DBR1 - DBR1

DBR1
Identifikátory
Aliasy	DBR1, rozvětvené RNA lariaty 1
Externí ID	OMIM: 607024 MGI: 1931520 HomoloGene: 9428 Genové karty: DBR1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 3 (lidský)
Konec	138,174,921 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	99,584,501 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita hydrolázy; • Aktivita enzymu větvení RNA lariat; • aktivita hydrolázy, působící na esterové vazby; • vazba kovových iontů; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• Sestřih RNA prostřednictvím transesterifikačních reakcí; • Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • Zpracování mRNA; • Hydrolýza RNA fosfodiesterovou vazbou, endonukleolytická;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	51163
	83703
	ENSG00000138231
	ENSMUSG00000032469
	Q9UK59
	Q923B1
	NM_016216
	NM_031403; NM_001368298
	NP_057300
	NP_113580; NP_001355227
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Lariatový odvětvující enzym je protein že u lidí je kódován DBR1 gen.^[5]^[6]

Lariat RNA se rozvětvuje enzym, nebo konkrétně DBR1 hydrolyzuje 2-prime-to-5-prime rozvětvený fosfodiester vazby v bodě větvení vyříznutého lariatu intron RNA a převádí je na lineární molekuly. [dodává OMIM]^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138231 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032469 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Kim JW, Kim HC, Kim GM, Yang JM, Boeke JD, Nam K (září 2000). „Enzym cDNA lidského laloku zbavující se větví doplňuje fenotypy mutantů Saccharomyces cerevisiae dbr1 a Schizosaccharomyces pombe dbr1“. Nucleic Acids Res. 28 (18): 3666–73. doi:10.1093 / nar / 28.18.3666. PMC 110720. PMID 10982890.
^ ^A ^b „Entrez Gene: DBR1 debranching enzym homolog 1 (S. cerevisiae)“.

Další čtení

Chapman KB, Boeke JD (1991). "Izolace a charakterizace genu kódujícího kvasinkový odvětvující enzym". Buňka. 65 (3): 483–92. doi:10.1016 / 0092-8674 (91) 90466-C. PMID 1850323. S2CID 39225964.
Arenas J., Hurwitz J. (1987). "Čištění RNA odbočující aktivity z buněk HeLa". J. Biol. Chem. 262 (9): 4274–9. PMID 2435736.
Martin A, Schneider S, Schwer B (2002). „Prp43 je nezbytná RNA-dependentní ATPáza potřebná pro uvolnění lariat-intronu ze spliceosomu“. J. Biol. Chem. 277 (20): 17743–50. doi:10,1074 / jbc.M200762200. PMID 11886864.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Ye Y, De Leon J, Yokoyama N a kol. (2006). „Inhibice DBR1 siRNA replikace HIV-1“. Retrovirologie. 2: 63. doi:10.1186/1742-4690-2-63. PMC 1266399. PMID 16232320.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983. S2CID 7827573.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000138231 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032469 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid10982890-5] Kim JW, Kim HC, Kim GM, Yang JM, Boeke JD, Nam K (září 2000). „Enzym cDNA lidského laloku zbavující se větví doplňuje fenotypy mutantů Saccharomyces cerevisiae dbr1 a Schizosaccharomyces pombe dbr1“. Nucleic Acids Res. 28 (18): 3666–73. doi:10.1093 / nar / 28.18.3666. PMC 110720. PMID 10982890.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: DBR1 debranching enzym homolog 1 (S. cerevisiae)“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]