CORO1A - CORO1A
Coronin-1A je protein že u lidí je kódován CORO1A gen.[5][6] Bylo zahrnuto jak do imunity zprostředkované T-buňkami, tak do mitochondrií apoptóza. V nedávné studii dlouhověkosti v celém genomu bylo zjištěno, že její hladiny exprese jsou negativně spojeny jak s věkem v době odběru krve, tak s dobou přežití po odběru krve.[7]
Objev
Rodina proteinů koroninu byla objevena v roce 1991 Eugeniem L. Hostosem. Hostos použil cytoskeletální přípravek zvaný „kontrakční vrtule“, který účinně pomáhal při čištění cytoskeletálních proteinů. Tato technika mu umožnila vysrážet složky aktomyosinu spolu s požadovanými proteiny.[8]
Tyto proteiny byly pojmenovány Corona, což je latinské slovo pro korunu, kvůli tvaru podobnému koruně, který tvoří při kontaktu s povrchem buňky. Coronin-1a byl nejvíce zkoumaný díky své složitosti a zajímavým strukturním složkám. Po výzkumu bylo zjištěno, že koronin-1a slouží jako aktin vázající aktin, když reaguje s K-glutamátem. Anion K + a glutamát byly použity kvůli jeho podobnosti s prostředím uvnitř buňky, což umožnilo vazbě koroninu-1a na F-aktin.
Později byla komplementární DNA (cDNA) koroninu-1a klonována do expresní knihovny, což vedlo k závěru, že koronin-1a má velmi podobnou strukturu jako beta (β) podjednotky G proteinů (Gβ). Proto bylo zjištěno, že koronin-1a má pět opakování motivů WD a toto se opakuje sedmkrát a tvoří strukturu podobnou vrtuli.[8]
V buňce slouží koronin-1a jako pomocná látka pro mnoho cytoskeletálních procesů, které zahrnují aktin. Byl vyvozen závěr, že je známo, že koronin-1a ovlivňuje „cytoskeletální reorganizaci“ i „dynamiku aktinů“ spolu s dalšími bílkovinami.[8]
Fylogeneze
Rodina koroninů se skládá z dvanácti podskupin, které zahrnují: sedm podskupin spadajících pod obratlovce a pět podskupin složených z metazoanů, hub a améb.
Evoluční podrodiny koroninu byly seskupeny podle jeho podobností a vztahů mezi různými proteiny. Coronin-1a (označovaný také jako CORO1A, Coronin 4 a CRN4) byl nalezen u 19 obratlovců.[9]
Funkce
Koronin-1a byl nalezen v buněčné kůře makrofágů, což jsou bílé krvinky, které pomáhají při procesu zvaném fagocytóza. Model na obrázku 3 ukazuje zapojení koroninu-1a do makrofágů. Když je buňka v klidu, je Coronin-1a rozprostřen po celé cytoplazmě a buněčné kůře. Když se tedy patogen dostane do buňky, koronin-1a se váže na fagozomální membránu a zajišťuje vazbu a aktivaci kalcinuerinu, což vede k zastavení fúzních lysozomů s fagozomy. Jinými slovy, pokud je odstraněn koronin-1a a kalcinuerin je inhibován, umožňuje to iniciaci fúze fagozomů s lysozomem a zabíjení mykobakterií.[10]
Fylogenetický strom rodiny koroninů je široký. Stejným způsobem, jakým koronin-1a pomáhá při reorganizaci cytoskeletu a dynamické aktivitě s jinými proteiny u obratlovců, lze Coronin pozorovat také u bezobratlých, například Toxoplasma gondii (také známý jako TgCor).[11]
Toxoplasma gondii coronin (TgCor) se váže na F-aktin a urychluje proces polymerace aktinu. Zabraňuje také nájezdům a výjezdům. Stejně jako všechny ostatní koroniny je TgCor protein vázající aktiny, delokalizuje se na zadní stranu napadajících parazitů a blokuje jim opuštění.[11]
Struktura
Struktura koroninu-1A je tvořena pěti opakováními WD a tyto motivy se sedmkrát opakují a vytvářejí struktury podobné vrtuli.
