Centrum pro biofilmové inženýrství - Center for Biofilm Engineering
Barnardova hala na Montanské státní univerzitě, domov Centra pro biofilmové inženýrství | |
Mateřská instituce | Státní univerzita v Montaně |
---|---|
Založeno | 15. dubna 1990[1] |
Mise | Posunujte základní znalosti, technologie a vzdělání potřebné k pochopení, ovládání a využívání biofilm procesy |
Ředitel | Matthew W. Fields (2015 – aktuální) Philip S. Stewart (2005–2015) John W. Costerton (1993–2004) William G. Characklis (1990–92) |
Dříve volal | Centrum pro mezifázové mikrobiální procesní inženýrství[2] |
Umístění | , , Spojené státy |
Souřadnice | 45 ° 39'57 ″ severní šířky 111 ° 02'47 ″ Z / 45,66583 ° S 111,04639 ° ZSouřadnice: 45 ° 39'57 ″ severní šířky 111 ° 02'47 ″ Z / 45,66583 ° S 111,04639 ° Z |
webová stránka | www |
The Centrum pro biofilmové inženýrství (CBE) je interdisciplinární výzkumná, vzdělávací a technologická instituce umístěná v centrálním kampusu Státní univerzita v Montaně v Bozeman, Montana. Centrum bylo založeno v dubnu 1990 jako Centrum pro mezifázové mikrobiální procesní inženýrství s dotací od Centra technického výzkumu (ERC) programu Národní vědecká nadace (NSF).[3] CBE integruje fakultu z několika univerzitních kateder, aby vedla multidisciplinární výzkumné týmy - včetně postgraduálních a vysokoškolských studentů - k rozvoji základních biofilm znalosti, rozvíjet prospěšné využití pro mikrobiální biofilmy a nacházet řešení průmyslově relevantních problémů s biofilmy. Centrum se zabývá otázkami biofilmu včetně chronické rány, bioremediace, a mikrobiální koroze prostřednictvím mezioborového výzkumu a vzdělávání mezi inženýři, mikrobiologové a průmysl.[4][5]
Dějiny
Centrum vzniklo jako Ústav pro chemickou a biologickou analýzu procesů (IPA) v roce 1983.[1] V roce 1990 se centrum stalo národní ERC jako Centrum pro mezifázové mikrobiální procesní inženýrství na základě grantu NSF ve výši 7,2 milionu dolarů.[2] V roce 1993 převzalo středisko svůj současný název Centrum pro biofilmové inženýrství. Původní granty vypršely v roce 2001 a centrum se stalo soběstačným. Středisko v průběhu roku 2020 slaví 30. výročí jako ERS NSF.
Ústav pro chemickou a biologickou analýzu procesů (1979–1990)
V roce 1979 W.G. (Bill) Characklis přišel na Montana State University z Rice University jako profesor v civilním (environmentálním) a chemickém inženýrství. Shromáždil multidisciplinární tým inženýři, mikrobiologové a chemici studovat procesy a účinky mikrobiálního růstu na rozhraní[6] Založil mezioborový institut pro biotechnologii v oblasti životního prostředí, který má řešit potřeby průmyslu v oblastech biologické znečištění, mikrobiální koroze a technologie biofilmu.[1] Institut pro chemickou a biologickou analýzu procesů (IPA) byl objednán Montana Board of Regents v roce 1983 na Montana State University College of Engineering. Bill Characklis byl jeho prvním ředitelem. IPA poskytl základ pro případný stav Engineering Research Center několika způsoby. IPA provedl základní výzkum, vývoj a testování pro průmysl a vládní agentury a sledoval projekty biofilmu, které překročily hranice tradiční vědecké disciplíny.[7] IPA založila členský program Industrial Associates a do roku 1989 měl program 12 zúčastněných členů, z nichž každý každoročně přispíval do centra 10 000 USD. Výhody členství jim poskytly příležitost pomáhat při hodnocení a definování výzkumných programů IPA. Mezi členy patřily ropné / plynové / energetické společnosti, výrobce chemikálií, společnost na výrobu papíru a celulózy a partnerství s Idaho National Engineering Laboratory.[8]
Centrum mezifázového mikrobiálního procesního inženýrství (1990–1993)
V roce 1989 požádal IPA o status NSF pro status Engineering Research Center, který byl udělen v dubnu 1990.[3] Centrum mezifázového mikrobiálního procesního inženýrství bylo založeno jako jedno ze tří národních středisek strojírenského výzkumu ze 48 žadatelů.[9] Jako ERC byla nová organizace pověřena budováním mezioborového výzkumného a vzdělávacího programu na Montanské státní univerzitě a také zvýšením průmyslové konkurenceschopnosti USA v technologiích souvisejících s biofilmy. Charta střediska nařídila, aby programy výzkumu, vzdělávání a přenosu technologií byly plně integrovány do plánování programu střediska. Program Industrial Associates se nadále používal jako mechanismus centra k získávání informací z průmyslu o významných problémech souvisejících s biofilmy a ke spolupráci na výzkumných iniciativách centra určených k řešení problémů s biofilmy. Vzdělávací program centra přijal studenty, aby se zúčastnili interdisciplinárních výzkumných týmů a komunikovali se zástupci průmyslu.[1]
