David Klenerman - David Klenerman
David Klenerman | |
---|---|
narozený | Září 1959 (věk 62)[1] |
Národnost | britský |
Alma mater | Univerzita v Cambridge (MA, PhD) |
Známý jako | Sekvenování barviv Illumina Skenovací iontově-vodivostní mikroskopie Mikroskopie s vysokým rozlišením Solexa |
Ocenění |
|
Vědecká kariéra | |
Pole | Biofyzikální chemie |
Instituce | Univerzita v Cambridge Stanfordská Univerzita |
Teze | Infračervená chemiluminiscence s použitím spektrometru SISAM (1985) |
Doktorský poradce | Ian William Murison Smith |
Ostatní akademičtí poradci | Richard Zare |
webová stránka | klenermangroup |
Sir David Klenerman FRS FMedSci[3][4] (narozen 1959) je Brit biofyzikální chemik a profesor biofyzikální chemie na Ústav chemie na Univerzita v Cambridge[5] a a Chlapík z Kristova vysoká škola v Cambridge.[6] On je nejlépe známý pro jeho příspěvek v oblasti sekvenování nové generace DNA (což následně vyústilo v Solexa, společnost zabývající se vysokorychlostním sekvenováním DNA, kterou spoluzaložil),[1][7][8][9][10] na bázi nanopipet skenovací iontově-vodivostní mikroskopie,[11][12] a mikroskopie s vysokým rozlišením.[13]
Vzdělávání
Klenerman byl vzděláván u Univerzita v Cambridge kde byl vysokoškolským studentem Churchill College, Cambridge a přijal jeho BA stupně v roce 1982.[14] Zasloužil si PhD v oboru chemie v roce 1986 jako postgraduální student Churchill College, Cambridge a byl pod dohledem Ian William Murison Smith.[15][2][14]
Kariéra a výzkum
Po doktorátu Klenerman odešel Stanfordská Univerzita jako Fulbrightův učenec pracovat na chemii vysokých tónů, s Richard Zare. Po jeho postdoktorský výzkum ve Stanfordu se vrátil do Velké Británie pracovat BP Výzkum po dobu sedmi let. Poté, v roce 1994, nastoupil na University of Cambridge jako člen fakulty na katedře chemie a jako člen Christ's College.[2][14][16]
Klenerman, spolu s Shankar Balasubramanian, vynalezl metodu nové generace Sekvenování DNA který je dnes běžně známý jako Solexa sekvenování nebo Sekvenování barviv Illumina.[7][9] Metoda je založena na detekci fluorofor značené nukleotidy, jakmile se začlení do DNA prameny.[17] Toto sekvenování metodou syntézy získalo popularitu,[18][19] a je v současné době považována za nejrozšířenější platformu, která nahrazuje konvenční Sangerovo sekvenování navzdory své relativně nízké schopnosti multiplexování vzorků nabídnout několik klíčových výhod: je automatizovaná, rychlá, vysoce přesná a schopná sekvenovat více řetězců současně prostřednictvím masivní paralelní řazení a ekonomicky levnější v případě sekvenování celého genomu.[20][21][22]
Je také známý zkoumáním nanopipet (na rozdíl od konvenčních mikropipet) skenovací iontově-vodivostní mikroskopie metody.[11][23] Jeho výzkumná skupina byla úspěšná v dosahování topografických obrazů živých buněk s velmi vysokým rozlišením, v zobrazování v režimu hoppingu, v přesném dodávání malých molekul do buňky a ve studiu detailního fungování buněk v reálném čase.[12][24][25]
V poslední době se jeho skupina zaměřuje na 3D mikroskopie s vysokým rozlišením rozvíjet nové poznatky o nesprávné skládání bílkovin a neurodegenerativní onemocnění.[13]
Obchodní činnost
Klenerman a Shankar Balasubramanian komercializovali svůj vynález na vysokorychlostním sekvenování DNA na bázi jedné molekuly a fluorescence a společně založili Solexa v roce 1998. Později, v roce 2007, tuto společnost získala společnost Illumina za 600 milionů dolarů.[7][26][27][28][29]
V roce 2004 Klenerman spoluzakládal další spin-out společnost, Ionscope, dodávat montované skenování iontově-vodivostních mikroskopů výzkumné komunitě, která hledá 3D obrazy živých buněk ve vysokém rozlišení. Podle Rada pro výzkum v oblasti biotechnologií a biologických věd od února 2014 Ionscope prodal 35 jednotek SICM po celém světě.[30]
Ocenění a vyznamenání
Hlavní ocenění a vyznamenání, která Klenerman obdržel jako uznání své výzkumné práce:
- 2007 oceněn RSC Interdisciplinární cena podle Royal Society of Chemistry.[2]
- 2008 dodáno Britská biofyzikální společnost Přednáška na University College v Dublinu.[31]
- 2012 zvolen a Člen Královské společnosti (FRS).[3]
- 2015 zvolen a Člen Akademie lékařských věd (FMedSci).[4]
- 2018 oceněn Královská medaile podle královská společnost.[32]
- 2019 pasován na rytíře v Vyznamenání nového roku 2019 pro služby pro vědu a vývoj vysokorychlostní technologie sekvenování DNA [33]
Reference
- ^ A b „David KLENERMAN - osobní schůzky (bezplatné informace od společnosti Companies House)“. beta.companieshouse.gov.uk.
