Densovirinae - Densovirinae

Densovirinae
Klasifikace virů E
(bez hodnocení):Virus
Oblast:Monodnaviria
Království:Shotokuvirae
Kmen:Cossaviricota
Třída:Quintoviricetes
Objednat:Piccovirales
Rodina:Parvoviridae
Podčeleď:Densovirinae
Rody

Viz text

Densovirinae[1] je podrodina jednovláknových DNA viry v rodině Parvoviridae.[2][3] Podčeleď má v současné době 8 uznaných rodů a 17 druhů.[4] Je známo, že denzoviry infikují členy hmyzích řádů Blattodea, Dvoukřídlí, Hemiptera, Blanokřídlí, Lepidoptera, a Orthoptera, zatímco některé viry infikují a množí se v korýšech, jako je krevety nebo rak nebo mořské hvězdy z kmene Ostnokožci.[3]

Virologie

Densoviry jsou malé (průměr 18–26 nanometrů) a neobalené. Viriony jsou ikosaedrálního tvaru s triangulačním číslem (T) = 1. Existuje 60 kopie obalového proteinu ve virionu. Každá kopie má tvar popsaný jako "čtyřúhelníkový" kite-formovaný "klín" a vzhled povrchu je drsný s mnoha malými výstupky. Zdá se, že viriony neobsahují lipidy.[5][6]

Genomy jsou nesegmentované, mají délku přibližně 4–6 kilobází a obvykle obsahují dvě nebo tři otevřené čtecí rámce. 5 'otevřený čtecí rámec kóduje dva nestrukturální proteiny (NS-1 a NS-2) a 3' otevřený čtecí rámec kóduje dva nebo tři kapsidové proteiny (VP1, VP2, VP3). 5 'a 3' konce mají vlásenky. Pokud je přítomen třetí otevřený čtecí rámec (záleží na rodu), kóduje druhý nestrukturní protein. Genom je anmbisense, kódující proteiny v pozitivním i negativním směru. Transkripční regulace a post-transkripční modifikace se používají k produkci různých nestrukturálních proteinů a strukturních proteinů.[7][8][9][6]

Viriony vstupující do hostitelské buňky jsou dosaženy připojením k hostitelským receptorům, které mohou být zprostředkovány klatrinem zprostředkovaná endocytóza[10] nebo Clathrin -nezávislý dynamin -závislý endocytóza.[11] Protein NS-1 má nadrodinu 3 DNA helikázy a motiv HuH endonukleázy. Tyto motivy jsou běžné u malých DNA virů. Proteiny, které obsahují tyto motivy, se vážou k virovým počátkům replikace a odvíjejí a přezdívají tyto počátky, což umožňuje přístup proteinů hostitele k virovému genomu po replikace a transkripce. Genom je replikován jedinečným mechanismem vlásenky. Transkripce s templátem DNA, s některým alternativním sestřihovým mechanismem, je způsob transkripce.[3][10]

Taxonomie

V současné době je uznáváno osm rodů, které obsahují 17 druhů:

Ambidensovirus byl dříve uznán jako rod, ale v roce 2019 byl rozdělen do šesti rodů s předponou Aqu-, Blatt-, Hemi-, Pefu-, Proto-, a Scindo-.[12]

Reference

  1. ^ "Podčeleď: Densovirinae". Zpráva ICTV o taxonomii virů (10. zpráva). ICTV. Citováno 13. května 2020.
  2. ^ Cotmore, SF; Agbandje-McKenna, M; Canuti, M; Chiorini, JA; Eis-Hubinger, A; Hughes, J; Mietzsch, M; Modha, S; Ogliastro, M; Pénzes, JJ; Pintel, DJ; Qiu, J; Soderlund-Venermo, M; Tattersall, P; Tijssen, P; a konsorcium zpráv ICTV (2019). „Profil taxonomie virů ICTV: Parvoviridae". Journal of General Virology. 100 (3): 367–368. doi:10.1099 / jgv.0.001212. PMC  6537627. PMID  30672729.
  3. ^ A b C „10. zpráva ICTV (2018) Parvoviridae".
  4. ^ „Virus Taxonomy: 2019 Release“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 8. května 2020.
  5. ^ "Densovirinae". ICTVdB - Univerzální virová databáze, verze 4. Citováno 12. května 2020.
  6. ^ A b Simpson AA, Chipman PR, Baker TS, Tijssen P, Rossmann MG (listopad 1998). „Struktura hmyzu parvoviru (Galleria mellonella densovirus) při rozlišení 3,7 A“. Struktura. 6 (11): 1355–67. doi:10.1016 / S0969-2126 (98) 00136-1. PMC  4167665. PMID  9817847.
  7. ^ Pham HT, Huynh OT, Jousset FX, Bergoin M, Tijssen P (srpen 2013). „Struktura genomu Junonia coenia Densovirus (JcDNV)“. Oznámení o genomu. 1 (4). doi:10.1128 / genomA.00591-13. PMC  3738899. PMID  23929483.
  8. ^ Dumas B, Jourdan M, Pascaud AM, Bergoin M (listopad 1992). „Kompletní nukleotidová sekvence klonovaného infekčního genomu Junonia coenia densovirus odhaluje organizaci jedinečnou mezi parvoviry“. Virologie. 191 (1): 202–22. doi:10.1016 / 0042-6822 (92) 90182-O. PMID  1413502.
  9. ^ Bruemmer A, Scholari F, Lopez-Ferber M, Conway JF, Hewat EA (duben 2005). "Struktura hmyzu parvoviru (Junonia coenia Densovirus) stanovena kryoelektronovou mikroskopií". Journal of Molecular Biology. 347 (4): 791–801. doi:10.1016 / j.jmb.2005.02.009. PMID  15769470.
  10. ^ A b „Virová zóna“. EXPASY. Citováno 12. května 2020.
  11. ^ Wang Y, Gosselin Grenet AS, Castelli I, Cermenati G, Ravallec M, Fiandra L, Debaisieux S, Multeau C, Lautredou N, Dupressoir T, Li Y, Casartelli M, Ogliastro M (listopad 2013). „Densovirus prochází středním střevem hmyzu transcytózou a narušuje funkci epiteliální bariéry“. Journal of Virology. 87 (22): 12380–91. doi:10.1128 / JVI.01396-13. PMC  3807927. PMID  24027326.
  12. ^ „Historie taxonomie ICTV: Ambidensovirus“. talk.ictvonline.org. Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Citováno 12. května 2020.