ERP29 - ERP29

ERP29
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2QC7
Identifikátory
Aliasy	ERP29, C12orf8, ERp28, ERp31, HEL-S-107, PDI-DB, PDIA9, protein endoplazmatického retikula 29
Externí ID	OMIM: 602287 MGI: 1914647 HomoloGene: 4963 Genové karty: ERP29
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 12 (lidský)
Konec	112,023,449 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• chaperonová vazba; • aktivita homodimerizace proteinu; • aktivita disulfidové isomerázy proteinu; • GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• lumen endoplazmatického retikula; • membrána; • melanosom; • transportní váček; • hladké endoplazmatické retikulum; • povrch buňky; • endoplazmatické retikulum; • extracelulární exosom;
Biologický proces	• pozitivní regulace fosforylace bílkovin; • regulace endoplazmatického retikula vnitřní apoptotické signální dráhy vyvolané stresem; • negativní regulace genové exprese; • sekrece bílkovin; • pozitivní regulace genové exprese; • aktivace aktivity MAPK; • odvíjení bílkovin; • transport intracelulárních proteinů; • negativní regulace sekrece bílkovin; • skládání bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10961
	67397
	ENSG00000089248
	ENSMUSG00000029616
	P30040
	P57759
	NM_006817; NM_001034025
	NM_026129
	NP_001029197; NP_006808
	NP_080405
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Protein endoplazmatického retikula 29 (ERp29) je chaperonový protein že u lidí je kódován ERP29 gen.^[4]

Funkce

ERp29 je retikuloplazmin, protein, který se nachází v lumen endoplazmatické retikulum (ER). Protein vykazuje sekvenční podobnost s protein disulfid-izomeráza rodina.^[5] Nicméně, to postrádá thioredoxin charakteristický pro tuto rodinu, což naznačuje, že tento protein nefunguje jako disulfidová izomeráza.^[5] Protein dimerizuje a předpokládá se, že hraje roli při zpracování sekreční proteiny v rámci ER. Výsledkem alternativního sestřihu je několik variant přepisu kódujících různé izoformy.^[4]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000089248 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ ^A ^b „Entrez Gene: ERP29 protein endoplazmatického retikula 29“.
^ ^A ^b Galligan JJ, Petersen DR (červenec 2012). "Rodina genů lidského disulfidového izomerázy". Lidská genomika. 6 (1): 6. doi:10.1186/1479-7364-6-6. PMC 3500226. PMID 23245351.

