Erik van Nimwegen - Erik van Nimwegen
Erik van Nimwegen | |
---|---|
![]() Erik van Nimwegen (2011) | |
narozený | |
Národnost | holandský |
Vědecká kariéra | |
Pole | Výpočetní biologie |
Instituce | University of Amsterdam, Institut Santa Fe, Utrechtská univerzita, Rockefellerova univerzita, Švýcarský institut pro bioinformatiku, Biozentrum University of Basel |
Erik van Nimwegen (narozen 5. listopadu 1970 v Amsterdam, Holandsko ) je nizozemský výpočetní biolog a Profesor na Biozentrum z University of Basel, Švýcarsko.[1]
Život
Erik van Nimwegen studoval teoretickou fyziku na University of Amsterdam. Doktorské studium absolvoval na Institut Santa Fe (SFI) v Santa Fe v Novém Mexiku, který získal doktorát na Biologické fakultě v Utrechtská univerzita v roce 1999. Poté následoval rok postdoktorandského studia na SFI a tři roky jako stážista v Centru studií fyziky a biologie na Rockefellerova univerzita, New York. Od roku 2003 je profesorem výpočetní biologie na VŠE Biozentrum univerzity v Basileji,[2] a vedoucí skupiny na Švýcarský institut pro bioinformatiku od roku 2004.[3]
Práce
Hlavní výzkumná témata Erika van Nimwegena se týkají genom vývoj a funkce a vývoj regulace sítí kterými buňky exprese kontrolního genu.[4][5] Vyvíjí matematické modely pro analýzu toho, jak se regulační sítě vyvíjejí a fungují, a výpočetní metody pro rekonstrukci těchto sítí z velkých souborů biologických dat. Práce Van Nimwegena zahrnuje obecný model pro vývoj odolnosti proti mutace a identifikace řady univerzálních zákonů o škálování evoluce genomu.[6] Dalšími výzkumnými tématy jsou vývoj obecných Bayesovské metody pro transkripční faktor a miRNA predikce vazebného místa i modely pro odvození regulačních sítí z genomové exprese a chromatin údaje o stavu.[7]
Ceny a vyznamenání
Od roku 2010 Člen redakční rady časopisu PLoS výpočetní biologie.[8]
externí odkazy
Reference
- ^ „Knowledia Eric van Nimwegen“. knowledia.com. Citováno 2020-08-03.
- ^ "Životopis". Biozentrum.unibas.ch. Citováno 2014-06-24.
- ^ „Skupina SIB E. van Nimwegen“. isb-sib.ch. Citováno 2014-04-28.
- ^ „ISMARA: Automatizované modelování genomových signálů jako demokracie regulačních motivů“. genome.cshlp.org. Citováno 2014-04-28.
- ^ „Expresní šum usnadňuje vývoj genové regulace“. biorxiv.org. Citováno 2020-08-03.
- ^ „Neutrální vývoj mutační robustnosti“. pnas.org. Citováno 2020-08-03.
- ^ „ISMARA: automatizované modelování genomových signálů jako demokracie regulačních motivů“. nih.gov. Citováno 2020-08-03.
- ^ „Redakční rada výpočetní biologie PLOS“. ploscompbiol.org. Citováno 2014-04-28.