Poskytnutí grantu z NSF ve výši 7,2 milionu USD během prvních pěti let umožnilo rozšíření výzkumu centra do nových oblastí, zejména bioremediace a biohydrometalurgie. Průmyslové zaměření centra se rozšířilo od kontroly a zmírňování biofilmu tak, aby zahrnovalo pozitivní využití procesů biofilmu k rozrušení kontaminantů půdy a vody a také těžbu minerálů z nekvalitních rud.[1] Projekty centra byly navrženy tak, aby pokrývaly škály dotazů od základních bench-scale po aplikované experimenty v terénním měřítku. Tyto projekty umožnily pokračující vývoj mikrosenzorů pro měření gradientů plynů a pH v komunitách biofilmů,[10] mikroskopie objasnit fyziologickou aktivitu společenských organismů[11] a modelování k předpovědi chování biofilmu.[12]
Centrum pro biofilmové inženýrství (1993 – dosud)
V roce 1992, dva roky po založení, zemřel první ředitel střediska Bill Characklis. Montana State University signalizovala svůj závazek vůči centru tím, že najala J.W. (Bill) Costerton, profesor mikrobiologie z University of Calgary, jako výkonný ředitel a James Bryers, profesor biochemického inženýrství z Duke University, jako ředitel výzkumu centra. V roce 1993 byl název centra změněn na Centrum pro biofilmové inženýrství (CBE).[13]
Pod Costertonovým vedením centrum pokračovalo v plnění své charty a začalo rozšiřovat rozsah svého šetření. Costerton vyzval k průzkumu bioelektrický efekt,[14] fenomén buněčné signalizace a jeho vztah ke struktuře biofilmu[15] a podpovrchové technologie biobariér k ochraně vody a půdy před kontaminací těžbou.[16] Průmyslový zájem a členství vzrostly v reakci na různorodější výzkumná témata. Do roku 1996 se členství v průmyslovém sdružení rozrostlo na 19 diverzifikovaných členů, včetně členů zastupujících úpravu vody, těžbu, vládní laboratoře, speciální chemikálie, spotřební výrobky a ropné a energetické společnosti.[17] V červnu 1996 obnovila Národní vědecká nadace svůj závazek vůči Centru pro biofilmové inženýrství novým pětiletým grantem ve výši 7,6 milionu USD.[4]
V roce 1996 vzrostl národní profil výzkumu CBE a biofilmu. Četné vědecké publikace a publikace hromadných sdělovacích prostředků se začaly vážně zabývat technologií biofilmu. Článek v čísle ze září 1996 Vědas názvem „Biofilms Invade Microbiology“ představoval práci a historii Centra pro biofilmové inženýrství.[4] Včetně dalších časopisů a novin s biofilmy a výzkumem CBE Nový vědec (titulní článek, 31. srpna 1996),[18] Vědecké zprávy (26. dubna 1997),[19] the Chicago Sun-Times (17. května 1998),[20] Věda (19. března 1999),[21] Pracovní týden (12. září 1999),[22] Knight Ridder / Tribune News Service (7. ledna 2000),[23] Příroda (16. listopadu 2000)[24] a The Boston Globe (28. května 2002).[25] V roce 2001 napsal Costerton a zástupce ředitele CBE Philip S. Stewart článek o biofilmu „Battling Biofilms“ publikovaný v Scientific American (1. července 2001)[26]
Soběstačnost (2001–)
Program NSF ERC byl navržen k vytvoření institucionálních center, která by byla soběstačná do deseti let. Centrum pro biofilmové inženýrství na Montanské státní univerzitě začalo plánovat soběstačnost v roce 1998 vytvořením pracovní skupiny soběstačnosti na univerzitě. Středisko dosáhlo soběstačnosti v roce 2001 a nadále je částečně financováno prostřednictvím federálních a soukromých grantů s trvalým důrazem na poskytování hodnoty průmyslovým spolupracovníkům a podporu z Montana State University a Stát Montana.[27] V roce 2005 byl profesorem chemického a biologického inženýrství Philip S. Stewart vybrán jako třetí ředitel CBE. Stewart, který se jako člen fakulty CBE účastnil od roku 1991, byl předním odborníkem na antimikrobiální látky a kontrolu biofilmu.[28][29][30] Během Stewartova působení CBE rostl počet přidružených fakult, průmyslové členství, počet testovacích a průmyslem sponzorovaných projektů a účast vysokoškolských a postgraduálních studentů. Matthew Fields se stal čtvrtým ředitelem CBE v roce 2015. Ve fiskálním roce 2019 byly uděleny výzkumné granty 2,54 milionu dolarů. Středisko je jedním z 24 soběstačných technických výzkumných středisek v programu National Science Foundation.[31]
Programy
Výzkumný program
