CPSF1 - CPSF1

CPSF1
Identifikátory
Aliasy	CPSF1, CPSF160, HSU37012, P / cl.18, faktor specifický pro štěpení a polyadenylaci 1
Externí ID	OMIM: 606027 MGI: 2679722 HomoloGene: 40865 Genové karty: CPSF1
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 8 (lidský)
Konec	144,409,349 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 15 (myš)
Konec	76,607,591 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• vazba nukleové kyseliny; • vazba enzymu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba na oblast bohatou na mRNA 3'-UTR AU; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• komplex štěpení mRNA a komplex polyadenylační specificity; • buněčné jádro; • nukleoplazma;
Biologický proces	• Sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu; • ukončení transkripce RNA polymerázy II; • mRNA polyadenylace; • Zpracování mRNA; • Štěpení mRNA; • Zpracování mRNA 3'-end; • export mRNA z jádra; • pro polyadenylaci je vyžadováno štěpení pre-mRNA; • Sestřih tRNA prostřednictvím endonukleolytického štěpení a ligace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	29894
	94230
	ENSG00000071894
	ENSMUSG00000034022
	Q10570
	Q9EPU4
	NM_013291
	NM_001164173; NM_053193; NM_001361485
	NP_037423
	NP_001157645; NP_444423; NP_001348414
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka faktoru štěpnosti a polyadenylační specificity 1 je protein že u lidí je kódován CPSF1 gen.^[5]^[6]^[7]

Ve většině případů eukaryotická pre-posel (m) RNA 3 primární konce jsou zpracovány ve dvou koordinovaných krocích. Nejprve dochází k místně specifickému štěpení endonukleázou a potom přidání poly (A) ocasu na 3 primární konec 5 štěpného produktu. Štěpení vyžaduje čtyři multisubunitové komplexy, jmenovitě faktor štěpení a faktor polyadenylační specificity (CPSF), faktor stimulace štěpení (CstF), faktory štěpení Im a IIm (CFIm a CFIIm), spolu s jedinou podjednotkou poly (A) polymerázy (PAP). CPSF1 je největší složka komplexu CPSF složená z CPSF1, CPSF2, CPSF3, CPSF4, FIP1L1, Symplekin a WDR33 a umístěná v jádře.^[8]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000071894 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034022 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Jenny A, Keller W (září 1995). "Klonování cDNA kódujících 160 kDa podjednotku bovinního štěpení a faktor polyadenylační specificity". Nucleic Acids Res. 23 (14): 2629–35. doi:10.1093 / nar / 23.14.2629. PMC 307085. PMID 7651824.
^ Murthy KG, Manley JL (prosinec 1995). „160-kD podjednotka lidských faktorů štěpení-polyadenylační specificity koordinuje pre-mRNA 3'-konec formace“. Genes Dev. 9 (21): 2672–83. doi:10,1101 / gad. 9.21.2672. PMID 7590244.
^ „Entrez Gene: CPSF1 štěpení a polyadenylační specifický faktor 1, 160 kDa“.
^ Shi Y, Di Giammartino DC, Taylor D, Sarkeshik A, Rice WJ, Yates JR, Frank J, Manley JL (únor 2009). „Molekulární architektura komplexu zpracování lidské pre-mRNA 3 '“. Mol. Buňka. 33 (3): 365–76. doi:10.1016 / j.molcel.2008.12.028. PMC 2946185. PMID 19217410.

