DDX41 - DDX41

DDX41
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2P6N
Identifikátory
Aliasy	DDX41, ABS, MPLPF, helicase DEAD-box 41
Externí ID	OMIM: 608170 MGI: 1920185 HomoloGene: 9431 Genové karty: DDX41
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	177,516,961 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 13 (myš)
Konec	55,536,658 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• Vazba DNA; • vazba nukleotidů; • GO: Aktivita helikázy 0008026; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba nukleové kyseliny; • aktivita hydrolázy; • ATP vazba; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytosol; • katalytický krok 2 spliceosom; • membrána; • endoplazmatické retikulum; • buněčné jádro; • spliceosomální komplex; • jádro; • cytoplazma;
Biologický proces	• buněčná odpověď na interferon-beta; • Zpracování mRNA; • regulace produkce interferonu typu I.; • obranná reakce na virus; • Odvíjení sekundární struktury RNA; • Sestřih RNA; • pozitivní regulace produkce interferonu typu I.; • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II; • apoptotický proces; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • buněčná proliferace; • diferenciace buněk;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51428
	72935
	ENSG00000183258
	ENSMUSG00000021494
	Q9UJV9
	Q91VN6
	NM_016222; NM_001321732; NM_001321830
	NM_134059
	NP_001308661; NP_001308759; NP_057306
	NP_598820
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Pravděpodobná ATP závislá RNA helikáza DDX41 je enzym že u lidí je kódován DDX41 gen.^[5]^[6]

DEAD box proteiny, charakterizované konzervovaným motivem Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD), jsou domnělé RNA helikázy. Jsou zapojeny do řady buněčných procesů zahrnujících alteraci RNA sekundární struktura, jako je iniciace translace, nukleární a mitochondriální sestřih a ribozom a spliceosome shromáždění. Na základě jejich distribučních vzorců se předpokládá, že jsou zahrnuti někteří členové rodiny proteinů DEAD box embryogeneze, spermatogeneze, a buněčný růst a divize. Tento gen kóduje člena této rodiny. Funkce tohoto člena nebyla stanovena. Na základě studií v Drosophila je během post-transkripce široce vyžadován gen abstrakt genová exprese.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183258 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021494 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Irion U, Leptin M (únor 2000). "Vývojové a buněčné biologické funkce Drosophila DEAD-box proteinu abstrakt". Curr Biol. 9 (23): 1373–81. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80082-2. PMID 10607561. S2CID 16448276.
^ ^A ^b „Entrez Gene: DDX41 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptid 41".

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Jurica MS, Licklider LJ, Gygi SR a kol. (2002). „Čištění a charakterizace nativních spliceosomů vhodných pro trojrozměrnou strukturní analýzu“. RNA. 8 (4): 426–39. doi:10.1017 / S1355838202021088. PMC 1370266. PMID 11991638.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Andersen JS, Lam YW, Leung AK a kol. (2005). "Dynamika nukleolárního proteomu". Příroda. 433 (7021): 77–83. doi:10.1038 / nature03207. PMID 15635413. S2CID 4344740.
Abdul-Ghani M, Hartman KL, Ngsee JK (2005). "Abstrakt interaguje s a reguluje výraz třídění Nexin-2". J. Cell. Physiol. 204 (1): 210–8. doi:10.1002 / jcp.20285. PMC 2963638. PMID 15690390.
Nousiainen M, Silljé HH, Sauer G a kol. (2006). „Fosfoproteomová analýza lidského mitotického vřetena“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 103 (14): 5391–6. doi:10.1073 / pnas.0507066103. PMC 1459365. PMID 16565220.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000183258 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000021494 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10607561-5] Irion U, Leptin M (únor 2000). "Vývojové a buněčné biologické funkce Drosophila DEAD-box proteinu abstrakt". Curr Biol. 9 (23): 1373–81. doi:10.1016 / S0960-9822 (00) 80082-2. PMID 10607561. S2CID 16448276.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: DDX41 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptid 41".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]