COPS8 - COPS8

COPS8
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	4D10, 4D18, 4WSN
Identifikátory
Aliasy	COPS8, COP9, CSN8, SGN8, COP9 signalosomová podjednotka 8
Externí ID	OMIM: 616011 MGI: 1915363 HomoloGene: 4882 Genové karty: COPS8
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	237,100,474 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	90,613,341 bp
Exprese RNA vzor
	; ; ; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• GO: 0001948 vazba na proteiny;
Buněčná složka	• perinukleární oblast cytoplazmy; • extracelulární exosom; • buněčné jádro; • nukleoplazma; • cytoplazma; • cytosol; • COP9 signalosom;
Biologický proces	• oprava nukleotidů excizí spojená s transkripcí; • aktivace aktivity kinázy indukující NF-kappaB; • nukleotidová excize, rozpoznání poškození DNA; • negativní regulace buněčné proliferace; • Sestava signalosomu COP9; • proteinová deneddylace; • posttranslační modifikace; • fosforylace bílkovin;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	10920
	108679
	ENSG00000198612
	ENSMUSG00000034432
	Q99627
	Q8VBV7
	NM_198189; NM_006710
	NM_133805
	NP_006701; NP_937832
	NP_598566
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Podjednotka komplexu signalosomů COP9 8 je protein že u lidí je kódován COPS8 gen.^[5]^[6]^[7]

Protein kódovaný tímto genem je nejmenší z osmi podjednotek signalosomu COP9, vysoce konzervovaného proteinového komplexu, který funguje jako důležitý regulátor ve více signálních drahách. Struktura a funkce signalosomu COP9 souvisí se strukturou a funkcí regulační částice 19S proteazomu 26S. Ukázalo se, že signalosom COP9 interaguje s ubikvitinovými ligázami typu E3 SCF a působí jako pozitivní regulátor ubikvitinových ligáz E3. Alternativně byly pozorovány sestřižené varianty transkriptu kódující odlišné izoformy.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198612 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034432 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Chamovitz DA, Deng XW (září 1995). „Nové komponenty světelné signální dráhy Arabidopsis mohou definovat skupinu obecných vývojových regulátorů sdílených jak živočišnou, tak rostlinnou říší.“. Buňka. 82 (3): 353–4. doi:10.1016/0092-8674(95)90423-9. PMID 7634324.
^ Groisman R, Polanowska J, Kuraoka I, Sawada J, Saijo M, Drapkin R, Kisselev AF, Tanaka K, Nakatani Y (květen 2003). „Aktivita ubikvitinové ligázy v komplexech DDB2 a CSA je odlišně regulována signalosomem COP9 v reakci na poškození DNA“. Buňka. 113 (3): 357–67. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00316-7. PMID 12732143. S2CID 11639677.
^ ^A ^b "Entrez Gene: COPS8 COP9 konstitutivní fotomorfogenní homologní podjednotka 8 (Arabidopsis)".

