doi:10.1128 / MCB.26.8.3114-3123.2006. PMC 1446966. PMID 16581786.
Lin DI, Barbash O, Kumar KG, Weber JD, Harper JW, Klein-Szanto AJ, Rustgi A, Fuchs SY, Diehl JA (2006). "Fosforylace závislá ubikvitinace cyklinu D1 komplexem SCFFBX4-αBcrystallin". Mol. Buňka. 24 (3): 355–66. doi:10.1016 / j.molcel.2006.09.007. PMC 1702390. PMID 17081987.
Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000151876 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10531035-4] A ^b Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (prosinec 1999). "Identifikace rodiny lidských proteinů F-boxu". Curr Biol. 9 (20): 1177–9. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2. PMID 10531035. S2CID 7467493.

[pmid10531037-5] Winston JT, Koepp DM, Zhu C, Elledge SJ, Harper JW (prosinec 1999). "Rodina savčích proteinů F-boxu". Curr Biol. 9 (20): 1180–2. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4. PMID 10531037. S2CID 14341845.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: FBXO4 F-box protein 4".

[pmid17353931-7] A ^b Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3: 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

[autogenerated1-8] Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (říjen 1999). "Identifikace rodiny lidských proteinů F-boxu". Curr. Biol. 9 (20): 1177–9. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2. PMID 10531035. S2CID 7467493.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]