Campylobacter concisus - Campylobacter concisus

Campylobacter concisus
Vědecká klasifikace Upravit
Doména:Bakterie
Kmen:Proteobakterie
Třída:Epsilonproteobakterie
Objednat:Campylobacterales
Rodina:Campylobacteraceae
Rod:Campylobacter
Druh:
C. concisus
Binomické jméno
Campylobacter concisus
Tanner a kol., 1981

Campylobacter concisus je Gramnegativní, velmi náročný, mezofilní bakterie, která roste za anaerobních i mikroaerobní podmínky s přítomností vodíku významně napomáhající růstu.[1] Pohyblivý, s unipolární nebo bipolární bičíky, organismy mají charakteristickou spirálu /vývrtka vzhled a jsou oxidáza -pozitivní.[2][3][4] I když je lidská ústní dutina přirozeným místem kolonizace bakterie, C. concisus může také kolonizovat střevní trakt některých jedinců.[5] Několik studií zejména uvádí vyšší střevní prevalenci C. concisus u pacientů s IBD ve srovnání se zdravými kontrolami,[6][7] což vedlo k současným spekulacím o implikaci bakterie při vyvolání Crohnovy choroby.

Bylo definováno několik studií C. concisus být složen ze dvou fenotypicky identických, přesto genomicky odlišných genomoskupin analýzou amplifikovaných polymorfismů délky fragmentů (AFLP), housekeeping genů a metodou PCR zaměřenou na polymorfismy C. concisus Gen 23S rRNA.[8][9][10][11][12][13] Zdá se, že tyto dva genomoskupiny mají různé úrovně enterického patogenního potenciálu, a to orálně C. concisus kmeny, které byly invazivní k lidské epiteliální buněčné linii (Caco2) nalezené pouze v Genomospecies-2 (GS2).[14][15]

Nedávno a C. concisus molekulární marker csep1, zejména csep1 gen s inzercí šesti nukleotidů (csep1-6bpi) bylo zjištěno, že je spojeno s aktivní Crohnovou chorobou, a bylo zjištěno, že plazmid pSma1 je spojen s těžkou ulcerózní kolitidou.[16][17] The csep1 Gen může být umístěn buď v plazmidu pICON, nebo v chromozomu.

