DHX16 - DHX16

DHX16
Identifikátory
Aliasy	DHX16, DBP2, DDX16, PRO2014, PRP8, PRPF2, Prp2, DEAH-box helicase 16, NMOAS
Externí ID	OMIM: 603405 MGI: 1916442 HomoloGene: 2658 Genové karty: DHX16
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 6 (lidský)
Konec	30,673,006 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 17 (myš)
Konec	35,892,670 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Aktivita RNA helikázy; • vazba nukleotidů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • ATP vazba; • GO: Aktivita helikázy 0008026; • aktivita hydrolázy; • vazba nukleové kyseliny; • Aktivita ATPázy; • Vazba RNA; • GO: 0034459 aktivita 3'-5 'RNA helikázy;
Buněčná složka	• spliceosomální komplex; • buněčné jádro; • cytoplazma; • nukleoplazma; • Prekatalytický spliceosom typu U2;
Biologický proces	• Zpracování mRNA; • Sestřih RNA; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • metabolismus;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	8449
	69192
ENSG00000233561; ENSG00000206486; ENSG00000233418; ENSG00000231377; ENSG00000227222;
	ENSG00000204560; ENSG00000233049; ENSG00000226171
	ENSMUSG00000024422
	O60231; Q5SQH5
	n / a
	NM_001164239; NM_003587; NM_001363515
	NM_026987
	NP_001157711; NP_003578; NP_001350444
	n / a
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Předpokládaný faktor sestřihu pre-mRNA ATP-dependentní RNA helikáza DHX16 je enzym že u lidí je kódován DHX16 gen.^[5]^[6]

DEAD box proteiny, charakterizované konzervovaným motivem Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), jsou domnělé RNA helikázy. Jsou zapojeny do řady buněčných procesů zahrnujících změnu sekundární struktury RNA, jako je iniciace translace, nukleární a mitochondriální sestřih a ribozom a spliceosome shromáždění. Na základě jejich distribučních vzorců se někteří členové této rodiny považují za členy embryogeneze, spermatogeneze a buněčný růst a dělení. Tento gen kóduje DEAD box protein, který je funkční homolog štěpných kvasinek Prp8 protein podílející se na progresi buněčného cyklu. Tento gen je mapován do MHC oblasti na chromozóm 6p21.3, oblast, kde je mnoho maligních, genetických a autoimunitní geny nemoci jsou spojeny.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C ENSG00000206486, ENSG00000233418, ENSG00000231377, ENSG00000227222, ENSG00000204560, ENSG00000233049, ENSG00000226171 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000233561, ENSG00000206486, ENSG00000233418, ENSG00000231377, ENSG00000227222, ENSG00000204560, ENSG00000233049, ENSG00000226171 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024422 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Imamura O, Saiki K, Tani T, Ohshima Y, Sugawara M, Furuichi Y (červen 1998). "Klonování a charakterizace lidské DEAH-box RNA helikázy, funkční homolog štěpných kvasinek Cdc28 / Prp8". Nucleic Acids Res. 26 (9): 2063–8. doi:10.1093 / nar / 26.9.2063. PMC 147520. PMID 9547260.
^ ^A ^b „Entrez gen: DHX16 DEAH (Asp-Glu-Ala-His) boxový polypeptid 16".

Další čtení

Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Lim J, Hao T, Shaw C a kol. (2006). „Síť interakce protein-protein pro lidské zděděné ataxie a poruchy degenerace Purkyňových buněk“. Buňka. 125 (4): 801–14. doi:10.1016 / j.cell.2006.03.032. PMID 16713569. S2CID 13709685.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. Bibcode:2004PNAS..10112130B. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2003). „Interakce proteinů a proteinů mezi velkými proteiny: dvouhybridní screening využívající funkčně klasifikovanou knihovnu složenou z dlouhých cDNA“. Genome Res. 12 (11): 1773–84. doi:10,1101 / gr. 406902. PMC 187542. PMID 12421765.
Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N a kol. (1998). "Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. IX. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které mohou kódovat velké proteiny in vitro". DNA Res. 5 (1): 31–9. doi:10.1093 / dnares / 5.1.31. PMID 9628581.

Tento článek o gen na lidský chromozom 6 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C ENSG00000206486, ENSG00000233418, ENSG00000231377, ENSG00000227222, ENSG00000204560, ENSG00000233049, ENSG00000226171 GRCh38: Ensembl uvolnění 89: ENSG00000233561, ENSG00000206486, ENSG00000233418, ENSG00000231377, ENSG00000227222, ENSG00000204560, ENSG00000233049, ENSG00000226171 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024422 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9547260-5] Imamura O, Saiki K, Tani T, Ohshima Y, Sugawara M, Furuichi Y (červen 1998). "Klonování a charakterizace lidské DEAH-box RNA helikázy, funkční homolog štěpných kvasinek Cdc28 / Prp8". Nucleic Acids Res. 26 (9): 2063–8. doi:10.1093 / nar / 26.9.2063. PMC 147520. PMID 9547260.

[entrez-6] A ^b „Entrez gen: DHX16 DEAH (Asp-Glu-Ala-His) boxový polypeptid 16".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]