DNASTAR - DNASTAR - Wikipedia

DNASTAR, Inc.
Soukromá společnost
PrůmyslBioinformatika Software
Zakladatelé
  • Dr. Fredrick Blattner
  • John Schroeder
Hlavní sídlo
Madison, Wisconsin
,
Spojené státy
Oblast sloužila
Celosvětově
produktySoftware
webová stránkaDNASTAR

DNASTAR je globální bioinformatika softwarová společnost založená v roce 1984 se sídlem v Madison, Wisconsin. DNASTAR vyvíjí a prodává software pro sekvenční analýza v polích genomika, molekulární biologie, a strukturní biologie.

Software

Software DNASTAR (Lasergene) poprvé získal popularitu v 80. a 90. letech sestava sekvence a možnosti analýzy Sangerovo sekvenování data. Lasergene 15.2 byl vydán v červnu 2018.[1] Software DNASTAR je k dispozici pro spuštěné stolní počítače Mac OS X, Okna, a Linux stejně jako pro použití na Webové služby Amazon.

V roce 2007 rozšířila společnost DNASTAR své nabídky o software pro sekvenování nové generace a strukturní biologie.[2] Software nové generace DNASTAR podporuje data z Illumina, Ion Torrent, a Pacific Biosciences a umožňuje uživateli shromažďovat, srovnávat, analyzovat a vizualizovat genomová data. Použití Lasergene při sestavování a analýze sekvencí nové generace bylo přispěno jako kapitola, napsaná vědci společnosti, do knihy z roku 2008 Sekvenování genomu nové generace editoval Michael Janitz.[3]

Software DNASTAR využívá farmaceutický, biotechnologický, akademický a kliničtí vědci ve více než 90 zemích.[4]

Recenze

Zápis Vědec „David R. Smith kladně hodnotil několik softwarových balíků pro bioinformatiku, včetně DNAstar, ale uvedl, že jeho dovednosti v oblasti bioinformatiky plató a platba a náklady na licence a upgrade představovaly významnou část provozního rozpočtu jeho laboratoře.[5]

Ocenění

V roce 2007 získala společnost DNASTAR cenu Reader's Choice Gold Award Scientific Computing Magazine pro software pro analýzu sekvence lasergenu.[6]

Kniha z roku 2008 Vynalézání podnikatelů: Technologičtí inovátoři a jejich podnikatelská cesta Gerard George a Adam J. Bock zahrnuje DNASTAR jako příklad inovativního a podnikatelského úspěchu.[7]

Výzkumná studie BMC Genomics v roce 2010 zjistil, že sestavy SeqMan (aplikace pro sestavování sekvencí nové generace DNASTAR) fungovaly nejlépe, s novými sekvencemi a lepší rekapitulací transkriptů.[8]

Další BMC Genomics Studie v roce 2011 zjistila, že nejlepší celkový výkon contig byl výsledkem sestavy SeqMan NGen.[9]

Zákazníci

Viz také

Reference[11]

  1. ^ "Lasergene 15.2 - poznámky k verzi | DNASTAR". DNASTAR. 2018-06-26. Citováno 2018-10-08.
  2. ^ "Profil společnosti". DNASTAR. Citováno 25. října 2014.[samostatně publikovaný zdroj ]
  3. ^ Janitz, Michael (listopad 2008). Sekvenování genomu nové generace: Směrem k personalizované medicíně. Wiley-VCH. ISBN  978-3-527-32090-5.
  4. ^ "Kariéra DNASTAR". DNASTAR. Citováno 25. října 2014.[samostatně publikovaný zdroj ]
  5. ^ Vědec, 2. září 2014 http://www.the-scientist.com/?articles.view/articleNo/40916/title/Opinion--Bioinformatics-Software--A-Buyer-s-Guide/
  6. ^ Zaměstnanci (30. června 2007). „Volba čtenářů bioinformatiky - Zlatá cena: Lasergen“. Vydání produktu. Vědecké výpočty. Výhoda obchodních médií.
  7. ^ Gerry, George; Bock, Adam (leden 2008). Vynalézání podnikatelů: Technologičtí inovátoři a jejich podnikatelská cesta. Prentice Hall. ISBN  978-0-13-157470-0.[stránka potřebná ]
  8. ^ Kumar, Sujai; Blaxter, Mark L. (16. října 2010). "Srovnávám de novo assemblery pro 454 transkriptomových dat ". BMC Genomics. 11: 571. doi:10.1186/1471-2164-11-571. PMC  3091720. PMID  20950480. 571.otevřený přístup
  9. ^ Feldmeyer, Barbara; Wheat, Christopher W .; et al. (16. června 2011). "Krátké čtení dat Illumina pro de novo shromáždění transkriptomu nemodelských druhů šneků (Radix balthica, Basommatophora, Pulmonata) a srovnání výkonu assembleru ". BMC Genomics. 12: 317. doi:10.1186/1471-2164-12-317. PMC  3128070. PMID  21679424. 317.otevřený přístup
  10. ^ Zaměstnanci (1. ledna 2014). „Nabídky produktů a služeb“. Gen. Eng. Biotechnol. Zprávy (papír) | formát = vyžaduje | url = (Pomoc). 34 (1). str. 11. ... uzavřela víceletou softwarovou licenční smlouvu se společností DNAStar na používání softwaru Lasergene jako primární softwarové platformy pro sestavování a analýzu sekvencí pro výzkumné pracovníky v rámci své organizace.
  11. ^ Schwei, Tom (2. března 2017). „Společnost DNASTAR uvádí software Lasergene 14.1 s významnými vylepšeními“ (Tisková zpráva). DNASTAR.[samostatně publikovaný zdroj ]

externí odkazy