CPSF2 - CPSF2

CPSF2
Identifikátory
Aliasy	CPSF2, CPSF100, faktor 2 specifický pro štěpení a polyadenylaci
Externí ID	OMIM: 606028 MGI: 1861601 HomoloGene: 6460 Genové karty: CPSF2
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 14 (lidský)
Konec	92,172,145 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 12 (myš)
Konec	102,006,424 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• komplex štěpení mRNA a komplex polyadenylační specificity; • membrána; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • ukončení transkripce RNA polymerázy II; • mRNA polyadenylace; • Zpracování mRNA; • Štěpení mRNA; • Zpracování mRNA na 3'-konci vazbou na kmenovou smyčku a štěpením; • Zpracování mRNA 3'-end; • export mRNA z jádra;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	53981
	51786
	ENSG00000165934
	ENSMUSG00000041781
	Q9P2I0
	O35218
	NM_017437; NM_001322270; NM_001322271; NM_001322272
	NM_016856
	NP_001309199; NP_001309200; NP_001309201; NP_059133
	NP_058552
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka faktoru štěpnosti a polyadenylační specificity 2 je protein že u lidí je kódován CPSF2 gen.^[5]^[6]^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165934 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000041781 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Jenny A, Hauri HP, Keller W (prosinec 1994). "Charakterizace faktoru specificity štěpení a polyadenylace a klonování jeho 100kD podjednotky". Mol Cell Biol. 14 (12): 8183–90. doi:10.1128 / MCB.14.12.8183. PMC 359357. PMID 7969155.
^ Samiotaki M, Balatsos NA, Courtis N, Tsiapalis CM (leden 2001). "Přiřazení 100 kDa podjednotky faktoru štěpení a polyadenylační specificity (CPSF2) k lidskému chromozomu 14q31.3 radiačním hybridním mapováním". Cytogenet Cell Genet. 90 (3–4): 328–9. doi:10.1159/000056798. PMID 11124543.
^ „Entrez Gene: CPSF2 štěpení a polyadenylační specifický faktor 2, 100 kDa“.

externí odkazy

Člověk CPSF2 umístění genomu a CPSF2 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Murthy KG, Manley JL (1995). „160-kD podjednotka lidských faktorů štěpení-polyadenylační specificity koordinuje pre-mRNA 3'-konec formace“. Genes Dev. 9 (21): 2672–83. doi:10,1101 / gad. 9.21.2672. PMID 7590244.
Thuresson AC, Aström J, Aström A a kol. (1994). „Více forem poly (A) polymeráz v lidských buňkách“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (3): 979–83. doi:10.1073 / pnas.91.3.979. PMC 521437. PMID 8302877.
Bienroth S, Keller W, Wahle E (1993). „Sestavení polyadenylačního komplexu procesivního messenger RNA“. EMBO J.. 12 (2): 585–94. doi:10.1002 / j.1460-2075.1993.tb05690.x. PMC 413241. PMID 8440247.
Schul W, Groenhout B, Koberna K a kol. (1996). „Faktory štěpení RNA 3 'CstF 64 kDa a CPSF 100 kDa jsou koncentrovány v jaderných doménách úzce spojených se stočenými těly a nově syntetizovanou RNA.“. EMBO J.. 15 (11): 2883–92. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00649.x. PMC 450226. PMID 8654386.
McCracken S, Fong N, Yankulov K, et al. (1997). "C-koncová doména RNA polymerázy II spojuje zpracování mRNA s transkripcí". Příroda. 385 (6614): 357–61. doi:10.1038 / 385357a0. PMID 9002523.
Takagaki Y, Manley JL (2000). „Komplexní proteinové interakce v rámci lidského polyadenylačního aparátu identifikují novou složku“. Mol. Buňka. Biol. 20 (5): 1515–25. doi:10.1128 / MCB.20.5.1515-1525.2000. PMC 85326. PMID 10669729.
Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI a kol. (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XVI. Kompletní sekvence 150 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 7 (1): 65–73. doi:10.1093 / dnares / 7.1.65. PMID 10718198.
Monsalve M, Wu Z, Adelmant G a kol. (2000). "Přímá vazba transkripce a zpracování mRNA pomocí termogenního koaktivátoru PGC-1". Mol. Buňka. 6 (2): 307–16. doi:10.1016 / S1097-2765 (00) 00031-9. PMID 10983978.
de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W a kol. (2000). „Lidský pre-mRNA štěpný faktor II (m) obsahuje homology kvasinkových proteinů a spojuje další dva štěpné faktory“. EMBO J.. 19 (21): 5895–904. doi:10.1093 / emboj / 19.21.5895. PMC 305781. PMID 11060040.
Hodgman R, Tay J, Mendez R, Richter JD (2001). „CPEB fosforylace a cytoplazmatická polyadenylace jsou katalyzovány kinázou IAK1 / Eg2 ve zralých myších oocytech“. Rozvoj. 128 (14): 2815–22. PMID 11526086.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Kaufmann I, Martin G, Friedlein A a kol. (2005). „Human Fip1 je podjednotka CPSF, která se váže na prvky RNA bohaté na U a stimuluje poly (A) polymerázu“. EMBO J.. 23 (3): 616–26. doi:10.1038 / sj.emboj.7600070. PMC 1271804. PMID 14749727.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Mammalian Gene Collection (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y a kol. (2006). „Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů“. Genome Res. 16 (1): 55–65. doi:10,1101 / gr. 4039406. PMC 1356129. PMID 16344560.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Ewing RM, Chu P, Elisma F a kol. (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Mol. Syst. Biol. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.

Tento článek o gen na lidský chromozom 14 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000165934 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání Ensembl 89: ENSMUSG00000041781 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7969155-5] Jenny A, Hauri HP, Keller W (prosinec 1994). "Charakterizace faktoru specificity štěpení a polyadenylace a klonování jeho 100kD podjednotky". Mol Cell Biol. 14 (12): 8183–90. doi:10.1128 / MCB.14.12.8183. PMC 359357. PMID 7969155.

[pmid11124543-6] Samiotaki M, Balatsos NA, Courtis N, Tsiapalis CM (leden 2001). "Přiřazení 100 kDa podjednotky faktoru štěpení a polyadenylační specificity (CPSF2) k lidskému chromozomu 14q31.3 radiačním hybridním mapováním". Cytogenet Cell Genet. 90 (3–4): 328–9. doi:10.1159/000056798. PMID 11124543.

[entrez-7] „Entrez Gene: CPSF2 štěpení a polyadenylační specifický faktor 2, 100 kDa“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]