Výzkumný program biofilmu střediska byl založen v 80. letech se zaměřením na bioinženýrství v oblasti životního prostředí, interdisciplinární výzkum a průmyslovou účast. Odborné znalosti fakulty ze stavebního / environmentálního inženýrství, matematiky, mikrobiologie, chemie a chemie biologické inženýrství, chemie a biochemie, strojní a průmyslové inženýrství, informatika, elektrotechnika a statistika přispívají k vývoji hypotéz a experimentální konstrukci. Centrum provádí výzkum, který zahrnuje více stupnic pozorování, od molekulárního po průmyslové, s projekty, které pokrývají základní i aplikovaná témata. Výzkumné týmy CBE byly součástí řady průkopnických pokroků ve vědě a technologii biofilmů, včetně: snímání kvora,[32] propustnost (vědy o Zemi),[33] biomineralizace,[34] antimikrobiální tolerance,[28] viskoelasticity,[35] oddělení,[36] standardizované metody biofilmu,[37] chronické rány,[38] řasy palivo,[39] mikrobiální koroze,[40] bakterie redukující síran,[41] struktura a funkce biofilmu.[42] Výzkum CBE byl publikován ve vysoce hodnocených recenzovaných časopisech, včetně: Příroda,[43] Lancet,[44] Věda,[45][46] JAMA,[47] PNAS,[48][49] EMBO Journal,[50] ISME Journal,[51][52] Příroda Recenze Mikrobiologie[53][54] a Dopisy o fyzické kontrole.[55] Do roku 2018 autoři CBE publikovali 1242 recenzovaných článků.[56] Více než 20 obrázků střediska souvisejících s biofilmy se objevilo na obálkách recenzovaných časopisů.[57]
Témata aplikovaného výzkumu, kterým se centrum v roce 2019 věnovalo, zahrnovala:[5]
- Strategie kontroly biofilmu (antimikrobiální účinnost, biocidy, bioaktivní sloučeniny, dezinfekční účinnost)
- Energetická řešení (biopaliva, uhelný metan Výroba, mikrobiální palivové články )
- Environmentální technologie (bioremediace, mokřady, biomineralizace, těžba, sekvestrace uhlíku )
- Zdravotní / lékařské biofilmy (chronické rány, katétr infekce, zdraví ústní dutiny)
- Průmyslové systémy a procesy (biologické znečištění, mikrobiální koroze, kontaminace produktu)
- Standardizované metody (reklamace produktů, regulační problémy, ASTM vývoj metod)
- Vodní systémy (kvalita pitné vody, instalatérské práce, úprava vody, rozvody)
Další výzkumná témata v roce 2019 zahrnovala:
- Mikrobiální komunity v horkém (Yellowstonský národní park ) a studené (Antarktida ) prostředí
- Ekologie /fyziologie
- Matematické modelování mikrobiálních procesů a činností
- Metabolické systémová analýza
- Magnetická rezonance studie vlivu biofilmu na tok
- Mikrofluidika
- Mikroreologie
Postavení centra v mezinárodní výzkumné komunitě a jeho podpora spolupráce pravidelně láká hostující studenty a učitele z mnoha institucí v USA a zahraničí. Od roku 1990 do roku 2019 strávilo 315 hostujících výzkumníků z více než 30 zemí a 38 států USA několik týdnů až rok nebo více studiem biofilmů v laboratořích CBE. V roce 2019 provedlo výzkum v CBE 12 hostujících vědců a inženýrů.[58]
Průmyslové programy
Program střediska Industrial Associates poskytuje přístup k informacím o středisku, odborným znalostem, školení a dalším výhodám za roční předplatné. Program byl zahájen v roce 1983 zřízením Ústavu pro chemickou a biologickou analýzu procesů.[7] Výzkumná skupina Standardized Biofilm Methods (SBM) společnosti CBE se zaměřuje na otázky zajímavé pro společnosti vyvíjející nové produkty zabývající se tvorbou biofilmů. Vědci vyvíjejí, zdokonalují a publikují kvantitativní metody pro pěstování, ošetření, vzorkování a analýzu bakterií biofilmu. Členové laboratoře SBM spolupracují s mezinárodními organizacemi stanovujícími standardy, aby zajistili schválení metod biofilmu komunitou stanovující standardy.[59] Na základě smlouvy s Americká agentura na ochranu životního prostředí, SBM provádí laboratorní výzkum na podporu vývoje a standardizace zkušebních metod pro měření účinnosti antimikrobiálních produktů - včetně těch pro bakterie biofilmu - a poskytuje statistické služby související s Programem antimikrobiálního testování Office of Pesticide Programmes.[60] CBE vyvinulo standardy pro antimikrobiální testování přijaté v roce 2018 Agenturou pro ochranu životního prostředí USA. Normy jsou první, které se konkrétně vztahují na bakteriální biofilmy. Standardy jsou výsledkem výzkumu členky fakulty CBE Darly Goeresové, docentky pro výzkum chemického a biologického inženýrství. Standardy poskytují certifikační rámec pro společnosti, aby ověřily, že jejich produkty jsou účinné proti bakteriím z biofilmu, a odpovídajícím způsobem je označily, s prohlášením podobným „zabije 99,9% bakterií“ na lahvích s bělidly a jinými čisticími prostředky. Podle biostatikisty CBE Al Parkera chtějí výrobci antimikrobiálních látek získat certifikaci kvůli rostoucímu povědomí o bakteriálních biofilmech. Zájem podle něj mají zejména subjekty veřejného zdraví, jako jsou nemocnice - které běžně sterilizují lékařská zařízení, jako jsou chirurgické přístroje. "Došlo k posunu paradigmatu," řekl Parker, jehož statistická analýza hrála ústřední roli při formování testovacího rámce.
