Dansylchlorid - Dansyl chloride
 | |
 | |
| Jména | |
|---|---|
| Název IUPAC 5- (dimethylamino) naftalen-l-sulfonylchlorid | |
| Identifikátory | |
3D model (JSmol ) | |
| ChEBI | |
| ChemSpider | |
| Informační karta ECHA | 100.009.175  |
PubChem CID | |
| Číslo RTECS |
|
| UNII | |
Řídicí panel CompTox (EPA) | |
| |
| |
| Vlastnosti | |
| C12H12ClNÓ2S | |
| Molární hmotnost | 269.74 g · mol−1 |
| Bod tání | 70 ° C (158 ° F; 343 K) |
| Nebezpečí | |
| Piktogramy GHS |  |
| H314 | |
| P260, P264, P280, P303 + 361 + 353, P304 + 340, P305 + 351 + 338, P310, P321, P363, P405, P501 | |
Pokud není uvedeno jinak, jsou uvedeny údaje o materiálech v nich standardní stav (při 25 ° C [77 ° F], 100 kPa). | |
 ověřit (co je   ?) | |
| Reference Infoboxu | |
Dansylchlorid nebo 5- (dimethylamino) naftalen-l-sulfonYLchlorid je činidlo reagující s primární aminoskupiny v alifatických i aromatických aminech k výrobě stabilních modrozelených nebo modrozelených–fluorescenční sulfonamidové adukty. Lze jej také nechat reagovat se sekundárními aminy. Dansylchlorid je široce používán k modifikaci aminokyselin; konkrétně sekvenování proteinů a aminokyselina analýza.[2][3]Může být také označen dansylchlorid DNSC. Podobně podobný derivát, dansylamid je známý jako DNSA.
Kromě toho jsou tyto konjugáty protein-DNSC citlivé na jejich bezprostřední prostředí. To v kombinaci s jejich schopností přijímat energii (jako v přenos energie fluorescenční rezonance ) z aminokyseliny tryptofan, umožňuje použití této techniky značení při zkoumání skládání a dynamiky proteinů.
Jejich fluorescence sulfonamid adukty lze vylepšit přidáním alfa-cyklodextrin.[4] Dansylchlorid je nestabilní dimethylsulfoxid, které by nikdy neměly být použity k přípravě roztoků činidla.[5]
Extinkční koeficient dansylových derivátů je důležitý pro měření jejich koncentrace v roztoku. Dansylchlorid je jedním z nejjednodušších derivátů sulfonamidu, takže běžně slouží jako výchozí činidlo pro výrobu dalších derivátů. Exotické deriváty mohou mít velmi odlišné extinkční koeficienty, ale jiné, jako např dansylamid, jsou podobné dansylchloridu v absorpčních a fluorescenčních charakteristikách. Ale i pro dansylchlorid byly hlášeny různé hodnoty koeficientu extinkce. Některé z hodnot se používají k odhadu rozsahu úspěchu při pokusech o konjugaci barviva s proteinem. Pro stanovení přesné koncentrace zásobního roztoku lze použít i jiné hodnoty. Konkrétní hodnoty a jejich použití najdete v tabulce níže.
U všech níže uvedených studií se hodnota absorpce vždy bere na maximum která se objevuje mezi 310 nm a 350 nm. Pík je široký, takže měření není příliš citlivé na chybnou kalibraci spektrofotometru na vlnové délce a chybám způsobeným chybnou kalibrací lze zabránit tím, že namísto striktního použití 330 nm použijete hodnotu na maximum.
| Druh | Koeficient vyhynutí [M−1·cm−1] | Poznámky |
|---|---|---|
| Protein DNSC | 3300[6] | Použití pro konjugáty DNSC-protein; Používá se ke stanovení stupně značení chymotrypsinu a ovalbuminu |
| DNSC | 4350[7] | V hydrogenuhličitanovém pufru; maximum je posunuto na ~ 315 nm |
| DNSC | 4550[8] | Ve vodě; pík se posunul na 312 nm |
| DNSA | 4050[8] | V 60% ethanolu; Měřeno při 329 nm |
| DNSC | 4000[9] | Podmínky nejsou uvedeny; žádný odkaz na zdroj této hodnoty |
Příprava
Tuto sloučeninu lze připravit reakcí odpovídající kyseliny sulfonové s přebytkem oxychlorid fosforitý (POCl3) pokojová teplota.[10]
Reference
- ^ "BL". Sigma-Aldrich. Archivovány od originál dne 2007-12-27. Citováno 2007-12-02.
- ^ Walker JM (1994). „Metoda Dansyl pro identifikaci N-terminálních aminokyselin“. Základní protokoly proteinů a peptidů. Methods Mol. Biol. 32. 321–8. doi:10,1385 / 0-89603-268-X: 321. ISBN 0-89603-268-X. PMID 7951732.
- ^ Walker JM (1994). „Dansyl-Edmanova metoda pro sekvenování peptidů“. Základní protokoly proteinů a peptidů. Methods Mol. Biol. 32. 329–34. doi:10,1385 / 0-89603-268-X: 329. ISBN 0-89603-268-X. PMID 7951733.
- ^ Kinoshita T, Iinuma F, Tsuji A (1974). "Mikroanalýza proteinů a peptidů. I. Zvýšení intenzity fluorescence dansylových aminokyselin a dansylových proteinů ve vodném prostředí a její aplikace pro stanovení aminokyselin a proteinů". Chem. Pharm. Býk. 22 (10): 2413–20. doi:10,1248 / cpb.22.2413. PMID 4468087.
- ^ Boyle, RE (1966). "Reakce dimethylsulfoxidu a 5-dimethylaminonaftalan-1-sulfonylchloridu". The Journal of Organic Chemistry. 31 (11): 3880–3882. doi:10.1021 / jo01349a529.
- ^ Hartley, BS; V Massey (1956). "Aktivní centrum chymotrypsinu: 1. Značení fluorescenčním barvivem". Biochimica et Biophysica Acta. 21 (1): 58–70. doi:10.1016/0006-3002(56)90093-2. PMID 13363860.
- ^ Chen, RF (1968). "Dansyl značené proteiny". Analytická biochemie. 25 (1): 412–416. doi:10.1016/0003-2697(68)90116-4. PMID 5704757.
- ^ A b Weber, G (1952). „Polarizovaná fluorescence proteinových konjugátů“. Biochemical Journal. 51 (2): 145–155. doi:10.1042 / bj0510145. PMC 1197814. PMID 14944566.
- ^ „Příručka molekulárních sond: Kumariny, pyreny a další fluorofory s excitací ultrafialového záření (část 1.7)“. Citováno 12. června 2009.
- ^ Arthur Mendel (1970). "Vylepšená příprava 5-dimethylamino-1-naftalensulfonylchloridu". J. Chem. Eng. Data. 15 (2): 340–341. doi:10.1021 / je60045a010.