CNOT9 - CNOT9

CNOT9
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2FV2, 4CRU, 4CRV, 4CT6, 4CT7
Identifikátory
Aliasy	CNOT9, CT129, RCD-1, RCD1, CAF40, RQCD1, CCR4-NOT transkripční komplexní podjednotka 9
Externí ID	OMIM: 612054 MGI: 1928902 HomoloGene: 3973 Genové karty: CNOT9
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 2 (lidský)
Konec	218,597,080 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 1 (myš)
Konec	74,530,842 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita homodimerizace proteinu; • specifické vazby na proteinovou doménu; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • vazba na receptor epidermálního růstového faktoru; • vazba kinázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • membrána; • Komplex CCR4-NOT; • P-tělo; • CCR4-NOT základní komplex; • buněčné jádro; • makromolekulární komplex;
Biologický proces	• zkrácení ocasu nukleární transkribované mRNA poly (A); • negativní regulace překladu; • regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace aktivity koaktivátoru transkripce nukleárního receptoru závislého na ligandu; • mRNA katabolický proces; • cytokiny zprostředkovanou signální cestu; • sexuální diferenciace; • transkripce, chráněná DNA; • umlčování genů pomocí RNA; • negativní regulace signalizační dráhy intracelulárního estrogenového receptoru; • regulace překladu; • Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53 vedoucí k zastavení buněčného cyklu; • jaderně transkribovaný katabolický proces mRNA, rozpad závislý na Deadenylation; • pozitivní regulace fosforylace peptidyl-serinu; • pozitivní regulace signální dráhy receptoru epidermálního růstového faktoru;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	9125
	58184
	ENSG00000144580
	ENSMUSG00000026174
	Q92600
	Q9JKY0
	NM_001271634; NM_001271635; NM_005444
	NM_021383
	NP_001258563; NP_001258564; NP_005435
	NP_067358
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Komplexní podjednotka transkripce CCR4-NOT 9 je protein že u lidí je kódován CNOT9 gen.^[5]

Funkce

Tento gen kóduje člena vysoce konzervované rodiny proteinů RCD1. Kódovaný protein je transkripční kofaktor a základní protein proteinu CCR4-ne mrtvá izolace komplex. Může se podílet na signální transdukci i na diferenciaci a vývoji buněk regulovaných kyselinou retinovou. Alternativně byly pro tento gen popsány sestřihové varianty transkriptu. [poskytl RefSeq, říjen 2012].

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000144580 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026174 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Entrez Gene: CCR4-NOT transkripční komplexní podjednotka 9“. Citováno 2020-04-15.

Další čtení

Hiroi N, Ito T, Yamamoto H, Ochiya T, Jinno S, Okayama H (říjen 2002). „Savčí Rcd1 je nový transkripční kofaktor, který zprostředkovává buněčnou diferenciaci indukovanou kyselinou retinovou“. EMBO J.. 21 (19): 5235–44. doi:10.1093 / emboj / cdf521. PMC 129043. PMID 12356739.
Garapaty S, Mahajan MA, Samuels HH (březen 2008). „Komponenty komplexu CCR4-NOT fungují jako koaktivátory jaderných hormonálních receptorů prostřednictvím asociace s faktorem NIF-1 interagujícím s NRC.“. J. Biol. Chem. 283 (11): 6806–16. doi:10,1074 / jbc.M706986200. PMID 18180299.
Ajiro M, Katagiri T, Ueda K, Nakagawa H, Fukukawa C, Lin ML, Park JH, Nishidate T, Daigo Y, Nakamura Y (říjen 2009). „Zapojení nadměrné exprese RQCD1, nového antigenu rakoviny-varlat, do dráhy Akt v buňkách rakoviny prsu“. Int. J. Oncol. 35 (4): 673–81. PMID 19724902.
Ajiro M, Nishidate T, Katagiri T, Nakamura Y (listopad 2010). „Kritické zapojení RQCD1 do dráhy EGFR-Akt v karcinomu prsu“. Int. J. Oncol. 37 (5): 1085–93. doi:10,3892 / ijo_00000760. PMID 20878056.
Mathys H, Basquin J, Ozgur S, Czarnocki-Cieciura M, Bonneau F, Aartse A, Dziembowski A, Nowotny M, Conti E, Filipowicz W (červen 2014). „Strukturální a biochemické poznatky o úloze komplexu CCR4-NOT a DDX6 ATPázy při represi mikroRNA“. Mol. Buňka. 54 (5): 751–65. doi:10.1016 / j.molcel.2014.03.036. PMID 24768538.
Chen Y, Boland A, Kuzuoğlu-Öztürk D, Bawankar P, Loh B, Chang CT, Weichenrieder O, Izaurralde E (červen 2014). „Komplex DDX6-CNOT1 a kapsy vázající W v CNOT9 odhalují přímé vazby mezi rozpoznáváním cílů miRNA a umlčováním“. Mol. Buňka. 54 (5): 737–50. doi:10.1016 / j.molcel.2014.03.034. PMID 24768540.
Wong SQ, Behren A, Mar VJ, Woods K, Li J, Martin C, Sheppard KE, Wolfe R, Kelly J, Cebon J, Dobrovic A, McArthur GA (leden 2015). „Sekvenování celého exomu identifikuje rekurentní mutaci RQCD1 P131L v kožním melanomu“. Cílový cíl. 6 (2): 1115–27. doi:10,18632 / oncotarget.2747. PMC 4359221. PMID 25544760.
Bulbrook D, Brazier H, Mahajan P, Kliszczak M, Fedorov O, Marchese FP, Aubareda A, Chalk R, Picaud S, Strain-Damerell C, Filippakopoulos P, Gileadi O, Clark AR, Yue WW, Burgess-Brown NA, Dean JLE (březen 2018). „Pro CCR4-NOT Deadenylase Complex Recruitment jsou vyžadovány interakce zprostředkované tryptofanem mezi tristetraprolinem a podjednotkou CNOT9“ (PDF). J. Mol. Biol. 430 (5): 722–736. doi:10.1016 / j.jmb.2017.12.018. PMID 29291391.
Han J, Yu J, Dai Y, Li J, Guo M, Song J, Zhou X (únor 2019). „Nadměrná exprese miR-361-5p u trojitě negativního karcinomu prsu (TNBC) inhibuje migraci a invazi cílením na RQCD1 a inhibicí dráhy EGFR / PI3K / Akt“. Bosn J Basic Med Sci. 19 (1): 52–59. doi:10.17305 / bjbms.2018.3399. PMC 6387672. PMID 29924958.

Tento článek včlení text z United States National Library of Medicine, který je v veřejná doména.

Tento článek o gen na lidský chromozom 2 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000144580 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000026174 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[entrez-5] „Entrez Gene: CCR4-NOT transkripční komplexní podjednotka 9“. Citováno 2020-04-15.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]