DDX56 - DDX56

DDX56
Identifikátory
Aliasy	DDX56, DDX21, DDX26, NOH61, DEAD-box helicase 56
Externí ID	OMIM: 608023 MGI: 1277172 HomoloGene: 6498 Genové karty: DDX56
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 7 (lidský)
Konec	44,575,051 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	6,267,772 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleotidů; • aktivita hydrolázy; • ATP vazba; • GO: Aktivita helikázy 0008026; • vazba nukleové kyseliny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• membrána; • buněčné jádro; • jádro; • cytoplazma;
Biologický proces	• zpracování rRNA; • Odvíjení sekundární struktury RNA; • ribozomální biogeneze; • pozitivní regulace vývoje projekce neuronů;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	54606
	52513
	ENSG00000136271
	ENSMUSG00000004393
	Q9NY93
	Q9D0R4
	NM_019082; NM_001257189
	NM_026538
	NP_001244118; NP_061955
	NP_080814
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Pravděpodobná ATP závislá RNA helikáza DDX56 je enzym že u lidí je kódován DDX56 gen.^[5]^[6]

Tento gen kóduje člena DEAD box rodina bílkovin. DEAD box proteiny, charakterizované konzervovaným motivem Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), jsou domnělé RNA helikázy. Jsou zapojeny do řady buněčné procesy zahrnující změnu RNA sekundární struktura jako je iniciace translace, nukleární a mitochondriální sestřih a ribozom a spliceosome shromáždění. Na základě jejich distribučních vzorců se někteří členové této rodiny považují za členy embryogeneze, spermatogeneze, a buněčný růst a rozdělení. The protein kódovaný tímto genem ukazuje ATPáza aktivita v přítomnosti polynukleotidů a asociací s nukleoplazmatickými preribozomálními částicemi 65S. Tento gen může být zapojen do syntézy ribozomu, nejpravděpodobněji během sestavování velké 60S ribozomální podjednotky.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136271 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004393 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Zirwes RF, Eilbracht J, Kneissel S, Schmidt-Zachmann MS (červenec 2000). „Nový protein typu helikázy v Nucleolus: Protein NOH61“. Mol Biol Cell. 11 (4): 1153–67. doi:10,1091 / mbc.11.4.1153. PMC 14838. PMID 10749921.
^ ^A ^b "Entrez Gene: DDX56 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) boxový polypeptid 56".

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R a kol. (2001). „Směrem ke katalogu lidských genů a proteinů: Sekvenování a analýza 500 nových kompletních lidských cDNA kódujících proteiny“. Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10,1101 / gr. GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
Andersen JS, Lyon CE, Fox AH a kol. (2002). "Řízená proteomická analýza lidského nukleolu". Curr. Biol. 12 (1): 1–11. doi:10.1016 / S0960-9822 (01) 00650-9. PMID 11790298. S2CID 14132033.
Valdez BC, Yang H, Hong E, Sequitin AM (2002). "Genomická struktura nově identifikovaného paralogu RNA helikázy II / Gu: detekce pseudogenů a více alternativně sestřižených mRNA". Gen. 284 (1–2): 53–61. doi:10.1016 / S0378-1119 (01) 00888-5. PMID 11891046.
Scherl A, Couté Y, Déon C a kol. (2003). „Funkční proteinová analýza lidského nukleolu“. Mol. Biol. Buňka. 13 (11): 4100–9. doi:10,1091 / mbc.E02-05-0271. PMC 133617. PMID 12429849.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR a kol. (2003). „Human Chromosome 7: DNA Sequence and Biology“. Věda. 300 (5620): 767–72. doi:10.1126 / science.1083423. PMC 2882961. PMID 12690205.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Lehner B, Sanderson CM (2004). „Rámec interakce proteinů pro degradaci lidské mRNA“. Genome Res. 14 (7): 1315–23. doi:10,1101 / gr. 2122004. PMC 442147. PMID 15231747.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 7 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000136271 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000004393 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10749921-5] Zirwes RF, Eilbracht J, Kneissel S, Schmidt-Zachmann MS (červenec 2000). „Nový protein typu helikázy v Nucleolus: Protein NOH61“. Mol Biol Cell. 11 (4): 1153–67. doi:10,1091 / mbc.11.4.1153. PMC 14838. PMID 10749921.

[entrez-6] A ^b "Entrez Gene: DDX56 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) boxový polypeptid 56".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]