V roce 2013 spolupracovali ředitel CBE Phil Stewart a průmyslový koordinátor CBE Paul Sturman se společností US Food and Drug Administration (FDA) na spolufinancování jednodenního workshopu o biofilmech. Výsledný workshop „Biofilmy, zdravotnické prostředky a technologie proti biofilmu: výzvy a příležitosti“ se konal dne Areál FDA White Oak 20. února 2014.[61][62] Následné setkání hostované CBE 11. února 2015 v College Park, Maryland, s názvem „Anti-Biofilm Technologies: Pathways to Productivity“, se konala s cílem pokračovat v podpoře vědeckého dialogu mezi americkými vládními agenturami, průmyslem a akademickou obcí.[63]
Členské společnosti zastupovaly několik průmyslových kategorií, včetně energetiky / ropy, chemikálií / speciálních chemikálií, výrobků pro domácnost / spotřebního zboží, lékařství / zdravotní péče, zkušebních laboratoří, vládních laboratoří, vody, celulózy a papíru a těžby. Členové se pohybují od velkých Fortune 500 mezinárodní korporace až po malé začínající společnosti.
Vzdělávací program
Absolvovat a vysokoškoláci účastnit se interdisciplinárního výzkumu v centru. Studenti pracují pod vedením multidisciplinární fakulty na řešení problémů spojených s biofilmy v lékařských, průmyslových a environmentálních kontextech. Na výzkumu centra se v letech 2011 až 2019 podílela fakulta a studenti z následujících kateder a programů MSU.[64]
- Chemické a biologické inženýrství
- Chemie a biochemie
- Civilní a environmentální inženýrství
- Ekologie
- Land Resources & Environmental Sciences
- Vědy o materiálech
- Matematické vědy
- Strojní a průmyslové inženýrství
- Mikrobiologie a imunologie
- Moderní jazyky a literatura
Vysokoškolské studium
Centrum zkušeností s vysokoškolským výzkumem biofilmového inženýrství (URE) založil ředitel J.W. (Bill) Costerton a Ryan Jordan na konci 90. let. Kandidát na PhD (a následný vedoucí výzkumný pracovník na CBE) Jordan řídil první studenty URE CBE v rámci programu kvality vody v zapadákově v národním parku Yellowstone a divočině Bridger-Teton, kde se studenti URE pod vedením Jordánska stali prvními vědci, kteří identifikovali role biofilmu při selhání přenosných filtrů na úpravu vody používaných v aplikacích na zmírnění následků katastrof, vojenské a rekreační aplikace.
Vysokoškoláci jsou najímáni jako vysokoškolští asistenti a pracují v laboratořích CBE jako členové výzkumných týmů na interdisciplinárních projektech biofilmu. Vysokoškoláci CBE se vyzývají, aby získali kompetence v laboratorních dovednostech, experimentálním designu a skupinové komunikaci. Do roku 2019 pracovalo na laboratorních biofilmových projektech pod vedením členů fakulty přidružených k CBE 894 vysokoškolských studentů z 11 oborů. Třicet dva ze 49 vysokoškoláků (63%) v akademickém roce 2018-19 bylo žen.[58][64]
Postgraduální studium
Postgraduální studenti pokračují ve studiu v oborech nabízených prostřednictvím jednoho z vědeckých, zemědělských nebo technických oddělení na Montana State University, zatímco provádějí výzkum v laboratořích CBE. Postgraduální výbory studentů jsou obvykle interdisciplinární. Členové studentské a postgraduální komise si vybírají kurzy vhodné pro zájmy studenta a studijní program. Studentům inženýrství se doporučuje, aby absolvovali kurzy mikrobiologie; studenti přírodovědných oborů se vyzývají, aby absolvovali příslušné inženýrské kurzy. Postgraduální studenti získávají zkušenosti navrhováním a prováděním výzkumu, který překračuje hranice tradičních akademických disciplín a má přímý dopad na aktuální environmentální, průmyslové a lékařské problémy. Studenti pracují na projektech od základních po aplikovaná témata. Program CBE Industrial Associates navíc přináší studentům pracovní vztahy s potenciálními zaměstnavateli. Postgraduální studenti se vyzývají, aby rozvíjeli své komunikační a vůdčí schopnosti prostřednictvím prezentace na výzkumných konferencích, mentorování vysokoškolských studentů, organizování seminářových cyklů CBE a pomoci při terénních snahách.[65] Do konce roku 2018 získalo 266 postgraduálních studentů pokročilé tituly, z toho 105 s doktorským a 161 s magisterským. Během akademického roku 2018-19 bylo 39% postgraduálních studentů žena.[58][64]
Viz také
Poznámky
- ^ A b C d E Zpráva o výzkumu 1990, Montana State University (zpráva). s. 10–11.
