EDEM2 - EDEM2

EDEM2

Identifikátory

EDEM2, C20orf31, C20orf49, bA4204.1, ER degradace zvyšující alfa-manosidázu jako protein 2

Externí ID

OMIM: 610302 MGI: 1915540 HomoloGene: 10075 Genové karty: EDEM2

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 20 (lidský)^[1]

Kapela	20q11.22	Start	35,115,364 bp^[1]
Kapela	20q11.22	Konec	35,147,336 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 2 (myš)^[2]

Kapela	2 \| 2 H1	Start	155,701,677 bp^[2]
Kapela	2 \| 2 H1	Konec	155,729,475 bp^[2]

Exprese RNA vzor

Další údaje o referenčních výrazech

Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba iontů vápníku • aktivita manosyl-oligosacharidu 1,2-alfa-manosidázy • katalytická aktivita
Buněčná složka	• lumen endoplazmatického retikula • endoplazmatické retikulum • membrána • oddělení kontroly kvality endoplazmatického retikula
Biologický proces	• endoplazmatické retikulum rozložilo proteinovou odpověď • ořezávání manózy zapojené do dráhy ERAD glykoproteinu • Zpracování N-glykanu • pozitivní regulace retrográdního transportu proteinu, ER do cytosolu • reakce na rozvinutý protein • na ubikvitinu závislý glykoprotein ERAD • oříznutí terminální manózy na větvi B. • oříznutí terminální manózy na větvi C. • oříznutí první manózy na větvi A. • oříznutí druhé manózy na větvi A.
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


55741


108687


ENSG00000088298


ENSMUSG00000038312


Q9BV94


Q8BJT9

RefSeq (mRNA)


NM_001145025 NM_018217


NM_145537

RefSeq (protein)


NP_001138497 NP_060687


NP_663512

Místo (UCSC)

Chr 20: 35,12 - 35,15 Mb

Chr 2: 155,7 - 155,73 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

Alfa manosidáza podobná degradaci ER 2 je enzym že u lidí je kódován EDEM2 gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000088298 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000038312 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Mast SW, Diekman K, Karaveg K, Davis A, Sifers RN, Moremen KW (březen 2005). „Lidský EDEM2, nový homolog rodiny 47 glykosidáz, se účastní degradace glykoproteinů související s ER“. Glykobiologie. 15 (4): 421–36. doi:10.1093 / glycob / cwi014. PMID 15537790.
^ Olivari S, Galli C, Alanen H, Ruddock L, Molinari M (leden 2005). „Nová varianta EDEM vyvolaná stresem regulující degradaci glykoproteinu související s endoplazmatickým retikulem“. J Biol Chem. 280 (4): 2424–8. doi:10.1074 / jbc.C400534200. PMID 15579471.
^ „Entrez Gene: EDEM2 ER degradace enhancer, manosidáza alfa-like 2“.

Další čtení

Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY a kol. (1996). „Metoda„ dvojitého adaptéru “pro vylepšenou konstrukci knihovny brokovnic“. Anální. Biochem. 236 (1): 107–13. doi:10.1006 / abio.1996.0138. PMID 8619474.
Yu W, Andersson B, Worley KC a kol. (1997). "Velké zřetězení cDNA sekvenování". Genome Res. 7 (4): 353–8. doi:10,1101 / gr. 7.4.353. PMC 139146. PMID 9110174.
Deloukas P, Matthews LH, Ashurst J a kol. (2002). „Sekvence DNA a komparativní analýza lidského chromozomu 20“. Příroda. 414 (6866): 865–71. doi:10.1038 / 414865a. PMID 11780052.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Clark HF, Gurney AL, Abaya E a kol. (2003). „Iniciativa pro objevování vylučovaných proteinů (SPDI), rozsáhlé úsilí o identifikaci nových lidských vylučovaných a transmembránových proteinů: hodnocení bioinformatiky“. Genome Res. 13 (10): 2265–70. doi:10,1101 / gr. 1293003. PMC 403697. PMID 12975309.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.

Tento článek o gen na lidský chromozom 20 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.