Další čtení

Hubbard MJ (září 2002). "Funkční proteomika: brankové čáry se pohybují". Proteomika. 2 (9): 1069–78. doi:10.1002 / 1615-9861 (200209) 2: 9 <1069 :: AID-PROT1069> 3.0.CO; 2-R. PMID 12362325.
Mkrtchian S, Sandalova T (2006). „ERp29, neobvyklý redox-neaktivní člen rodiny thioredoxinů“. Antioxidanty a redoxní signalizace. 8 (3–4): 325–37. doi:10.1089 / ars.2006.8.325. PMID 16677078.
Hochstrasser DF, Frutiger S, Paquet N, Bairoch A, Ravier F, Pasquali C, Sanchez JC, Tissot JD, Bjellqvist B, Vargas R (prosinec 1992). "Mapa lidských jaterních proteinů: referenční databáze vytvořená mikrosekvenováním a gelovým porovnáním". Elektroforéza. 13 (12): 992–1001. doi:10,1002 / elps.11501301201. PMID 1286669. S2CID 23518983.
Hughes GJ, Frutiger S, Paquet N, Pasquali C, Sanchez JC, Tissot JD, Bairoch A, Appel RD, Hochstrasser DF (listopad 1993). "Mapa lidských jaterních proteinů: aktualizace 1993". Elektroforéza. 14 (11): 1216–22. doi:10,1002 / elps.11501401181. PMID 8313870. S2CID 33424554.
Mkrtchian S, Fang C, Hellman U, Ingelman-Sundberg M (leden 1998). "Stres-indukovatelný potkaní jaterní endoplazmatický retikulární protein, ERp29". European Journal of Biochemistry / FEBS. 251 (1–2): 304–13. doi:10.1046 / j.1432-1327.1998.2510304.x. PMID 9492298.
Ferrari DM, Nguyen Van P, Kratzin HD, Söling HD (srpen 1998). „ERp28, lidský endoplazmatický-retikulární-lumenální protein, je členem rodiny protein disulfidových izomeráz, ale postrádá motiv CXXC thioredoxin-box“. European Journal of Biochemistry / FEBS. 255 (3): 570–9. doi:10.1046 / j.1432-1327.1998.2550570.x. PMID 9738895.
Hubbard MJ, McHugh NJ (listopad 2000). "Human ERp29: izolace, primární strukturní charakterizace a dvourozměrné gelové mapování". Elektroforéza. 21 (17): 3785–96. doi:10.1002 / 1522-2683 (200011) 21:17 <3785 :: AID-ELPS3785> 3.0.CO; 2-2. PMID 11271497.
Shnyder SD, Hubbard MJ (duben 2002). „ERp29 je všudypřítomný rezident endoplazmatického retikula s výraznou rolí v produkci sekrečních proteinů“. The Journal of Histochemistry and Cytochemistry. 50 (4): 557–66. doi:10.1177/002215540205000413. PMID 11897809.
Sargsyan E, Baryshev M, Backlund M, Sharipo A, Mkrtchian S (únor 2002). "Genomická organizace a charakterizace promotoru genu kódujícího domnělý chaperon endoplazmatického retikula, ERp29". Gen. 285 (1–2): 127–39. CiteSeerX 10.1.1.593.9369. doi:10.1016 / S0378-1119 (02) 00417-1. PMID 12039039.
Basrur V, Yang F, Kushimoto T, Higashimoto Y, Yasumoto K, Valencia J, Muller J, Vieira WD, Watabe H, Shabanowitz J, Hearing VJ, Hunt DF, Appella E (2003). "Proteomická analýza časných melanosomů: identifikace nových melanosomálních proteinů". Journal of Proteome Research. 2 (1): 69–79. doi:10.1021 / pr025562r. PMID 12643545.
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, Fisk CJ, Li N, Smolyar A, Hill DE, Barabási AL, Vidal M, Zoghbi HY (květen 2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Cheretis C, Dietrich F, Chatzistamou I, Politi K, Angelidou E, Kiaris H, Mkrtchian S, Koutselini H (říjen 2006). „Exprese ERp29, faktoru sekrece endoplazmatického retikula v karcinomu bazálních buněk“. American Journal of Dermatopathology. 28 (5): 410–2. doi:10.1097 / 01.dad.0000211521.49810.ac. PMID 17012915. S2CID 1661765.
Zheng J, Liu X, Yan X, Dai L, Ji C (2006). "Čištění a strukturní charakterizace lidského ERp29". Proteinové a peptidové dopisy. 13 (8): 753–9. doi:10.2174/092986606777841190. PMID 17073718.
Chi A, Valencia JC, Hu ZZ, Watabe H, Yamaguchi H, Mangini NJ, Huang H, Canfield VA, Cheng KC, Yang F, Abe R, Yamagishi S, Shabanowitz J, Hearing VJ, Wu C, Appella E, Hunt DF (Listopad 2006). "Proteomická a bioinformatická charakterizace biogeneze a funkce melanosomů". Journal of Proteome Research. 5 (11): 3135–44. doi:10.1021 / pr060363j. PMID 17081065.
Lippert U, Diao D, Barak NN, Ferrari DM (duben 2007). "Zachované strukturní a funkční vlastnosti D-domény obsahující redox-aktivní a -aktivní protein disulfid isomerase-související proteinové chaperony" (PDF). The Journal of Biological Chemistry. 282 (15): 11213–20. doi:10,1074 / jbc.M604440200. PMID 17296603. S2CID 25822309.

Tento článek o gen na lidský chromozom 12 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000089248 - Ensembl, Květen 2017

[2] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[3] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-4] A ^b „Entrez Gene: ERP29 protein endoplazmatického retikula 29“.

[humgenomics.com-5] A ^b Galligan JJ, Petersen DR (červenec 2012). "Rodina genů lidského disulfidového izomerázy". Lidská genomika. 6 (1): 6. doi:10.1186/1479-7364-6-6. PMC 3500226. PMID 23245351.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]