- ^ A b „Granty na životní prostředí / ekologii“. Vědec. 4 (24): 25. 10. prosince 1990. Citováno 2015-02-27.
Zřídit nové Centrum pro mezifázové mikrobiální procesní inženýrství; práce se zaměří na bioznečištění a biokorozi, bioremediaci a biohydrometalurgii. 7,2 milionu USD z NSF na Montana State University, Bozeman.
- ^ A b „Original Charter“ (PDF). Národní vědecká nadace. 15. dubna 1990. Archivovány od originál (PDF) 2. dubna 2015. Citováno 2015-02-27.
- ^ A b C Potera, Carol (27. září 1996). „Biofilmy napadají mikrobiologii a inženýrství spojující mikrobiologii“. Věda. 273 (5283): 1795–1796. doi:10.1126 / science.273.5283.1795. JSTOR 2891076. PMID 8815541. S2CID 4812689.
- ^ A b „Výzkumný program CBE“. Státní univerzita v Montaně. Archivovány od originál dne 2015-02-27. Citováno 2015-02-27.
- ^ "Centrum pro mezifázové zpravodaje pro mikrobiální procesní inženýrství". V přípravě. Podzim 1992.
- ^ A b Brožura: „Státní univerzita v Montaně představuje Institut pro biologickou a chemickou analýzu procesů.“ 1983
- ^ Zpráva: „Strategický plán Ústavu pro biologickou a chemickou analýzu procesů.“ Února 1989, s. 50.
- ^ Strategický plán Ústavu pro biologickou a chemickou analýzu procesů (zpráva). Února 1989. str. 50.
- ^ Lewandowski Z, Lee W, Characklis WG, Little BJ (1989). "Měření rozpuštěného kyslíku a pH mikroelektrod na kovových površích ponořených do vody". Koroze. 45 (2): 92–98. doi:10.5006/1.3577838.
- ^ Wentland, Eric J .; Stewart, Philip S .; Huang, Ching-Tsan; McFeters, Gordon A. (1996). "Prostorové variace rychlosti růstu v koloniích a biofilmu Klebsiella pneumoniae". Pokrok v biotechnologii. 12 (3): 316–321. doi:10.1021 / bp9600243. PMID 8652119.
- ^ Jones, Warren L .; Dockery, Jack D .; Vogel, Curtis R .; Sturman, Paul J. (25. dubna 1993). „Difúze a reakce v porézním balicím médiu: fenomenologický model“. Biotechnologie a bioinženýrství. 41 (10): 947–956. doi:10,1002 / bit. 260411005. PMID 18601276.
- ^ Center for Biofilm Engineering News, 1993 duben; 1 (1): 1-3.
- ^ Costerton J. William; Ellis, Brian; Lam, Kan; Johnson, Frank; Khoury, Antoine E. (prosinec 1994). „Mechanismus elektrického zvýšení účinnosti antibiotik při zabíjení bakterií biofilmu“. Antimikrobiální látky a chemoterapie. 38 (12): 2803–2809. doi:10.1128 / aac.38.12.2803. PMC 188289. PMID 7695266.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
- ^ Davies, D.G .; Geesey, G.G. (Březen 1995). "Regulace alginátového biosyntetického genu algC v Pseudomonas aeruginosa během vývoje biofilmu v kontinuální kultuře". Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 61 (3): 860–7. doi:10.1128 / AEM.61.3.860-867.1995. PMC 167351. PMID 7793920.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
- ^ James, Garth A., Warwood, Bryan K .; Cunningham Alfred B .; Sturman, Paul J .; Hiebert, Randall; Costerton J.W. (24. května 1995). „Hodnocení tvorby a perzistence podpovrchové biobariéry“ (PDF). Sborník z 10. výroční konference o výzkumu nebezpečných odpadů, Manhattan, KS.: 82–91. Citováno 2015-03-06.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
- ^ Zpráva o zprávě a návrhu obnovy Centra pro biofilmové inženýrství, únor 1997; Tabulka 9.3.
- ^ Coghlan, Andy (31. srpna 1996). "Slime City". Nový vědec (2045): 32–36. ISSN 0262-4079. Citováno 2015-03-01.
- ^ Wu, Corinna (26. dubna 1997). „Materiál dává bakteriální filmy do nebe“. Vědecké zprávy. 151 (17): 253. doi:10.2307/4018488. JSTOR 4018488. Citováno 2015-03-01.
- ^ Sternberg, Steve (17. května 1998). „Zub věci: Zubní infekce spojené s jinými nemocemi“. Chicago Sun-Times.
- ^ Potera, Carol (19. března 1999). "Navázání spojení mezi biofilmy a nemocí". Věda. 283 (5409): 1837–1839. doi:10.1126 / science.283.5409.1837. JSTOR 2896613. PMID 10206887. S2CID 45123029.
