DPH5 - DPH5

DPH5
Identifikátory
Aliasy	DPH5, CGI-30, HSPC143, NPD015, AD-018, biosyntéza difthamidu 5
Externí ID	OMIM: 611075 MGI: 1916990 HomoloGene: 6471 Genové karty: DPH5
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 1 (lidský)
Konec	101,026,088 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 3 (myš)
Konec	115,934,361 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita methyltransferázy; • aktivita transferázy; • aktivita difthin syntázy;
Buněčná složka	• cytosol; • buněčná složka;
Biologický proces	• methylace; • metabolismus; • biosyntetický proces peptidyl-difthamid z peptidyl-histidinu;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51611
	69740
	ENSG00000117543
	ENSMUSG00000033554
	Q9H2P9
	Q9CWQ0
	NM_001077394; NM_001077395; NM_015958
	NM_027193
	NP_001070862; NP_001070863; NP_057042
	NP_081469
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Difthin syntáza je enzym že u lidí je kódován DPH5 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje složku difthamid syntetická cesta. Difthamid je posttranslačně upravený histidin zbytek nalezen pouze na faktoru prodloužení translace 2. Je konzervován z archaebakterie na člověka a je zaměřen na záškrt toxin a Pseudomonas exotoxin A k zastavení syntézy buněčných proteinů.

Kvasinky a Čínský křeček homology tohoto proteinu katalyzují trimethylaci zbytku histidinu na součinitel prodloužení 2, což vede k difthinové části, která se následně amiduje za vzniku difthamidu. Více variant přepisu kódujících různé izoformy byly nalezeny pro tento gen.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000117543 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033554 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Liu S, Milne GT, Kuremsky JG, Fink GR, Leppla SH (říjen 2004). "Identifikace proteinů potřebných pro biosyntézu difthamidu, cíle bakteriálních toxinů ADP-ribosylace na faktoru prodloužení translace 2". Mol Cell Biol. 24 (21): 9487–97. doi:10.1128 / MCB.24.21.9487-9497.2004. PMC 522255. PMID 15485916.
^ ^A ^b "Entrez Gene: DPH5 DPH5 homolog (S. cerevisiae)" ".

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (1997). „Normalizace a odčítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů“. Genome Res. 6 (9): 791–806. doi:10,1101 / gr. 6.9.791. PMID 8889548.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, et al. (2000). "Brokovnicové sekvenování lidského transkriptomu se značkami sekvencí exprimovanými ORF". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (7): 3491–6. doi:10.1073 / pnas.97.7.3491. PMC 16267. PMID 10737800.
Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY a kol. (2000). „Identifikace nových lidských genů evolučně konzervovaných u Caenorhabditis elegans srovnávací proteomikou“. Genome Res. 10 (5): 703–13. doi:10,1101 / gr. 10.703. PMC 310876. PMID 10810093.
Hu RM, Han ZG, Song HD a kol. (2000). "Profilování genové exprese v ose lidského hypotalamu - hypofýzy - nadledvin a klonování cDNA plné délky". Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 97 (17): 9543–8. doi:10.1073 / pnas.160270997. PMC 16901. PMID 10931946.
Zhang QH, Ye M, Wu XY a kol. (2001). „Klonování a funkční analýza cDNA s otevřenými čtecími rámci pro 300 dříve nedefinovaných genů exprimovaných v CD34 + hematopoetických kmenových / progenitorových buňkách“. Genome Res. 10 (10): 1546–60. doi:10,1101 / gr. 140200. PMC 310934. PMID 11042152.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.

Tento článek o gen na lidský chromozom 1 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000117543 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000033554 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid15485916-5] Liu S, Milne GT, Kuremsky JG, Fink GR, Leppla SH (říjen 2004). "Identifikace proteinů potřebných pro biosyntézu difthamidu, cíle bakteriálních toxinů ADP-ribosylace na faktoru prodloužení translace 2". Mol Cell Biol. 24 (21): 9487–97. doi:10.1128 / MCB.24.21.9487-9497.2004. PMC 522255. PMID 15485916.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: DPH5 DPH5 homolog (S. cerevisiae)" ".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]