- ^ A b C d „Vítěz Interdisciplinární ceny 2007“. Royal Society of Chemistry. Citováno 26. ledna 2016.
- ^ A b „David Klenerman: Královská společnost“. Fellows Directory. královská společnost. Citováno 26. ledna 2016.
- ^ A b „Fellow: Academy of Medical Sciences“. Akademie lékařských věd, Velká Británie. Citováno 26. ledna 2016.
- ^ „Profesor David Klenerman FMedSci FRS“. Katedra chemie, University of Cambridge. Univerzita v Cambridge. Citováno 26. ledna 2016.
- ^ „Profesor David Klenerman“. Kristova vysoká škola v Cambridge. Citováno 26. ledna 2016.
- ^ A b C „History of Illumina Sequencing“. Illumina. Citováno 26. ledna 2016.
- ^ Davies, Kevin (7. září 2010). Genom 1 000 $. Svobodný tisk. str.102 –115. ISBN 978-1416569596. Citováno 26. ledna 2016.
- ^ A b Bentley, DR; Balasubramanian, S; Swerdlow, HP; et al. (6. listopadu 2008). „Přesné sekvenování celého lidského genomu pomocí reverzibilní chemie terminátorů“. Příroda. 456 (7218): 53–59. Bibcode:2008Natur.456 ... 53B. doi:10.1038 / nature07517. PMC 2581791. PMID 18987734.
- ^ "Příběh Solexa". Svět bio-IT (Září – říjen 2010). 28. září 2010. Citováno 26. ledna 2016.
- ^ A b „Nanodoodling ukazuje sílu pipety“. BBC novinky. 5. září 2006. Citováno 26. ledna 2016.
- ^ A b „Kreslení pomocí DNA: Nanopipeta umožňuje dodávku biomolekul na povrch řízenou napětím“. Chemické a technické novinky. 83 (44). Americká chemická společnost. 31. října 2005. Citováno 26. ledna 2016.
- ^ A b Sakra, Stefan W .; Sahl, Steffen J .; Bates, Mark; Zhuang, Xiaowei; Heintzmann, Rainer; Booth, Martin J .; Bewersdorf, Joerg; Shtengel, Gleb; Hess, Harald; Tinnefeld, Philip; Honigmann, Alf; Jakobs, Stefan; Testa, Ilaria; Cognet, Laurent; Lounis, Brahim; Ewers, Helge; Davis, Simon J .; Eggeling, Christian; Klenerman, David; Willig, Katrin I .; Vicidomini, Giuseppe; Castello, Marco; Diaspro, Alberto; Cordes, Thorben; Steffen J. Sahl; Tinnefeld, Philip; Klenerman, David; Katrin I Willig (14. října 2015). „Plán pro mikroskopii 2015 s vysokým rozlišením“. Journal of Physics D. 48 (44): 443001. arXiv:1711.04999. Bibcode:2015JPhD ... 48R3001H. doi:10.1088/0022-3727/48/44/443001. S2CID 4804015.