- ^ Lízání, Ellen (12. září 1999). „Získání přilnavosti k bakteriálnímu slizu“. Pracovní týden. Citováno 2015-03-01.
- ^ Boyd, Robert S. (7. ledna 2000). "'Slizký, hrozný biofilm prostupuje každodenním životem “. Knight Ridder / Tribune News Service. Archivovány od originál dne 18. října 2016. Citováno 2015-03-01.
- ^ Chicurel, Marina (16. listopadu 2000). „Slime Busters, číslo 408“. Příroda. 408 (6810): 284–286. doi:10.1038/35042737. PMID 11099013.
- ^ Delude, Cathryn Delude (28. května 2002). „Viník v uších je„ biofilm “, který chrání bakterie.“. The Boston Globe. Archivovány od originál dne 18. října 2016. Citováno 2015-03-01.
- ^ Costerton, J.W .; Stewart, Philip S. (1. července 2001). „Bojovat s biofilmy“. Scientific American. 285 (1): 75–81. Bibcode:2001SciAm.285a..74C. doi:10.1038 / scientificamerican0701-74. PMID 11432197.
- ^ Závěrečná zpráva Centra pro biofilmové inženýrství. Únor 2001. str.
- ^ A b de Beer, Dirk; Srinivasan, Rohini; Stewart, Philip S. (prosinec 1994). "Přímé měření pronikání chloru do biofilmů během dezinfekce". Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 60 (12): 4339–4344. doi:10.1128 / AEM.60.12.4339-4344.1994. PMC 201990. PMID 7811074.
- ^ Mah, Thien Fah; Pitts, Betsey; Pellock, Brett; Walker, Graham C .; Stewart, Philip S .; O’Toole, George A. (20. listopadu 2003). „Genetický základ rezistence na antibiotikum vůči biofilmu Pseudomonas aeruginosa“. Příroda. 426 (6964): 306–310. Bibcode:2003 Natur.426..306M. doi:10.1038 / nature02122. PMID 14628055. S2CID 4412747.
- ^ Walters, Marshall C. III; Roe, Frank; Bugnicourt, Amandine; Franklin, Michael J .; Stewart, Philip S. (leden 2003). „Příspěvky penetrace antibiotik, omezení kyslíku a nízké metabolické aktivity k toleranci biofilmů Pseudomonas aeruginosa k ciprofloxacinu a tobramycinu“. Antimikrobiální látky a chemoterapie. 47 (1): 317–323. doi:10.1128 / aac.47.1.317-323.2003. PMC 148957. PMID 12499208.
- ^ „ERC Graduated Centers (self-sustaining)“. Sdružení Engineering Research Center. Citováno 2015-02-28.
- ^ David G. Davies, Matthew R. Parsek, James P. Pearson, Barbara H. Iglewski J. W. Costerton a E. P. Greenberg (10. dubna 1998). „Zapojení signálů mezi buňkami do vývoje bakteriálního biofilmu“. Věda. 280 (5361): 295–298. Bibcode:1998Sci ... 280..295D. doi:10.1126 / science.280.5361.295. JSTOR 2895685. PMID 9535661. S2CID 2887211.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
- ^ Alfred B. Cunningham, Wllllam G. Characklls, Felsal Abedeen a David Crawford (červenec 1991). "Vliv akumulace biofilmu na hydrodynamiku porézních médií". Věda o životním prostředí a technologie. 25 (7): 1305–1311. Bibcode:1991EnST ... 25.1305C. doi:10.1021 / es00019a013.CS1 maint: používá parametr autoři (odkaz)
- ^ Mitchell, A .; Phillips, A .; Kaszuba, J .; Hollis, W .; Cunningham, A .; Gerlach, R. (únor 2009). „Mikrobiálně vylepšená mineralizace uhličitanů a geologická izolace CO2“. Energetické postupy. 1 (1): 3245–3252. doi:10.1016 / j.egypro.2009.02.109.
- ^ Klapper I, Rupp CJ, Cargo R, Purevdorj B a Stoodley P (5. listopadu 2002). "Popis viskoelastických tekutin vlastností bakteriálních biofilmových materiálů". Biotechnologie a bioinženýrství. 80 (3): 289–296. doi:10,1002 / bit. 10376. PMID 12226861.
- ^ Peyton BM, Characklis WG (1993). "Statistická analýza vlivu využití substrátu a smykového napětí na kinetiku oddělení biofilmu". Biotechnol Bioeng. 41 (7): 728–735. doi:10,1002 / bit. 260410707. PMID 18609615.
- ^ Buckingham-Meyer, Kelli; Goeres, Darla M .; Hamilton, Martin A. (srpen 2007). "Srovnávací hodnocení testů účinnosti dezinfekčních prostředků na biofilmu". Journal of Microbiolic Methods. 70 (2): 236–244. doi:10.1016 / j.mimet.2007.04.010. PMID 17524505.
