ClearVolume - ClearVolume

ClearVolume^[1] je open source živý přenos v reálném čase 3D vizualizace knihovna určená pro špičkovou volumetrickou světelné mikroskopy. ClearVolume umožňuje živou vizualizaci dat mikroskopu - umožňuje biologům okamžitě se rozhodnout, zda má vzorek smysl pro zobrazení. ClearVolume lze snadno integrovat do existujícího Jáva, C / C ++, Krajta nebo LabVIEW software na bázi mikroskopů. Má vyhrazené rozhraní pro řídicí software MicroManager / OpenSpim / OpenSpin. ClearVolume podporuje více kanálů, živé 3D streamování dat ze vzdálených mikroskopů a používá víceprůchodový algoritmus vykreslování Fibonacci, který dokáže zpracovat velké objemy. ClearVolume je navíc integrován do FiJi /ImageJ2 /KNIME ekosystém.

Viz také

Reference

^ Royer, Loïc A; Weigert, Martin; Günther, Ulrik; Maghelli, Nicola; Džbán, Florian; Sbalzarini, Ivo F .; Myers, Eugene W. (2015). „ClearVolume - živá 3D vizualizace open-source pro mikroskopii světelných listů“. Přírodní metody. 12 (6): 480–481. doi:10.1038 / nmeth.3372. PMID 26020498. S2CID 205423715.

externí odkazy

[1] Web open source projektu ClearVolume s odkazy na wiki, úložišti kódů a sledováním problémů.
[2] Stránka projektu pluginu ClearVolume KNIME.
[3] Stránka projektu pluginu ClearVolume FiJi.

[ClearVolume2015-1] Royer, Loïc A; Weigert, Martin; Günther, Ulrik; Maghelli, Nicola; Džbán, Florian; Sbalzarini, Ivo F .; Myers, Eugene W. (2015). „ClearVolume - živá 3D vizualizace open-source pro mikroskopii světelných listů“. Přírodní metody. 12 (6): 480–481. doi:10.1038 / nmeth.3372. PMID 26020498. S2CID 205423715.

[1]