FASTKD5 - FASTKD5

FASTKD5
Identifikátory
AliasyFASTKD5, dJ1187M17.5, FAST kinázové domény 5
Externí IDOMIM: 614272 MGI: 2139469 HomoloGene: 36400 Genové karty: FASTKD5
Umístění genu (člověk)
Chromozom 20 (lidský)
Chr.Chromozom 20 (lidský)[1]
Chromozom 20 (lidský)
Genomické umístění pro FASTKD5
Genomické umístění pro FASTKD5
Kapela20p13Start3,146,519 bp[1]
Konec3,159,865 bp[1]
Ortology
DruhČlověkMyš
Entrez

60493

380601

Ensembl

ENSG00000215251

ENSMUSG00000079043

UniProt

Q7L8L6

Q7TMV3

RefSeq (mRNA)

NM_021826

NM_001146084
NM_198176
NM_001377124
NM_001377125

RefSeq (protein)

NP_068598

NP_001139556
NP_937819
NP_001364053
NP_001364054

Místo (UCSC)Chr 20: 3,15 - 3,16 MbChr 2: 130,61 - 130,63 Mb
PubMed Vyhledávání[3][4]
Wikidata
Zobrazit / upravit člověkaZobrazit / upravit myš

Protein obsahující FAST kinázovou doménu 5 (FASTKD5) je a protein že u lidí je kódován FASTKD5 gen na chromozomu 20.[5][6] Tento protein je součástí rodiny FASTKD, která je známá pro regulaci energetické rovnováhy mitochondrie ve stresu.[7][8] FASTKD5 je také vyžadován pro granule RNA ke zpracování prekurzorových mRNA, které nejsou ohraničeny tRNA.[9]

Struktura

FASTKD5 sdílí strukturní charakteristiky rodiny FASTKD, včetně aminoterminální mitochondriální cílené domény a tří C-terminál domény: dvě domény podobné FAST kinázám (FAST_1 a FAST_2) a doména vázající RNA (RAP).[7][8] Doména cílení mitochondrií směruje import FASTKD5 do mitochondrií. I když funkce C-koncových domén nejsou známy, RAP pravděpodobně váže RNA během trans-sestřihu.[7] Tento protein tvoří 103 kDa proteinový komplex s neidentifikovanými proteiny.[9]

Funkce

Jako člen rodiny FASTKD se FASTKD5 lokalizuje do mitochondrií za účelem modulace jejich energetické bilance, zejména za stresových podmínek. Ačkoli se FASTKD5 všudypřítomně exprimuje ve všech tkáních, objevuje se hojněji v kosterním svalu, srdečním svalu a dalších tkáních obohacených o mitochondrie.[7] FASTKD5 se také lokalizuje na granule RNA, které obsahují membránová těla mRNA a přidružené proteiny vázající RNA, kde usnadňují posttranskripční zpracování RNA. Tento protein je nezbytný pro zrání prekurzorových mRNA, které nejsou ohraničeny tRNA, a nelze je tedy zpracovat kanonickou cestou zrání mRNA.[9]

Klinický význam

Ačkoli vazba na FASTKD5 zůstává necharakterizovaná, akumulace abnormálních granulí RNA může vést k některým neurodegenerativní onemocnění.[9]

Interakce

FASTKD5 bylo prokázáno komunikovat s:

Reference

  1. ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000215251 - Ensembl, Květen 2017
  2. ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000079043 - Ensembl, Květen 2017
  3. ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  4. ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
  5. ^ UniProt: Q7L8L6
  6. ^ „Entrez Gene: FAST kinase domains 5“.
  7. ^ A b C d Simarro M, Gimenez-Cassina A, Kedersha N, Lazaro JB, Adelmant GO, Marto JA, Rhee K, Tisdale S, Danial N, Benarafa C, Orduña A, Anderson P (říjen 2010). „Protein 3 obsahující rychlou kinázovou doménu je mitochondriální protein nezbytný pro buněčné dýchání“. Sdělení o biochemickém a biofyzikálním výzkumu. 401 (3): 440–6. doi:10.1016 / j.bbrc.2010.09.075. PMC  2963690. PMID  20869947.
  8. ^ A b Yeung KT, Das S, Zhang J, Lomniczi A, Ojeda SR, Xu CF, Neubert TA, Samuels HH (červen 2011). „Nový transkripční komplex, který selektivně moduluje apoptózu buněk rakoviny prsu prostřednictvím regulace FASTKD2“. Molekulární a buněčná biologie. 31 (11): 2287–98. doi:10.1128 / MCB.01381-10. PMC  3133243. PMID  21444724.
  9. ^ A b C d E F G Antonička H, ​​Shoubridge EA (únor 2015). „Mitochondriální RNA granule jsou centry pro posttranskripční zpracování RNA a biogenezi ribozomu“. Zprávy buněk. 10 (6): 920–932. doi:10.1016 / j.celrep.2015.01.030. PMID  25683715.