- ^ James, Garth A .; Swogger, Ellen; Wolcott, Randall; Pulcini, Elinor deLancey; Seocr, Patrick; Sestrich, Jennifer; Costerton, John W .; Stewart, Philip S. (únor 2008). "Biofilmy u chronických ran". Oprava a regenerace ran. 16 (1): 37–44. doi:10.1111 / j.1524-475x.2007.00321.x. PMID 18086294.
- ^ Fields, Matthew W .; Hise, Adam; Lohman, Egan J .; Bell, Tisza; Gardner, Rob D .; Corredor, Luisa; Moll, Karen; Peyton, Brent M .; Characklis, Gregory W .; Gerlach, Robin (červen 2014). „Zdroje a zdroje: Význam živin, alokace zdrojů a ekologie při pěstování mikrořas pro akumulaci lipidů“. Aplikovaná mikrobiologie a biotechnologie. 98 (11): 4805–4816. doi:10.1007 / s00253-014-5694-7. PMC 4024127. PMID 24695829.
- ^ Dickinson, W.H .; Caccavo, F .; Olesen, B .; Lewandowski, Z. (červenec 1997). „Zušlechťování nerezové oceli bakterií Leptothrix discophora usazující mangan“. Aplikovaná a environmentální mikrobiologie. 63 (7): 2502–2506. doi:10.1128 / AEM.63.7.2502-2506.1997. PMC 1389190. PMID 16535635.
- ^ Chen CI, Reinsel MA, Mueller RF (1994). „Kinetické vyšetřování mikrobiálního zakysání v porézních médiích pomocí mikrobiálních konsorcií z ropných nádrží“. Biotechnol Bioeng. 44 (3): 263–269. doi:10,1002 / bit. 260440302. PMID 18618741.
- ^ De Beer D, Stoodley P, Roe F, Lewandowski Z (1994). "Účinky struktur biofilmu na distribuci kyslíku a hromadný transport". Biotechnol Bioeng. 43 (11): 1131–1138. doi:10,1002 / bit. 260431118. PMID 18615526.
- ^ Mah, Thien-Fah; O’Toole, George A .; Pellock, Brett; Pitts, Betsey; Stewart, Philip S .; Walker, Graham C. (20. listopadu 2003). „Genetický základ rezistence na antibiotikum vůči biofilmu Pseudomonas aeruginosa“. Příroda. 426 (6964): 306–310. Bibcode:2003 Natur.426..306M. doi:10.1038 / nature02122. PMID 14628055. S2CID 4412747.
- ^ Stewart, Philip S .; Costerton, J.W. (14. července 2001). "Antibiotická rezistence bakterií v biofilmech". Lanceta. 358 (9276): 135–138. doi:10.1016 / s0140-6736 (01) 05321-1. PMID 11463434.
- ^ Davies, David G .; Parsek, Matthew R .; Pearson, James P .; Iglewski, Barbara H .; Costerton, J.W .; Greenberg, E.P. (10. dubna 1998). „Zapojení signálů mezi buňkami do vývoje bakteriálního biofilmu“. Věda. 280 (5361): 295–298. Bibcode:1998Sci ... 280..295D. doi:10.1126 / science.280.5361.295. JSTOR 2895685. PMID 9535661. S2CID 2887211.
- ^ Costerton, J.W .; Stewart Philip S .; Greenberg, E.P. (21. května 1999). „Bakteriální biofilmy: běžná příčina přetrvávajících infekcí“. Věda. 284 (5418): 1318–1322. Bibcode:1999Sci ... 284.1318C. doi:10.1126 / science.284.5418.1318. JSTOR 2899085. PMID 10334980.
- ^ Ehrlich, Garth D .; Veeh, Richard; Wang, Xue; Costerton, J. William; Hayes, Jay D .; Hu, Fen Ze; Daigle, Bernie J .; Ehrlich, Miles D .; Post, J. Christopher (3. dubna 2002). "Tvorba slizničního biofilmu na sliznici středního ucha v modelu činčily zánětu středního ucha". JAMA. 287 (13): 1710–1715. doi:10.1001 / jama.287.13.1710. PMID 11926896.
- ^ DePas, William H .; Hufnagel, David A .; Lee, John S .; Blanco, Luz P .; Bernstein, Hans C .; Fisher, Steve T .; James, Garth A .; Stewart, Philip S .; Chapman, Matthew R. (12. února 2003). „Železo indukuje bimodální populační vývoj Escherichia coli“. PNAS. 110 (7): 2629–2634. doi:10.1073 / pnas.1218703110. PMC 3574911. PMID 23359678.
- ^ Christner, Brent C .; Cai, Rongman; Morris, Cindy E .; McCarter, Kevin S .; Foreman, Christine M .; Skidmore, Mark L .; Montross, Scott N .; Sands, David C. (2. prosince 2008). „Geografický, sezónní a srážkový chemický vliv na hojnost a aktivitu biologických ledových nukleatorů v dešti a sněhu“. PNAS. 105 (48): 18854–18859. Bibcode:2008PNAS..10518854C. doi:10.1073 / pnas.0809816105. JSTOR 25465556. PMC 2596265. PMID 19028877.