Nová vizualizace pásu sekundární struktury koroninu-1a. V modelu A je čelní pohled na coronin-1a, sekundární struktura vám umožňuje jasně vidět paralelní beta listy pohybující se směrem ke spodní části struktury. Model B, je boční pohled na protein, který ukazuje otáčky a cívky mezi listy beta. Z těchto obrázků vidíme, že řetězce alfa helixu a helixu jsou koncentrovány ve spodní části proteinu.[12]
Coronin-1a byl vložen do programu Database of Secondary Structure Program, kde byla zadána databáze Protein Data Bank a je vytvořen panel sekundární struktury, kde je jasně vidět sedm opakování, z nichž je vyrobena vrtule. Také zobrazuje aminokyselinovou sekvenci koroninu-1a. Žluté šipky znamenají řetězce beta, fialové smyčky jsou zatáčky, černé čáry znamenají prázdné, což znamená, že nebyla přiřazena žádná sekundární struktura, světle růžová je 3/10-šroubovice, královská modrá čára je ohyb a nakonec červená šroubovice označuje alfa šroubovice.
Reference
- ^ A b C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000102879 - Ensembl, Květen 2017
- ^ A b C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000030707 - Ensembl, Květen 2017
- ^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
- ^ Okumura M, Kung C, Wong S, Rodgers M, Thomas ML (září 1998). „Definice rodiny proteinů souvisejících s koroniny konzervovaných mezi lidmi a myšmi: úzká genetická vazba mezi koroninem-2 a proteinem spojeným s CD45“. DNA a buněčná biologie. 17 (9): 779–87. doi:10.1089 / dna.1998.17.779. PMID 9778037.
- ^ „Entrez Gene: CORO1A coronin, aktin vázající protein, 1A“.
- ^ Kerber RA, O'Brien E, Cawthon RM (červen 2009). „Profily genové exprese spojené se stárnutím a úmrtností u lidí“. Stárnoucí buňka. 8 (3): 239–50. doi:10.1111 / j.1474-9726.2009.00467.x. PMC 2759984. PMID 19245677.
- ^ A b C de Hostos EL (2008). "Stručná historie rodiny koroninů". Rodina proteinů Coronin. Subcelulární biochemie. 48. Databáze biologických věd Madame Curie. 31–40. doi:10.1007/978-0-387-09595-0_4. ISBN 978-0-387-09594-3. PMID 18925369.
- ^ Rybakin V, Clemen CS, Eichinger L (2008). Rodina proteinů koroninu (první vydání). New York, NY: Springer. s. 1–5. ISBN 978-0387095943. PMID 18925366.
- ^ Pieters J (2000). "Coronin 1 s vrozenou imunitou". Rodina proteinů Coronin. Subcelulární biochemie. 48. str. 116–23. doi:10.1007/978-0-387-09595-0_11. ISBN 978-0-387-09594-3. PMID 18925376.
- ^ A b Steinmetz MO, Jelesarov I, Matousek WM, Honnappa S, Jahnke W, Missimer JH, Frank S, Alexandrescu AT, Kammerer RA (duben 2007). "Molekulární základ tvorby svinutých cívek". Sborník Národní akademie věd Spojených států amerických. 104 (17): 7062–7. doi:10.1073 / pnas.0700321104. PMC 1855353. PMID 17438295.
- ^ McArdle B, Hofmann A (2000). "Struktura a důsledky koroninu". Rodina proteinů Coronin. Subcelulární biochemie. 48. 56–71. doi:10.1007/978-0-387-09595-0_6. ISBN 978-0-387-09594-3. PMID 18925371.
externí odkazy
- Člověk CORO1A umístění genomu a CORO1A stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
- Přehled všech strukturálních informací dostupných v PDB pro UniProt: O89053 (Coronin-1A) na PDBe-KB.
Další čtení
- Rasmussen HH, van Damme J, Puype M, Gesser B, Celis JE, Vandekerckhove J (prosinec 1992). „Mikrosekvence 145 proteinů zaznamenané v databázi dvourozměrných gelových proteinů normálních lidských epidermálních keratinocytů“. Elektroforéza. 13 (12): 960–9. doi:10,1002 / elps.11501301199. PMID 1286667. S2CID 41855774.
