Epichloë festucae - Epichloë festucae

Epichloë festucae
Epichloe festucae Fl1 mycelium.jpg
Vědecká klasifikace Upravit
Království:Houby
Divize:Ascomycota
Třída:Sordariomycetes
Objednat:Hypocreales
Rodina:Clavicipitaceae
Rod:Epichloë
Druh:
E. festucae
Binomické jméno
Epichloë festucae
Leuchtm., Schardl & M.R. Siegel
Synonyma
  • Acremonium lolii (tak jako Acremonium loliae) Latch, M. J. Chr. & Samuels
  • Neotyphodium lolii (Latch, M. J. Chr. & Samuels) Glenn, C. W. Bacon a Hanlin

Epichloë festucae je systémový a přenosný na semeno endofytický houba chladných sezónních trav.[1]

Poprvé popsáno v roce 1994,[2] Epichloë festucae je sesterská linie Epichloë amarillans, Epichloë baconii, Epichloë mollis a Epichloë stromatolonga. Epichloë festucae se vyskytuje v Severní Americe, kde žije v travních druzích Bromus kalmii a Elymus spp. (počítaje v to Elymus patula ).

Genom

Kompletní genom posloupnost Epichloë festucae, první úplná sekvence genomu jakéhokoli druhu v rodu Epichloë, byl hlášen v roce 2018. Genom 35 Mb obsahuje 7 chromozomů v rozmezí od 3,2 do 7,8 Mb, včetně přibližně 9 000 genů.[3]

Odrůdy

Epichloë festucae kmeny mohou mít jak sexuální reprodukční morph (teleomorph ) a nepohlavní reprodukční morph (anamorf ). U této skupiny byly formy anamorfů dlouho klasifikovány samostatně: zpočátku v rodu Akremonium,[4] a po roce 1996 v novém rodu Neotyphodium.[5] Od roku 2011 nomenklaturní kód požaduje, aby se pro všechny fáze vývoje druhů hub používalo jedno jméno a po taxonomické revizi rodu Epichloë v roce 2014 asexuální formy Epichloë festucae jsou nyní klasifikovány jako Epichloë festucae var. lolii.[1]

Nalezeno v Evropě, Asii a severní Africe a představeno v Nový Zéland, Austrálie a jinde, Epichloë festucae var. lolii je spojován s travními druhy Lolium perenne subsp. perenne.

Reference

  1. ^ A b Leuchtmann, A .; Bacon, C. W .; Schardl, C.L .; White, J. F .; Tadych, M. (2014). "Nomenklaturní přeladění Neotyphodium druhy s rodem Epichloë". Mykologie. 106 (2): 202–215. doi:10.3852/13-251. PMID  24459125. S2CID  25222557.
  2. ^ Leuchtmann, Adrian; Schardl, Christopher L .; Siegel, Malcolm R. (1994). "Sexuální kompatibilita a taxonomie nového druhu Epichloë symbiotický s jemnými travami kostřavy ". Mykologie. 86 (6): 802–812. doi:10.1080/00275514.1994.12026487. ISSN  0027-5514.
  3. ^ Winter, David J .; Ganley, Austen R. D .; Young, Carolyn A .; Liachko, Ivan; Schardl, Christopher L .; Dupont, Pierre-Yves; Berry, Daniel; Ram, Arvina; Scott, Barry; Cox, Murray P. (2018). „Opakující se prvky organizují strukturu 3D genomu a zprostředkovávají transkripci ve vláknité houbě Epichloë festucae". Genetika PLOS. 14 (10): e1007467. doi:10.1371 / journal.pgen.1007467. ISSN  1553-7404. PMID  30356280.
  4. ^ Morgan-Jones, G .; Gams, W. (1982). „Poznámky k hyphomycetes. XLI. Endofyt z Festuca arundinacea a anamorf z Epichloe typhina, nové taxony v jedné ze dvou nových částí Akremonium". Mycotaxon. 15: 311–318.
  5. ^ Glenn AE, Bacon CW, Price R, Hanlin RT (1996). "Molekulární fylogeneze Akremonium a jeho taxonomické důsledky ". Mykologie. Mykologická společnost Ameriky. 88 (3): 369–383. doi:10.2307/3760878. JSTOR  3760878.