FBXL5 - FBXL5 - Wikipedia

FBXL5
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	3U9J, 3U9M, 3V5X, 3V5Y, 3V5Z
Identifikátory
Aliasy	FBXL5, FBL4, FBL5, FLR1, F-box a protein bohatý na leucin 5, F-box a protein bohatý na leucin 5
Externí ID	OMIM: 605655 MGI: 2152883 HomoloGene: 8129 Genové karty: FBXL5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 4 (lidský)
Konec	15,681,679 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 5 (myš)
Konec	43,821,638 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů železa; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba kovových iontů; • aktivita ubikvitin-protein transferázy;
Buněčná složka	• komplex ubikvitin ligázy; • cytoplazma; • Komplex ubikvitin ligázy SCF; • perinukleární oblast cytoplazmy; • cytosol;
Biologický proces	• SCF-závislý proteazomální ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • ubikvitinace bílkovin; • homeostáza iontů železa; • polyubikvitinace bílkovin; • homeostáza buněčných iontů železa; • posttranslační modifikace; • ubikvitin-dependentní proteinový katabolický proces; • pozitivní regulace katabolického procesu buněčných bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	26234
	242960
	ENSG00000118564
	ENSMUSG00000039753
	Q9UKA1
	Q8C2S5
	NM_001193534; NM_001193535; NM_012161
	NM_001159963; NM_178729
	NP_001180463; NP_001180464; NP_036293
	NP_001153435; NP_848844
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

F-box / LRR-opakující se protein 5 je protein že u lidí je kódován FBXL5 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje člena F-box protein rodina, která se vyznačuje přibližně 40 aminokyselinovým motivem, F-boxem. Proteiny F-boxu tvoří jednu ze čtyř podjednotek komplexu ubikvitinové proteinové ligázy zvané SCF (SKP1-cullin-F-box), které fungují v ubikvitinaci závislé na fosforylaci. F-box proteiny jsou rozděleny do 3 tříd: Fbws obsahující domény WD-40, Fbls obsahující repetice bohaté na leucin a Fbxs obsahující buď různé moduly interakce protein-protein nebo žádné rozpoznatelné motivy. Protein kódovaný tímto genem patří do třídy Fbls a kromě F-boxu obsahuje několik opakování bohatých na tandemový leucin. Alternativní sestřih tohoto genu generuje 2 varianty transkriptu.^[6]

FBXL5 je snímač železa. Podporuje to IRP2 ubikvitinace a její degradace.

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000118564 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039753 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (prosinec 1999). "Identifikace rodiny lidských proteinů F-boxu". Curr Biol. 9 (20): 1177–9. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2. PMID 10531035. S2CID 7467493.
^ ^A ^b „Entrez Gene: FBXL5 F-box a leucin bohatý na opakující se protein 5“.

Další čtení

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY a kol. (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC a kol. (1997). "Sekvenování cDNA ve velkém měřítku". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Winston JT, Koepp DM, Zhu C a kol. (1999). "Rodina savčích proteinů F-boxu". Curr. Biol. 9 (20): 1180–2. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80021-4. PMID 10531037. S2CID 14341845.
Ilyin GP, Rialland M, Pigeon C, Guguen-Guillouzo C (2001). "cDNA klonování a analýza exprese nových členů savčí rodiny proteinů F-box". Genomika. 67 (1): 40–7. doi:10.1006 / geno.2000.6211. PMID 10945468.
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonování DNA pomocí in vitro specifické specifické rekombinace“. Genome Res. 10 (11): 1788–95. doi:10,1101 / gr. 143000. PMC 310948. PMID 11076863.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Wiemann S, Arlt D, Huber W a kol. (2004). „Od ORFeome k biologii: potrubí funkční genomiky“. Genome Res. 14 (10B): 2136–44. doi:10,1101 / gr. 2576704. PMC 528930. PMID 15489336.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I a kol. (2006). „Databáze LIFEdb v roce 2006“. Nucleic Acids Res. 34 (Problém s databází): D415–8. doi:10.1093 / nar / gkj139. PMC 1347501. PMID 16381901.
Zhang N, Liu J, Ding X a kol. (2007). "FBXL5 interaguje s p150Glued a reguluje jeho ubikvitinaci". Biochem. Biophys. Res. Commun. 359 (1): 34–9. doi:10.1016 / j.bbrc.2007.05.068. PMID 17532294.

Tento článek o gen na lidský chromozom 4 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000118564 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000039753 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10531035-5] Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (prosinec 1999). "Identifikace rodiny lidských proteinů F-boxu". Curr Biol. 9 (20): 1177–9. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80020-2. PMID 10531035. S2CID 7467493.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: FBXL5 F-box a leucin bohatý na opakující se protein 5“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]