Chimérická nukleáza - Chimeric nuclease

Chimérické příkladem jsou nukleázy upravené bílkoviny který musí obsahovat a Doména vázající DNA dát sekvenční specificitu a nukleáza doména pro DNA výstřih.

Domény vázající DNA

Domény vázající DNA včetně základní šroubovice-smyčka-šroubovice, zinkový prst, helix-turn-helix a leucinový zip motivy byly použity při konstrukci sekvenčně specifických nukleáz. Z nich byly zinkové prsty navrženy jako nejdůležitější díky své modularitě, což umožňuje konstrukci vazebné domény DNA šité na míru.[1]

Doména nukleázy

Nukleázová doména je zodpovědná za fyzické štěpení řetězců DNA a může zavádět buď jednořetězcové nebo dvouřetězcové zlomy. FokI je příklad sekvenčně specifického endonukleáza jehož nespecifická nukleázová doména zavádí dvouřetězcové zlomy a byla použita v různých experimentech včetně identifikace vazebných míst s vysokou a nízkou afinitou transkripčních faktorů in vitro, ke studiu náboru faktorů na stránky promotérů in vivo použitím identifikace polohy proteinu s nukleázovým ocasem a zkoumat proteiny specifické pro interakci s DNA v DNA Z-DNA konformace (Durai et al., 2005 a odkazy v ní uvedené).

Viz také

Reference

  1. ^ Durai S, Mani M, Kandavelou K, Wu J, Porteus MH, Chandrasegaran S (2005). „Nukleázy se zinkovým prstem: zakázkové molekulární nůžky pro genomové inženýrství rostlinných a savčích buněk“. Nucleic Acids Res. 33 (18): 5978–90. doi:10.1093 / nar / gki912. PMC  1270952. PMID  16251401.