- ^ Hentzer, Morten; Wu, Hong; Anderson, Jens Bo; Riedel, Kathrin; Rasmussen, Thomas B .; Bagge, Niels; Kumar, Naresh; Schembri, Mark A .; Song, Zhijun; Kristoffersen, Peter; Manefield, Mike; Costerton, John W .; Molin, Søren; Eberl, Leo; Steinberg, Peter; Kjelleberg, Staffan; Høiby, Niels; Givskov, Michael (1. srpna 2003). „Útlum virulence Pseudomonas aeruginosa inhibitory snímání kvora“. Časopis EMBO. 22 (15): 3803–3815. doi:10.1093 / emboj / cdg366. PMC 169039. PMID 12881415.
- ^ On, Qiang; On, Zhili; Joyner, Dominique C .; Joachimiak, Marcin; Price, Morgan N .; Yang, Zamin K .; Yen, Huei-Che Bill; Hemme, Christopher L .; Chen, Wenqiong; Fields, Matthew M .; Stahl, David A .; Keasling, Jay D .; Keller, Martin; Arkin, Adam P .; Hazen, Terry C .; Wall, Judy D .; Zhou, Jizhong (listopad 2010). „Dopad zvýšeného dusičnanu na bakterie snižující síran: Srovnávací studie Desulfovibrio vulgaris“. Časopis ISME. 4 (11): 1386–97. doi:10.1038 / ismej.2010.59. PMID 20445634.
- ^ Hwang, Chiachi; Wu, Weimin; Gentry, Terry J .; Carley, Jack; Corbin, Gail A .; Carroll, Sue L .; Watson, David B .; Jardine, Phil M .; Zhou, Jizhong; Criddle, Craig S .; Fields, Matthew W. (2009). „Postupnost bakteriálních společenstev během bioremediace uranu in situ: prostorové podobnosti podél cest řízeného toku“. Časopis ISME. 3 (1): 47–64. doi:10.1038 / ismej.2008.77. PMID 18769457.
- ^ Stewart, Philip S .; Franklin, Michael J. (březen 2008). "Fyziologická heterogenita v biofilmech". Příroda Recenze Mikrobiologie. 6 (3): 199–210. doi:10.1038 / nrmicro1838. PMID 18264116. S2CID 5477887.
- ^ Hall-Stoodley, Luanne; Costerton, John W .; Stoodley, Paul (únor 2004). „Bakteriální biofilmy: Od prostředí k infekčním chorobám“. Příroda Recenze Mikrobiologie. 2 (2): 95–108. doi:10.1038 / nrmicro821. PMID 15040259. S2CID 9107205.
- ^ Seymour, Joseph D .; Gage, Justin P .; Codd, Sarah L .; Gerlach, Robin (5. listopadu 2004). „Anomální transport tekutin v porézním médiu vyvolaný růstem biofilmu“. Dopisy o fyzické kontrole. 93 (19): 198103. Bibcode:2004PhRvL..93s8103S. doi:10.1103 / fyzrevlett.93.198103. PMID 15600886.
- ^ „Databáze publikací CBE“. Státní univerzita v Montaně. Archivovány od originál dne 2015-02-27. Citováno 2015-02-27.
- ^ „Průzkumné obrázky“. Státní univerzita v Montaně. Archivovány od originál dne 02.04.2015. Citováno 2015-03-05.
- ^ A b C Centrum MSU pro biofilmové inženýrství 25 let a roste (PDF) (Zpráva). 2014. s. 1–24. Archivovány od originál (PDF) dne 02.04.2015. Citováno 2015-02-27.
- ^ Griffin K (22. listopadu 2013). „Člen fakulty CBE oceněn společností ASTM International“. Státní univerzita v Montaně. Archivovány od originál 2. března 2015. Citováno 2015-02-27.
- ^ Becker, Michael (22. srpna 2008). „Výzkum biofilmů MSU pomáhá stanovit standardy pro výrobky každodenní potřeby“. MSU News Service. Citováno 2015-02-27.
- ^ „FDA uspořádá fórum o technologii proti biofilmu“. Státní zpravodajská služba. 24. ledna 2014. Citováno 20. ledna 2016.
- ^ „Public Workshop - Biofilms, Medical Devices and Anti-Biofilm Technology - Challenges and Opportunities, 20. února 2014“. Web federálního registru. Citováno 2015-02-27.
- ^ „Agenda: Anti-Biofilm Technologies: Pathways to Product Development“ (PDF). Státní univerzita v Montaně. 20. února 2014. Archivovány od originál (PDF) 2. dubna 2015. Citováno 2015-02-27.
- ^ A b C Dodatek CBE 2014, výroční zpráva CBE (PDF) (Zpráva). Centrum MSU pro biofilmové inženýrství. 2014. s. 16, 19–23. Archivovány od originál (PDF) dne 2015-09-21. Citováno 2015-02-27.
- ^ „Postgraduální vzdělávání CBE“. Státní univerzita v Montaně. Archivovány od originál dne 02.04.2015. Citováno 2015-02-27.