- ^ A b C Anon (2017). „Klenerman, prof. David“. Kdo je kdo. ukwhoswho.com (online Oxford University Press vyd.). A & C Black, otisk Bloomsbury Publishing plc. doi:10,1093 / hm / 9780199540884,013,266724. (předplatné nebo Členství ve veřejné knihovně ve Velké Británii Požadované) (vyžadováno předplatné)
- ^ Klenerman, David (1985). Infračervená chemiluminiscence s použitím spektrometru SISAM. lib.cam.ac.uk (Disertační práce). Univerzita v Cambridge. OCLC 499899771. EThOS uk.bl.ethos.355881.
- ^ „David Klenerman zvolen FRS“. Kristova vysoká škola v Cambridge. Citováno 27. ledna 2016.
- ^ Balasubramanian, Shankar (4. května 2011). „Sekvenování nukleových kyselin: od chemie po medicínu“. Chemická komunikace. 47 (26): 7281–7286. doi:10.1039 / c1cc11078k. PMC 3428630. PMID 21544287.
- ^ Křepelka, Michael A (25. listopadu 2008). „Vylepšení středního genomového systému sekvenčního systému Illumina“. Přírodní metody. 5 (12): 1005–1010. doi:10.1038 / nmeth.1270. PMC 2610436. PMID 19034268.
- ^ Cronn, Richard (27. srpna 2008). „Multiplexní sekvenování rostlinných chloroplastových genomů pomocí technologie sekvenování Solexa podle syntézy“. Výzkum nukleových kyselin. 36 (19): e122. doi:10.1093 / nar / gkn502. PMC 2577356. PMID 18753151. Citováno 29. ledna 2016.
- ^ Metzker, Michael L. (8. prosince 2009). „Sekvenční technologie - nová generace“. Genetika hodnocení přírody. 11 (1): 31–46. CiteSeerX 10.1.1.719.3885. doi:10.1038 / nrg2626. PMID 19997069. S2CID 205484500.
- ^ Pettersson, Erik; Lundeberg, Joakim; Ahmadian, Afshin (2009). "Generace sekvenčních technologií". Genomika. 93 (2): 105–111. doi:10.1016 / j.ygeno.2008.10.003. PMID 18992322.
- ^ Křepelka, Michael A (24. července 2012). „Příběh tří platforem pro sekvenování nové generace: srovnání sekvencerů Ion Torrent, Pacific Biosciences a Illumina MiSeq“. BMC Genomics. 13 (341): 341. doi:10.1186/1471-2164-13-341. PMC 3431227. PMID 22827831.
- ^ Shevchuk, Andrew I (2011). „Realizace biologického a biomedicínského potenciálu zobrazování v nanoměřítku pomocí pipetové sondy“. Nanomedicína. 6 (3): 565–575. doi:10,2217 / nnm.10,154. PMID 21542692.
- ^ Chen, Chiao-Chen; Zhou, Yi; Baker, Lane A. (2012). "Skenování mikroskopie iontové vodivosti". Roční přehled analytické chemie. 5 (207): 207–228. Bibcode:2012ARAC .... 5..207C. doi:10.1146 / annurev-anchem-062011-143203. PMID 22524219.
- ^ Bergner, Stefan; Vatsyayan, Preety; Matysik, Frank-Michael (2. května 2013). „Nedávný pokrok ve skenovací elektrochemické mikroskopii živých buněk s vysokým rozlišením - přehled“. Analytica Chimica Acta. 775: 1–13. doi:10.1016 / j.aca.2012.12.042. PMID 23601970.
- ^ „Snížení britského rozpočtu na vědu by bylo falešnou ekonomikou“. Financial Times. Nikkei. 18. června 2013. Citováno 27. ledna 2016.
- ^ „600 milionů $ pro firmu s DNA“. Varsity. Citováno 27. ledna 2016.
- ^ „Illumina kupuje Solexu“. Forbes. 13. listopadu 2006. Citováno 27. ledna 2016.
- ^ „Illumina koupí Solexu za 600 milionů dolarů na skladě“. The Wall Street Journal. 13. listopadu 2006. Citováno 27. ledna 2016.
- ^ „Nová technologie mikroskopů umožňuje zobrazování živých buněk“. BBSRC. Citováno 30. ledna 2016.
- ^ „Přednášková cesta Britské biofyzikální společnosti“. University College v Dublinu. Citováno 27. ledna 2016.
- ^ Královská medaile 2018
- ^ [1]