CTDSPL - CTDSPL

CTDSPL

Protein CTDSPL PDB 2hhl.png

Dostupné struktury

Hledání ortologu: PDBe RCSB

Seznam id kódů PDB
2HHL

Identifikátory

CTDSPL, C3orf8, HYA22, PSR1, RBSP3, SCP3, CTD malá fosfatáza jako

Externí ID

OMIM: 608592 MGI: 1916524 HomoloGene: 48881 Genové karty: CTDSPL

Umístění genu (člověk)

Chr.	Chromozom 3 (lidský)^[1]

Kapela	3p22.2	Start	37,861,880 bp^[1]
Kapela	3p22.2	Konec	37,984,469 bp^[1]

Umístění genu (myš)

Chr.	Chromozom 9 (myš)^[2]

Kapela	9 \| 9 F3	Start	118,926,453 bp^[2]
Kapela	9 \| 9 F3	Konec	119,043,998 bp^[2]

Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita fosfatázy • aktivita fosfoprotein fosfatázy • aktivita hydrolázy • vazba kovových iontů • GO: 0001948 vazba na proteiny • molekulární funkce • Aktivita CTD fosfatázy
Buněčná složka	• extracelulární exosom • buněčné jádro
Biologický proces	• negativní regulace přechodu G1 / S mitotického buněčného cyklu • negativní regulace fosforylace bílkovin • defosforylace • defosforylace bílkovin • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • biologický proces
Zdroje:Amigo / QuickGO

Druh

Člověk

Myš


10217


69274


ENSG00000144677


ENSMUSG00000047409


O15194


P58465

RefSeq (mRNA)


NM_005808 NM_001008392


NM_133710

RefSeq (protein)


NP_001008393 NP_005799


NP_598471

Místo (UCSC)

Chr 3: 37,86 - 37,98 Mb

Chr 9: 118,93 - 119,04 Mb

PubMed Vyhledávání

^[3]

^[4]

Zobrazit / upravit člověka

Zobrazit / upravit myš

CTD malý protein podobný fosfatáze je enzym že u lidí je kódován CTDSPL gen.^[5]^[6]^[7]

Interakce

CTDSPL bylo prokázáno komunikovat s SNAI1.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000144677 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000047409 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Ishikawa S, Kai M, Tamari M, Takei Y, Takeuchi K, Bandou H, Yamane Y, Ogawa M, Nakamura Y (srpen 1997). "Sekvenční analýza 685 kb genomové oblasti na chromozomu 3p22-p21.3, který je homozygotně odstraněn v buněčné linii karcinomu plic". DNA Res. 4 (1): 35–43. doi:10.1093 / dnares / 4.1.35. PMID 9179494.
^ Protopopov A, Kashuba V, Zabarovska VI, Muravenko OV, Lerman MI, Klein G, Zabarovsky ER (leden 2003). „Integrovaná fyzická a genová mapa 3,5 MB oblasti chromozomu 3p21.3 (AP20) podílející se na hlavních lidských epiteliálních malignancích“. Cancer Res. 63 (2): 404–12. PMID 12543795.
^ „Entrez Gene: CTDSPL CTD (karboxy-terminální doména, RNA polymeráza II, polypeptid A) malý jako fosfatáza“.
^ Wu, Yadi; Evers B Mark; Zhou Binhua P (leden 2009). „Fosfatáza z malé C-koncové domény zvyšuje aktivitu hlemýžďů prostřednictvím defosforylace“. J. Biol. Chem. Spojené státy. 284 (1): 640–8. doi:10,1074 / jbc.M806916200. ISSN 0021-9258. PMC 2610500. PMID 19004823.

Další čtení

O'Keeffe B, Fong Y, Chen D a kol. (2000). "Požadavek na kinázově specifickou chaperonovou dráhu při produkci heterodimeru Cdk9 / cyklin T1 odpovědného za P-TEFb zprostředkovanou stimulaci tat transkripce HIV-1". J. Biol. Chem. 275 (1): 279–87. doi:10.1074 / jbc.275.1.279. PMID 10617616.
Kim JB, Sharp PA (2001). "Pozitivní transkripční elongační faktor B fosforyluje hSPT5 a RNA polymerázu II karboxyl-terminální doménu nezávisle na cyklin-dependentní kináze aktivující kinázu". J. Biol. Chem. 276 (15): 12317–23. doi:10,1074 / jbc.M010908200. PMID 11145967.
Ramanathan Y, Rajpara SM, Reza SM a kol. (2001). „Tři kinázy karboxyl-terminální domény RNA polymerázy II vykazují odlišné preference substrátu“. J. Biol. Chem. 276 (14): 10913–20. doi:10,1074 / jbc.M010975200. PMID 11278802.
Zhou M, Nekhai S, Bharucha DC a kol. (2002). „TFIIH inhibuje CDK9 fosforylaci během transkripce viru lidské imunodeficience typu 1“. J. Biol. Chem. 276 (48): 44633–40. doi:10,1074 / jbc.M107466200. PMID 11572868.
Lin X, Taube R, Fujinaga K, Peterlin BM (2002). „P-TEFb obsahující cyklin K a Cdk9 mohou aktivovat transkripci pomocí RNA“. J. Biol. Chem. 277 (19): 16873–8. doi:10,1074 / jbc.M200117200. PMID 11884399.
Kim YK, Bourgeois CF, Isel C a kol. (2002). „Fosforylace karboxyl-terminální domény RNA polymerázy II pomocí CDK9 je přímo zodpovědná za transkripční prodloužení aktivované Tat lidského viru imunodeficience typu 1“. Mol. Buňka. Biol. 22 (13): 4622–37. doi:10.1128 / MCB.22.13.4622-4637.2002. PMC 133925. PMID 12052871.
Yeo M, Lin PS, Dahmus ME, Gill GN (2003). „Nová RNA polymeráza II C-koncová doménová fosfatáza, která přednostně defosforyluje serin 5“. J. Biol. Chem. 278 (28): 26078–85. doi:10,1074 / jbc.M301791200. PMID 12721286.
Pinhero R, Liaw P, Bertens K, Yankulov K (2004). „Tři cyklin-dependentní kinázy přednostně fosforylují různé části C-koncové domény velké podjednotky RNA polymerázy II“. Eur. J. Biochem. 271 (5): 1004–14. doi:10.1111 / j.1432-1033.2004.04002.x. PMID 15009212.
Kashuba VI, Li J, Wang F a kol. (2004). „RBSP3 (HYA22) je gen potlačující nádor zapojený do hlavních epiteliálních malignit“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (14): 4906–11. Bibcode:2004PNAS..101,4906K. doi:10.1073 / pnas.0401238101. PMC 387347. PMID 15051889.

externí odkazy

CTDSPL umístění lidského genu v UCSC Genome Browser.
CTDSPL podrobnosti o lidském genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 3 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.