Vápník vázající EGF doména - Calcium-binding EGF domain - Wikipedia
| Vápník vázající EGF doména | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 krystalová struktura lidského proteinu asociovaného s mbl 19 (mapa19) | |||||||||
| Identifikátory | |||||||||
| Symbol | EGF_CA | ||||||||
| Pfam | PF07645 | ||||||||
| Pfam klan | CL0001 | ||||||||
| InterPro | IPR013091 | ||||||||
| CDD | cd00054 | ||||||||
| |||||||||
V molekulární biologii se vápník vázající EGF doména je Doména podobná EGF asi čtyřicet aminokyselin zbytky nalezen v epidermální růstový faktor (EGF). Tato doména je přítomna ve velkém počtu vázané na membránu a extracelulární, většinou zvířecí, bílkoviny.[1][2][3][4][5] Mnoho z nich bílkoviny vyžadovat vápník pro jejich biologickou funkci a místo vázající vápník bylo nalezeno na N-konci některých podobných EGF domén.[6] Vázání vápníku může být pro mnohé klíčové interakce protein-protein.
Pro člověk koagulační faktor IX bylo prokázáno, že vápníkové ligandy tvoří pětiúhelníkový bipyramid.[7] První, třetí a čtvrtý konzervovaný záporně nabitý nebo polární zbytek jsou boční řetěz ligandy. Ten druhý je možná hydroxylovaný.[6] Konzervovaný aromatický Předpokládá se, že zbytek, stejně jako druhý konzervovaný negativní zbytek, se účastní stabilizace místa vázajícího vápník.
Stejně jako při nevápnění vápníku Domény podobné EGF, je jich šest konzervovaných cysteiny a struktura obou typů je velmi podobný, protože vazba vápníku indukuje pouze přísně lokálně strukturální Změny.[6]
Reference
- ^ Davis CG (květen 1990). "Mnoho tváří epidermálního růstového faktoru se opakuje". New Biol. 2 (5): 410–9. PMID 2288911.
- ^ Blomquist MC, Hunt LT, Barker WC (prosinec 1984). „Protein viru vakcinie o hmotnosti 19 kilodaltonů: vztah k několika savčím proteinům, včetně dvou růstových faktorů“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 81 (23): 7363–7. doi:10.1073 / pnas.81.23.7363. PMC 392146. PMID 6334307.
- ^ Barker WC, Johnson GC, Hunt LT, George DG, Tsugita A (červen 1986). "[Podobné domény v různých proteinech: detekce a význam]". Tanpakushitsu Kakusan Koso (v japonštině) (29 doplňků): 54–68. PMID 3534958.
- ^ Doolittle RF, Feng DF, Johnson MS (1984). "Počítačová charakterizace prekurzoru epidermálního růstového faktoru". Příroda. 307 (5951): 558–60. doi:10.1038 / 307558a0. PMID 6607417. S2CID 4305008.
- ^ Appella E, Weber IT, Blasi F (duben 1988). "Struktura a funkce oblastí podobných epidermálním růstovým faktorům v proteinech". FEBS Lett. 231 (1): 1–4. doi:10.1016/0014-5793(88)80690-2. PMID 3282918. S2CID 36825870.
- ^ A b C Selander-Sunnerhagen M, Ullner M, Persson E, Teleman O, Stenflo J, Drakenberg T (září 1992). „Jak se doména podobná epidermálnímu růstovému faktoru (EGF) váže na vápník. NMR struktura s vysokým rozlišením vápníkové formy NH2-koncové domény podobné EGF v koagulačním faktoru X“. J. Biol. Chem. 267 (27): 19642–9. PMID 1527084.
- ^ Rao Z, Handford P, Mayhew M, Knott V, Brownlee GG, Stuart D (červenec 1995). „Struktura domény podobné epidermálnímu růstovému faktoru vázající se na Ca (2 +): její role v interakcích protein-protein“. Buňka. 82 (1): 131–41. doi:10.1016/0092-8674(95)90059-4. PMID 7606779. S2CID 8741348.