CST6 (gen) - CST6 (gene)

CST6
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4N6L, 4N6M, 4N6N, 4N6O
Identifikátory
Aliasy	CST6, cystatin E / M, ECTD15
Externí ID	OMIM: 601891 MGI: 1920970 HomoloGene: 1011 Genové karty: CST6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 11 (lidský)
Konec	66,013,505 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 19 (myš)
Konec	5,349,574 bp
Exprese RNA vzor
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita inhibitoru peptidázy; • vazba proteázy; • aktivita inhibitoru endopeptidázy cysteinového typu;
Buněčná složka	• extracelulární oblast; • extracelulární exosom; • zrohovatělá obálka; • extracelulární;
Biologický proces	• anatomická struktura morfogeneze; • negativní regulace aktivity peptidázy; • vývoj epidermis; • negativní regulace aktivity endopeptidázy cysteinového typu; • negativní regulace aktivity endopeptidázy;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1474
	73720
	ENSG00000175315
	ENSMUSG00000024846
	Q15828
	Q9D1B1
	NM_001323
	NM_028623
	NP_001314
	NP_082899
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Cystatin-M je protein že u lidí je kódován CST6 gen.^[5]^[6]^[7]

Cystatinová nadrodina zahrnuje proteiny, které obsahují více sekvencí podobných cystatinu. Někteří členové jsou aktivními inhibitory cysteinové proteázy, zatímco jiní tuto inhibiční aktivitu ztratili nebo snad nikdy nezískali. V nadrodině existují tři inhibiční rodiny, včetně cystatinů typu 1 (stefiny), cystatinů typu 2 a kininogenů. Cystatinové proteiny typu 2 jsou třídou inhibitorů cysteinové proteinázy, které se nacházejí v různých lidských tekutinách a sekrecích, kde se zdá, že poskytují ochranné funkce. Tento gen kóduje cystatin z rodiny typu 2, který je ve srovnání s buňkami primárního nádoru down-regulován v metastatických buňkách prsu. Ztráta exprese je pravděpodobně spojena s progresí primárního nádoru do metastatického fenotypu.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000175315 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024846 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Stenman G, Astrom AK, Roijer E, Sotiropoulou G, Zhang M, Sager R (červen 1997). "Přiřazení nového inhibitoru cysteinové proteinázy (CST6) k 11q13 pomocí fluorescenční in situ hybridizace". Cytogenet Cell Genet. 76 (1–2): 45–6. doi:10.1159/000134512. PMID 9154125.
^ Ni J, Abrahamson M, Zhang M, Fernandez MA, Grubb A, Su J, Yu GL, Li Y, Parmelee D, Xing L, Coleman TA, Gentz S, Thotakura R, Nguyen N, Hesselberg M, Gentz R (květen 1997 ). „Cystatin E je nový inhibitor lidské cysteinové proteinázy se strukturální podobností s cystatiny rodiny 2“. J Biol Chem. 272 (16): 10853–8. doi:10.1074 / jbc.272.16.10853. PMID 9099741.
^ ^A ^b „Entrez Gene: CST6 cystatin E / M“.