Reference

  1. ^ Lee, Hoyul (2014). „Zkoumání anaerobního růstu kmenů Campylobacter concisus“. International Journal of Microbiology. 2014: 476047. doi:10.1155/2014/476047. PMC  4158115. PMID  25214843.
  2. ^ Tanner, A. C. R .; Badger, S .; Lai, C.-H; Listgarten, M. A .; Visconti, R. A .; Socransky, S. S. (1981). „Wolinella gen. Nov., Wolinella succinogenes (Vibrio succinogenes Wolin et al.) Komb. Nov. A Popis Bacteroides gracilis sp. Nov., Wolinella recta sp. Nov., Campylobacter concisus sp. Nov. A Eikenella corrodens z Lidé s periodontální nemocí ". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 31 (4): 432–45. doi:10.1099/00207713-31-4-432.
  3. ^ P. Vandamme; F. E. Dewhirst; B. J. Paster; S. L. W. On (2005). "Rod I. Campylobacter". In Garrity, G .; Krieg, N.R .; Staley, J. T .; Brenner, D. J. (eds.). Bergeyho příručka systematické bakteriologie (2. vyd.). NY, USA: Springer-Verlag New York. str. 1147–1160. ISBN  978-0-387-29298-4.
  4. ^ Ryan KJ; Ray CG, eds. (2004). Sherris Medical Microbiology (4. vydání). McGraw Hill. 378–80. ISBN  978-0-8385-8529-0.
  5. ^ Zhang, Li; Budiman, Vanna; Day, Andrew S .; Mitchell, Hazel; Lemberg, Daniel A .; Riordan, Stephen M .; Grimm, Michael; Leach, Steven T .; Ismail, Yazan (01.08.2010). „Izolace a detekce Campylobacter concisus ze slin zdravých jedinců a pacientů se zánětlivým onemocněním střev“. Journal of Clinical Microbiology. 48 (8): 2965–2967. doi:10.1128 / JCM.02391-09. ISSN  1098-660X. PMC  2916630. PMID  20519479.
  6. ^ Mahendran, Vikneswari; Riordan, Stephen M .; Grimm, Michael C .; Tran, Thi Anh Tuyet; Major, Joelene; Kaakoush, Nadeem O .; Mitchell, Hazel; Zhang, Li (2011-09-23). „Prevalence druhů Campylobacter u dospělých Crohnovy choroby a preferenční místa kolonizace druhů Campylobacter v lidském střevě“. PLOS One. 6 (9): e25417. doi:10.1371 / journal.pone.0025417. ISSN  1932-6203. PMC  3179513. PMID  21966525.
  7. ^ Zhang, Li; Muž, Si Ming; Day, Andrew S .; Leach, Steven T .; Lemberg, Daniel A .; Dutt, Shoma; Stormon, Michael; Otley, Anthony; O'Loughlin, Edward V. (01.02.2009). „Detekce a izolace druhů Campylobacter jiných než C. jejuni od dětí s Crohnovou chorobou“. Journal of Clinical Microbiology. 47 (2): 453–455. doi:10.1128 / jcm.01949-08. ISSN  0095-1137. PMC  2643684. PMID  19052183.
  8. ^ Aabenhus, Rune; Dne, Stephen L. W .; Siemer, Berit L .; Permin, Henrik; Andersen, Leif P. (10.10.2005). „Vymezení genomů druhu Campylobacter concisus pomocí amplifikované analýzy délky fragmentů a korelace výsledků s klinickými údaji“. Journal of Clinical Microbiology. 43 (10): 5091–5096. doi:10.1128 / JCM.43.10.5091-5096.2005. ISSN  0095-1137. PMC  1248439. PMID  16207968.
  9. ^ Kalischuk, Lisa D .; Inglis, G. Douglas (01.01.2011). „Srovnávací genotypové a patogenní vyšetření Campylobacter concisusisolates od průjmových a neprůhledných lidí“. Mikrobiologie BMC. 11: 53. doi:10.1186/1471-2180-11-53. ISSN  1471-2180. PMC  3068073. PMID  21406111.
  10. ^ Miller, William G .; Chapman, Mary H .; Yee, Emma; Dne, Stephen L. W .; McNulty, Desmond K .; Lastovica, Albert J .; Carroll, Anne M .; McNamara, Eleanor B .; Duffy, Geraldine (01.01.2012). „Metody typizace multilokusových sekvencí pro nově vznikající druhy Campylobacter C. hyointestinalis, C. lanienae, C. sputorum, C. concisus a C. curvus“. Hranice v buněčné a infekční mikrobiologii. 2: 45. doi:10.3389 / fcimb.2012.00045. ISSN  2235-2988. PMC  3417633. PMID  22919636.
  11. ^ Mahendran, Vikneswari; Octavia, Sophie; Demirbas, Omer Faruk; Sabrina, Sheryl; Ma, Rena; Lan, Ruiting; Riordan, Stephen M .; Grimm, Michael C .; Zhang, Li (01.01.2015). „Vymezení genetické příbuznosti a populační struktury kmenů Campylobacter concisus orálně a entericky analýzou domácích genů“. Mikrobiologie. 161 (8): 1600–1612. doi:10,1099 / mic.0.000112. PMID  26002953.
  12. ^ Engberg, J .; Bang, D.D .; Aabenhus, R .; Aarestrup, F.M .; Fussing, V .; Gerner-Smidt, P. (01.04.2005). „Campylobacter concisus: hodnocení určitých fenotypových a genotypových charakteristik“. Klinická mikrobiologie a infekce. 11 (4): 288–295. doi:10.1111 / j.1469-0691.2005.01111.x. ISSN  1198-743X. PMID  15760425.
  13. ^ Chung, Heung Kit Leslie; Tay, Alfred; Octavia, Sophie; Chen, Jieqiong; Liu, Fang; Ma, Rena; Lan, Ruiting; Riordan, Stephen M; Grimm, Michael C. (2016-12-02). „Analýza genomu kmenů Campylobacter concisus u pacientů se zánětlivým onemocněním střev a gastroenteritidou poskytuje nové poznatky o patogenitě“. Vědecké zprávy. 6 (1): 38442. doi:10.1038 / srep38442. ISSN  2045-2322. PMC  5133609. PMID  27910936.
  14. ^ Ismail, Yazan; Mahendran, Vikneswari; Octavia, Sophie; Day, Andrew S .; Riordan, Stephen M .; Grimm, Michael C .; Lan, Ruiting; Lemberg, Daniel; Tran, Thi Anh Tuyet (2012-05-30). „Vyšetřování enterického patogenního potenciálu kmenů orální Campylobacter concisus izolovaných od pacientů se zánětlivým onemocněním střev“. PLOS One. 7 (5): e38217. doi:10.1371 / journal.pone.0038217. ISSN  1932-6203. PMC  3364211. PMID  22666490.
  15. ^ Mahendran, Vikneswari; Liu, Fang; Riordan, Stephen M .; Grimm, Michael C .; Tanaka, Mark M .; Zhang, Li (01.01.2016). „Zkoumání účinků Campylobacter concisus zonula occludens toxin na buňky střevního epitelu a makrofágy“. Střevní patogeny. 8: 18. doi:10.1186 / s13099-016-0101-9. ISSN  1757-4749. PMC  4870807. PMID  27195022.
  16. ^ Fang, Liu; Rena, Ma; Chin Yen Alfred, Tay; Sophie, Octavia; Ruiting, Lan; Heung Kit Leslie, Chung; Stephen M, Riordan; Michael C, Grimm; Rupert W, Leong; Mark M, Tanaka (2018). "Genomická analýza orálně Campylobacter concisus kmeny identifikovaly potenciální bakteriální molekulární marker spojený s aktivní Crohnovou chorobou ". Nové mikroby jsou infikovány. 7 (1): 64. doi:10.1038 / s41426-018-0065-6. PMC  5893538. PMID  29636463.
  17. ^ Fang, Liu; Siying, Chen; Laurence Don Wai, Luu; Seul A, Lee; Alfred Chin Yen, Tay; Ruochen, Wu; Stephen M, Riordan; Ruiting, Lan; Lu, Liu; Li, Zhang (2020). „Analýza úplných genomů Campylobacter concisus identifikuje vlastnosti genomových druhů, sekreční systémy a nové plazmidy a jejich souvislost s těžkou ulcerózní kolitidou“. Mikrobiální genomika. 6 (11). doi:10,1099 / mg. 0,000457. PMID  33111662.