- Suzuki K, Nishihata J, Arai Y, Honma N, Yamamoto K, Irimura T, Toyoshima S (květen 1995). "Molekulární klonování nového proteinu vázajícího aktin, p57, s opakováním WD a motivem leucinového zipu". FEBS Dopisy. 364 (3): 283–8. doi:10.1016 / 0014-5793 (95) 00393-N. PMID 7758584. S2CID 45276555.
- Grogan A, Reeves E, Keep N, Wientjes F, Totty NF, Burlingame AL, Hsuan JJ, Segal AW (prosinec 1997). „Cytosolické proteiny phox interagují s a regulují shromažďování koroninu v neutrofilech“. Journal of Cell Science. 110. 110 (24): 3071–81. PMID 9365277.
- Ferrari G, Langen H, Naito M, Pieters J (květen 1999). "Krycí protein na fagozomech podílejících se na intracelulárním přežití mykobakterií". Buňka. 97 (4): 435–47. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80754-0. PMID 10338208. S2CID 18159353.
- Vanguri VK, Wang S, Godyna S, Ranganathan S, Liau G (duben 2000). „Trombospondin-1 se váže na polyhistidin s vysokou afinitou a specificitou“. The Biochemical Journal. 347 (Pt 2): 469–73. doi:10.1042/0264-6021:3470469. PMC 1220979. PMID 10749676.
- Oku T, Itoh S, Okano M, Suzuki A, Suzuki K, Nakajin S, Tsuji T, Nauseef WM, Toyoshima S (duben 2003). „Dvě oblasti odpovědné za vazbu aktinu p57, savčího proteinu vázajícího aktin z rodiny koroninů“. Biologický a farmaceutický bulletin. 26 (4): 409–16. doi:10,1248 / bpb.26,409. PMID 12673016.
- Fu GK, Wang JT, Yang J, Au-Young J, Stuve LL (červenec 2004). "Kruhová rychlá amplifikace cDNA končí pro vysokovýkonné extenzní klonování částečných genů". Genomika. 84 (1): 205–10. doi:10.1016 / j.ygeno.2004.01.011. PMID 15203218.
- Oku T, Itoh S, Ishii R, Suzuki K, Nauseef WM, Toyoshima S, Tsuji T (duben 2005). "Homotypická dimerizace proteinu vázajícího aktin p57 / koronin-1 zprostředkovaná motivem leucinového zipu v C-koncové oblasti". The Biochemical Journal. 387 (Pt 2): 325–31. doi:10.1042 / BJ20041020. PMC 1134960. PMID 15601263.
- Gatfield J, Albrecht I, Zanolari B, Steinmetz MO, Pieters J (červen 2005). „Sdružení plazmatické membrány leukocytů s cytoskeletem aktinu prostřednictvím navinutých cívkami zprostředkovaných molekul trimerního koroninu 1“. Molekulární biologie buňky. 16 (6): 2786–98. doi:10,1091 / mbc.E05-01-0042. PMC 1142424. PMID 15800061.
- Anand PK, Kaul D (září 2005). „Downregulace transkripce genu TACO omezuje vstup / přežití mykobakterií v lidských makrofázích“. Mikrobiologické dopisy FEMS. 250 (1): 137–44. doi:10.1016 / j.femsle.2005.06.056. PMID 16040207.
- Liu CZ, Chen Y, Sui SF (leden 2006). "Identifikace nové oblasti vázající aktin v p57". Cell Research. 16 (1): 106–12. doi:10.1038 / sj.cr.7310014. PMID 16467882.
- Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). „Mapování interakcí lidských proteinů a proteinů ve velkém měřítku hmotnostní spektrometrií“. Molekulární systémy biologie. 3 (1): 89. doi:10.1038 / msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931.
- Yan M, Di Ciano-Oliveira C, Grinstein S, Trimble WS (květen 2007). „Funkce koroninu je vyžadována pro chemotaxi a fagocytózu v lidských neutrofilech“. Journal of Immunology. 178 (9): 5769–78. doi:10,4049 / jimmunol. 179,9,5769. PMID 17442961.
Galerie PDB | |
|---|---|
|