externí odkazy

The MEROPS online databáze peptidáz a jejich inhibitorů: I25.006
Člověk CST6 umístění genomu a CST6 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Brown WM, Dziegielewska KM (1997). „Přátelé a vztahy nadčeledi cystatinů - noví členové a jejich vývoj“. Protein Sci. 6 (1): 5–12. doi:10.1002 / pro.5560060102. PMC 2143511. PMID 9007972.
Barka T, Asbell PA, van der Noen H, Prasad A (1991). "Cystatiny v lidské slzné tekutině". Curr. Eye Res. 10 (1): 25–34. doi:10.3109/02713689109007608. PMID 2029847.
Saitoh E, Isemura S, Sanada K a kol. (1989). „Nadčeleď cystatinů. Důkaz, že geny cystatinů rodiny II jsou evolučně příbuzné s geny cystatinů rodiny III“. Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 369. Suppl: 191–7. PMID 3202964.
Thiesse M, Millar SJ, Dickinson DP (1994). „Lidská rodina cystatinových genů typu 2 se skládá z osmi až devíti členů, přičemž nejméně sedm genů je seskupeno na jednom místě na lidském chromozomu 20“. DNA Cell Biol. 13 (2): 97–116. doi:10.1089 / dna.1994.13.97. PMID 8179826.
Sotiropoulou G, Anisowicz A, Sager R (1997). „Identifikace, klonování a charakterizace cystatinu M, nového inhibitoru cysteinové proteinázy, down-regulovaného u rakoviny prsu“. J. Biol. Chem. 272 (2): 903–10. doi:10.1074 / jbc.272.2.903. PMID 8995380.
Zeeuwen PL, Van Vlijmen-Willems IM, Jansen BJ a kol. (2001). „Exprese cystatinu M / E je omezena na diferencované epidermální keratinocyty a potní žlázy: nový inhibitor proteinázy specifické pro kůži, který je cílem zesíťování transglutaminázou.“ J. Invest. Dermatol. 116 (5): 693–701. doi:10.1046 / j.1523-1747.2001.01309.x. PMID 11348457.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Zeeuwen PL, Dale BA, de Jongh GJ a kol. (2003). "Gen lidského cystatinu M / E (CST6): vyloučení kandidátského genu pro ichtyózu harlekýnu". J. Invest. Dermatol. 121 (1): 65–8. doi:10.1046 / j.1523-1747.2003.12312.x. PMID 12839564.
Shridhar R, Zhang J, Song J a kol. (2004). „Cystatin M potlačuje maligní fenotyp lidských buněk MDA-MB-435S“. Onkogen. 23 (12): 2206–15. doi:10.1038 / sj.onc.1207340. PMID 14676833.
Zhang J, Shridhar R, Dai Q a kol. (2004). „Cystatin m: nový kandidátský tumor supresorový gen pro rakovinu prsu“. Cancer Res. 64 (19): 6957–64. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-04-0819. PMID 15466187.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Song J, Jie C, Polk P a kol. (2006). „Kandidát potlačující nádor CST6 mění profil genové exprese buněk lidského karcinomu prsu: down-regulace silného mitogenního, motogenního a angiogenního faktoru autotaxinu“. Biochem. Biophys. Res. Commun. 340 (1): 175–82. doi:10.1016 / j.bbrc.2005.11.171. PMID 16356477.
Cheng T, Hitomi K, van Vlijmen-Willems IM a kol. (2006). „Cystatin M / E je vysoce afinitní inhibitor katepsinu V a katepsinu L prostřednictvím reaktivního místa, které je odlišné od vazebného místa pro legumain. Nová stopa role cystatinu M / E při epidermální rohovce“. J. Biol. Chem. 281 (23): 15893–9. doi:10,1074 / jbc.M600694200. PMID 16565075.
Ai L, Kim WJ, Kim TY a kol. (2007). „Epigenetické umlčení nádoru potlačujícího cystatin M nastává během progrese rakoviny prsu“. Cancer Res. 66 (16): 7899–909. doi:10.1158 / 0008-5472.CAN-06-0576. PMID 16912163.
Rivenbark AG, Jones WD, Coleman WB (2007). „Ztlumení CST6 v buněčných liniích rakoviny prsu u lidí závislé na methylaci DNA“. Laboratoř. Investovat. 86 (12): 1233–42. doi:10.1038 / labinvest.3700485. PMID 17043665.
Schagdarsurengin U, Pfeifer GP, Dammann R (2007). „Častá epigenetická inaktivace cystatinu M u karcinomu prsu“. Onkogen. 26 (21): 3089–94. doi:10.1038 / sj.onc.1210107. PMID 17099723.
Rivenbark AG, Livasy CA, Boyd CE a kol. (2007). „Methylace závislé umlčení CST6 u primárních lidských nádorů prsu a metastatických lézí“. Exp. Mol. Pathol. 83 (2): 188–97. doi:10.1016 / j.yexmp.2007.03.008. PMC 2693953. PMID 17540367.

Tento článek o gen na lidský chromozom 11 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000175315 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000024846 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid9154125-5] Stenman G, Astrom AK, Roijer E, Sotiropoulou G, Zhang M, Sager R (červen 1997). "Přiřazení nového inhibitoru cysteinové proteinázy (CST6) k 11q13 pomocí fluorescenční in situ hybridizace". Cytogenet Cell Genet. 76 (1–2): 45–6. doi:10.1159/000134512. PMID 9154125.

[pmid9099741-6] Ni J, Abrahamson M, Zhang M, Fernandez MA, Grubb A, Su J, Yu GL, Li Y, Parmelee D, Xing L, Coleman TA, Gentz S, Thotakura R, Nguyen N, Hesselberg M, Gentz R (květen 1997 ). „Cystatin E je nový inhibitor lidské cysteinové proteinázy se strukturální podobností s cystatiny rodiny 2“. J Biol Chem. 272 (16): 10853–8. doi:10.1074 / jbc.272.16.10853. PMID 9099741.

[entrez-7] A ^b „Entrez Gene: CST6 cystatin E / M“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]