externí odkazy

Člověk COPS8 umístění genomu a COPS8 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Schwechheimer C, Deng XW (2001). „COP9 signalosome revisited: a new mediator of protein degradation“. Trends Cell Biol. 11 (10): 420–6. doi:10.1016 / S0962-8924 (01) 02091-8. PMID 11567875.
Wolf DA, Zhou C, Wee S (2004). „Signalosom COP9: montážní a údržbová platforma pro cullinové ubikvitinové ligázy?“. Nat. Cell Biol. 5 (12): 1029–33. doi:10.1038 / ncb1203-1029. PMID 14647295. S2CID 37458780.
Chamovitz DA, Wei N, Osterlund MT a kol. (1996). „Komplex COP9, nový vícepodjednotkový jaderný regulátor zapojený do řízení světla vývojového přepínače rostlin“. Buňka. 86 (1): 115–21. doi:10.1016 / S0092-8674 (00) 80082-3. PMID 8689678.
Hillier LD, Lennon G, Becker M a kol. (1997). „Generování a analýza 280 000 lidských sekvenčních značek“. Genome Res. 6 (9): 807–28. doi:10,1101 / gr. 6.807. PMID 8889549.
Seeger M, Kraft R, Ferrell K a kol. (1998). „Nový proteinový komplex zapojený do signální transdukce, který má podobnosti s podjednotkami proteasomu 26S“. FASEB J.. 12 (6): 469–78. doi:10.1096 / fasebj.12.6.469. PMID 9535219. S2CID 25424324.
Wei N, Tsuge T, Serino G a kol. (1998). „Komplex COP9 je konzervován mezi rostlinami a savci a souvisí s regulačním komplexem proteasomu 26S“. Curr. Biol. 8 (16): 919–22. doi:10.1016 / S0960-9822 (07) 00372-7. PMID 9707402. S2CID 13873982.
Naumann M, Bech-Otschir D, Huang X a kol. (2000). „Aktivace / stabilizace c-Jun zaměřená na signalosom COP9 je nezávislá na JNK“. J. Biol. Chem. 274 (50): 35297–300. doi:10.1074 / jbc.274.50.35297. PMID 10585392.
Cohen H, Azriel A, Cohen T a kol. (2001). „Interakce mezi proteinem vázajícím se na sekvenci interferonu a podjednotkou COP9 / signalosomu CSN2 (Trip15). Možná vazba mezi signalizací regulačního faktoru interferonu a COP9 / signalosomem“. J. Biol. Chem. 275 (50): 39081–9. doi:10,1074 / jbc.M004900200. PMID 10991940.
Gizatullin RZ, Muravenko OV, Al-Amin AN a kol. (2001). "Humánní COP9 podjednotka 8 homologního genu SGN8 Mapa pozice 2q37". Chromosome Res. 8 (6): 559. doi:10.1023 / A: 1009279908306. PMID 11032325. S2CID 12957157.
Bech-Otschir D, Kraft R, Huang X a kol. (2001). "COP9 signalosomově specifická fosforylace cílí p53 na degradaci ubikvitinovým systémem". EMBO J.. 20 (7): 1630–9. doi:10.1093 / emboj / 20.7.1630. PMC 145508. PMID 11285227.
Lyapina S, Cope G, Shevchenko A, et al. (2001). "Podpora štěpení konjugátu NEDD-CUL1 signalosomem COP9". Věda. 292 (5520): 1382–5. doi:10.1126 / science.1059780. PMID 11337588. S2CID 14224920.
Hoareau Alves K, Bochard V, Réty S, Jalinot P (2002). „Sdružení savčího protoonkoproteinu Int-6 se třemi proteinovými komplexy eIF3, signalosomem COP9 a proteasomem 26S“. FEBS Lett. 527 (1–3): 15–21. doi:10.1016 / S0014-5793 (02) 03147-2. PMID 12220626. S2CID 39308598.
Sun Y, Wilson MP, Majerus PW (2003). „Inositol 1,3,4-trisfosfát 5/6-kináza se asociuje se signalosomem COP9 vazbou na CSN1“. J. Biol. Chem. 277 (48): 45759–64. doi:10,1074 / jbc.M208709200. PMID 12324474.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Serino G, Su H, Peng Z a kol. (2003). „Charakterizace poslední podjednotky signalosomu Arabidopsis COP9: důsledky pro celkovou strukturu a původ komplexu“. Rostlinná buňka. 15 (3): 719–31. doi:10,1105 / tpc.009092. PMC 150025. PMID 12615944.
Uhle S, Medalia O, Waldron R a kol. (2003). „Proteinkináza CK2 a proteinkináza D jsou spojeny se signalosomem COP9“. EMBO J.. 22 (6): 1302–12. doi:10.1093 / emboj / cdg127. PMC 151059. PMID 12628923.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000198612 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000034432 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7634324-5] Chamovitz DA, Deng XW (září 1995). „Nové komponenty světelné signální dráhy Arabidopsis mohou definovat skupinu obecných vývojových regulátorů sdílených jak živočišnou, tak rostlinnou říší.“. Buňka. 82 (3): 353–4. doi:10.1016/0092-8674(95)90423-9. PMID 7634324.

[pmid12732143-6] Groisman R, Polanowska J, Kuraoka I, Sawada J, Saijo M, Drapkin R, Kisselev AF, Tanaka K, Nakatani Y (květen 2003). „Aktivita ubikvitinové ligázy v komplexech DDB2 a CSA je odlišně regulována signalosomem COP9 v reakci na poškození DNA“. Buňka. 113 (3): 357–67. doi:10.1016 / S0092-8674 (03) 00316-7. PMID 12732143. S2CID 11639677.

[entrez-7] A ^b "Entrez Gene: COPS8 COP9 konstitutivní fotomorfogenní homologní podjednotka 8 (Arabidopsis)".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]