Earlhamův institut - Earlham Institute - Wikipedia

Earlhamův institut
Logo Earlham Institute.png
MottoDekódování živých systémů
Založeno3. července 2009[1]
Oblast výzkumu
ŘeditelProfesor Neil Hall
AdresaNorwich Research Park
UmístěníColney, Norfolk, Anglie
Souřadnice: 52 ° 37'37 ″ severní šířky 1 ° 13'08 ″ východní délky / 52,6269 ° N 1,219 ° E / 52.6269; 1.219
NR4 7UZ
Přidružení
Provozní agentura
webová stránkawww.earlham.ac.Spojené království

Earlhamův institut (EI, dříve Centrum pro analýzu genomu (TGAC)[2]) je institut pro výzkum biologických věd se sídlem v Norwich Research Park (NRP), Norwich, Anglie. Výzkum společnosti EI se zaměřuje na zkoumání živých systémů pomocí výpočetní vědy a biotechnologie k zodpovězení ambiciózních biologických otázek a generování aktivních zdrojů.

Dějiny

Ústav zřídila Rada pro výzkum v oblasti biotechnologií a biologických věd v partnerství s Agentura pro rozvoj na východ od Anglie (EEDA), Rada hrabství Norfolk, Norwichská městská rada, Rada jižního Norfolku a Větší Norwichské rozvojové partnerství. Stálo to 13,5 milionu GBP a bylo postaveno Morgan Sindall. To bylo oficiálně otevřeno 3. července 2009[1] podle John Sulston, vítěz 2002 Nobelova cena za fyziologii nebo medicínu a bývalý ředitel Wellcome Trust Sanger Institute, další instituce pro výzkum genomiky.[Citace je zapotřebí ]

Na začátku června 2011 představila na svém webu superpočítač s nejvýkonnějším běžícím procesorem na světě Red Hat Linux, se šesti terabajty RAM.[Citace je zapotřebí ] Byl nainstalován, aby rozbil strukturu pšenice genom, který je pětkrát větší než lidský genom.

V červnu 2016 Earlham Institute dokončil rebrandingový projekt, při kterém došlo k přechodu názvu z The Genome Analysis Center (TGAC) na Earlham Institute (EI).[Citace je zapotřebí ]

Struktura

Nachází se na Norwich Research Park, západně od Norwiche na bývalé A47 (B1108 ) a přiléhá na západ od University of East Anglia, vedle River Yare.

Funkce

Cílem tohoto institutu je stát se v popředí vědy náročné na data v biologii, být lídrem v oblasti inovací v bioinformatice a aplikaci genomové technologie a umožnit biologické vědy šířením dat a technologií produkovaných v ústavu a ve spolupráci s externí vědci z celého světa. Specializace projektu zahrnují pšenici a žito, ale širší prováděný výzkum zahrnuje obratlovce, evoluční, environmentální a regulační genomiku, jakož i datovou infrastrukturu a vývoj softwaru na podporu mezinárodní komunity biologických věd. EI provádí svůj výzkum otevřený přístup kde je to možné.

Ředitelé

Earlham Institute režíroval:

  • Prof. Jane Rogersová od července 2009 do prosince 2012;[Citace je zapotřebí ]
  • Prof Mario Caccamo od ledna 2013 do července 2015;[Citace je zapotřebí ]
  • Prof Dylan Edwards od srpna 2015 (prozatímní ředitel)
  • Prof Neil Hall od dubna 2016 (současný ředitel)

Komunikace vědy

Jednou z povinností EI je komunikovat vědu, kterou se zavazuje, širokému spektru publika, jako je mezinárodní vědecká komunita, široká veřejnost, školní děti a studenti. Po celý rok provozuje různé programy, které plní tuto odpovědnost, stejně jako produkuje redakční funkce vysvětlující výzkum, který provádí.

Zařízení

EI má nejmodernější vědecké vzdělávací zařízení, které pomáhá podporovat pořádání workshopů a školení na podporu mezinárodní komunity biologických věd.

Sekvenční platformy

EI je vybaven platformami pro sekvenování a genomiku nové generace pro generování dat s vysokou propustností pro výzkumné projekty. EI byla historicky první osvojitelem nových technologií pro svůj vědecký výzkum, ale také je prostřednictvím své britské komunity biologických věd zpřístupňuje Národní schopnost v genomice.

  • Illuina NovaSeq
  • Illumina HiSeq 2500
  • Illumina MiSeq
  • Illumina iSeq100
  • PacBio pokračování
  • PacBio Sequel II
  • Oxford Nanopore MinION
  • Oxford Nanopore GridION
  • 10X chrom

Pandemická podpora

Vědci z Earlhamova institutu a Quadram Institute pomáhají vyvinout nový nástroj k překladu dynamické komunikace mikrobiom / tělo. Tato metoda by byla užitečná pro vědce, kteří se chtějí dozvědět, jak mikroby ovlivňují bezpečnost, změny přispívající k nemoci a poukazovat na nové cíle pro léky.[3]

externí odkazy

Reference

  1. ^ A b „BBC NEWS | UK | England | Norfolk | Support hope for new genome unit“. Citováno 2012-06-22.
  2. ^ „Earlham Institute - Dekódování živých systémů pro lepší svět“. www.bbsrc.ac.uk. BBSRC. Citováno 30. června 2016.
  3. ^ „Nový nástroj pomáhá překládat složitou komunikaci mezi mikroby a tělem“. News Medical. Citováno 9. června 2020.