Další čtení

Keller W, Bienroth S, Lang KM, Christofori G (1992). „Štěpný a polyadenylační faktor CPF specificky interaguje s pre-mRNA 3 'signálem zpracování AAUAAA“. EMBO J.. 10 (13): 4241–9. doi:10.1002 / j.1460-2075.1991.tb05002.x. PMC 453176. PMID 1756731.
Thuresson AC, Aström J, Aström A a kol. (1994). „Více forem poly (A) polymeráz v lidských buňkách“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 91 (3): 979–83. doi:10.1073 / pnas.91.3.979. PMC 521437. PMID 8302877.
Schul W, Groenhout B, Koberna K a kol. (1996). „Faktory štěpení RNA 3 'CstF 64 kDa a CPSF 100 kDa jsou koncentrovány v jaderných doménách úzce spojených se stočenými těly a nově syntetizovanou RNA.“. EMBO J.. 15 (11): 2883–92. doi:10.1002 / j.1460-2075.1996.tb00649.x. PMC 450226. PMID 8654386.
McCracken S, Fong N, Yankulov K, et al. (1997). "C-koncová doména RNA polymerázy II spojuje zpracování mRNA s transkripcí". Příroda. 385 (6614): 357–61. doi:10.1038 / 385357a0. PMID 9002523. S2CID 4307073.
Dantonel JC, Murthy KG, Manley JL, Tora L (1997). "Transkripční faktor TFIID získává faktor CPSF pro tvorbu 3 'konce mRNA". Příroda. 389 (6649): 399–402. doi:10.1038/38763. PMID 9311784. S2CID 4413324.
Takagaki Y, Manley JL (2000). „Komplexní proteinové interakce v rámci lidského polyadenylačního stroje identifikují novou složku“. Mol. Buňka. Biol. 20 (5): 1515–25. doi:10.1128 / MCB.20.5.1515-1525.2000. PMC 85326. PMID 10669729.
de Vries H, Rüegsegger U, Hübner W a kol. (2000). „Lidský pre-mRNA štěpný faktor IIm obsahuje homology kvasinkových proteinů a přemosťuje další dva štěpné faktory“. EMBO J.. 19 (21): 5895–904. doi:10.1093 / emboj / 19.21.5895. PMC 305781. PMID 11060040.
Samiotaki M, Balatsos NA, Courtis N, Tsiapalis CM (2001). „Přiřazení podjednotky 160 kDa faktoru štěpení a polyadenylační specificity (CPSF1) k lidskému chromozomu 8q24.23 radiačním hybridním mapováním“. Cytogenet. Cell Genet. 90 (3–4): 234–5. doi:10.1159/000056776. PMID 11124521. S2CID 202645825.
McCracken S, Lambermon M, Blencowe BJ (2002). „SRm160 Splicing Coactivator podporuje přepis 3'-end štěpení“. Mol. Buňka. Biol. 22 (1): 148–60. doi:10.1128 / MCB.22.1.148-160.2002. PMC 134228. PMID 11739730.
Maeda Y, Ito M, Harashima N a kol. (2002). „Peptidy odvozené od štěpného a polyadenylačního faktoru specificity (CPSF) mohou u většiny pacientů s gastrointestinálním karcinomem indukovat CTL omezené na HLA-A2 a specifické pro nádor.“ Int. J. Cancer. 99 (3): 409–17. doi:10.1002 / ijc.10377. PMID 11992410. S2CID 12789683.
Holland L, Gauthier L, Bell-Rogers P, Yankulov K (2002). „Odlišné části proteinu 2 udržujícího minichromozomy se asociují s holoenzymem histonu H3 / H4 a RNA polymerázy II“. Eur. J. Biochem. 269 (21): 5192–202. doi:10.1046 / j.1432-1033.2002.03224.x. PMID 12392551.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Lehner B, Semple JI, Brown SE a kol. (2004). „Analýza vysoce výkonného kvasinkového dvouhybridního systému a jeho použití k predikci funkce intracelulárních proteinů kódovaných v humánní oblasti MHC třídy III“. Genomika. 83 (1): 153–67. doi:10.1016 / S0888-7543 (03) 00235-0. PMID 14667819.
Kaufmann I, Martin G, Friedlein A a kol. (2005). „Human Fip1 je podjednotka CPSF, která se váže na prvky RNA bohaté na U a stimuluje poly (A) polymerázu“. EMBO J.. 23 (3): 616–26. doi:10.1038 / sj.emboj.7600070. PMC 1271804. PMID 14749727.
Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D a kol. (2004). „Rozsáhlá charakterizace jaderných fosfoproteinů z buněk HeLa“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 101 (33): 12130–5. doi:10.1073 / pnas.0404720101. PMC 514446. PMID 15302935.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.

externí odkazy

Člověk CPSF1 umístění genomu a CPSF1 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 8 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000071894 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034022 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7651824-5] Jenny A, Keller W (září 1995). "Klonování cDNA kódujících 160 kDa podjednotku bovinního štěpení a faktor polyadenylační specificity". Nucleic Acids Res. 23 (14): 2629–35. doi:10.1093 / nar / 23.14.2629. PMC 307085. PMID 7651824.

[pmid7590244-6] Murthy KG, Manley JL (prosinec 1995). „160-kD podjednotka lidských faktorů štěpení-polyadenylační specificity koordinuje pre-mRNA 3'-konec formace“. Genes Dev. 9 (21): 2672–83. doi:10,1101 / gad. 9.21.2672. PMID 7590244.

[entrez-7] „Entrez Gene: CPSF1 štěpení a polyadenylační specifický faktor 1, 160 kDa“.

[pmid19217410-8] Shi Y, Di Giammartino DC, Taylor D, Sarkeshik A, Rice WJ, Yates JR, Frank J, Manley JL (únor 2009). „Molekulární architektura komplexu zpracování lidské pre-mRNA 3 '“. Mol. Buňka. 33 (3): 365–76. doi:10.1016 / j.molcel.2008.12.028. PMC 2946185. PMID 19217410.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]