Virus Epstein – Barr, malá nukleolární RNA 1 - Epstein–Barr virus small nucleolar RNA 1
| Lidský herpesvirus 1 malá nukleolární RNA | |
|---|---|
 Sekvenční konzervace v-snoRNA1 | |
| Identifikátory | |
| Symbol | v-snoRNA1 |
| Rfam | RF01516 |
| Další údaje | |
| RNA typ | snoRNA |
| PDB struktur | PDBe |
V-snoRNA1 je krabička CD-snoRNA[je zapotřebí objasnění ] identifikováno v B lymfocyty infikován Virus Epstein – Barr (lidský herpesvirus 4 (HHV-4)).[1] Tato snoRNA je prvním známým příkladem snoRNA exprimované z virového genomu.[2] Je homologní k eukaryotický snoRNA, protože obsahuje motivy sekvencí C a D boxů[je zapotřebí objasnění ] ale postrádá terminál kmenová smyčka struktura. The nukleolární lokalizace v-snoRNA1 byla stanovena pomocí hybridizace in situ. V-snoRNA1 se může formovat do a ribonukleoprotein komplex (snoRNP) as koimunoprecipitace (CoIP) testy ukázaly, že tato snoRNA interaguje s jádrovými proteiny snoRNA, fibrillarin, Nop56, Nop58.[je zapotřebí objasnění ] Rovněž bylo navrženo, že tato snoRNA může působit jako a miRNA prekurzor, který je zpracován na fragmenty RNA o velikosti 24 nukleotidů, které cílí na 3 'UTR[je zapotřebí objasnění ] virové DNA polymeráza mRNA.[1]
Viz také
Reference
- ^ A b Hutzinger R, Feederle R, Mrazek J, Schiefermeier N, Balwierz PJ, Zavolan M, Polacek N, Delecluse HJ, Hüttenhofer A (srpen 2009). Cullen BR (ed.). "Exprese a zpracování malé nukleolární RNA z genomu viru Epstein-Barr". PLOS patogeny. 5 (8): e1000547. doi:10.1371 / journal.ppat.1000547. PMC 2718842. PMID 19680535.
- ^ Gardner PP, Bateman A, Poole AM (2010). „SnoPatrol: kolik genů snoRNA existuje?“. Journal of Biology. 9 (1): 4. doi:10,1186 / jbiol211. PMC 2871523. PMID 20122292.