CNOT6 - CNOT6

CNOT6
Identifikátory
Aliasy	CNOT6CCR4, Ccr4a, CCR4-NOT transkripční komplexní podjednotka 6
Externí ID	OMIM: 608951 MGI: 2144529 HomoloGene: 69187 Genové karty: CNOT6
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 5 (lidský)
Konec	180,578,358 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 11 (myš)
Konec	49,712,723 bp
Exprese RNA vzor
	; ;
	Další údaje o referenčních výrazech
Genová ontologie
Molekulární funkce	• poly (A) specifická aktivita ribonukleázy; • aktivita exoribonukleázy; • vazba kovových iontů; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • Vazba RNA; • aktivita nukleázy; • aktivita exonukleázy; • aktivita hydrolázy; • Aktivita 3'-5'-exoribonukleázy;
Buněčná složka	• cytoplazma; • cytosol; • membrána; • Komplex CCR4-NOT; • buněčné jádro;
Biologický proces	• regulace transkripce, DNA-šablony; • pozitivní regulace aktivity koaktivátoru transkripce nukleárního receptoru závislého na ligandu; • hydrolýza fosfodiesterové vazby nukleové kyseliny; • transkripce, chráněná DNA; • pozitivní regulace sestavy těla zpracování cytoplazmatické mRNA; • umlčení genů miRNA; • pozitivní regulace buněčné proliferace; • exonukleolytický nukleární transkribovaný katabolický proces mRNA zapojený do rozpadu závislého na deadenylaci; • umlčování genů pomocí RNA; • nukleárně transkribovaný katabolický proces mRNA, rozpad no-go; • regulace překladu; • Odpověď na poškození DNA, transdukce signálu mediátorem třídy p53 vedoucí k zastavení buněčného cyklu; • Hydrolýza RNA fosfodiesterovou vazbou, exonukleolytická; • zkrácení ocasu nukleární transkribované mRNA poly (A);
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	57472
	104625
	ENSG00000113300
	ENSMUSG00000020362
	Q9ULM6
	Q8K3P5
	NM_001303241; NM_015455; NM_001370472; NM_001370473; NM_001370474
	NM_001290741; NM_212484; NM_001363356; NM_001363357
	NP_001290170; NP_001357401; NP_001357402; NP_001357403
	NP_001277670; NP_997649; NP_001350285; NP_001350286
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

CCR4-NOT transkripční komplexní podjednotka 6 je protein že u lidí je kódován CNOT6 gen.^[5]^[6]

Protein kódovaný tímto genem je podjednotkou CCR4-ne transkripční regulace a Deadenylase komplex. Kódovaný protein má 3'-5 ' exonukleáza aktivitu a upřednostňuje polyadenylované substráty.^[6]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113300 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020362 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Chen J, Chiang YC, Denis CL (březen 2002). „CCR4, 3'-5 'poly (A) RNA a ssDNA exonukleáza, je katalytickou složkou cytoplazmatické deadenylázy“. EMBO J.. 21 (6): 1414–26. doi:10.1093 / emboj / 21.6.1414. PMC 125924. PMID 11889047.
^ ^A ^b „Entrez Gene: transkripční komplex CNOT6 CCR4-NOT, podjednotka 6“.

externí odkazy

Člověk CCR4 umístění genomu a CCR4 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.
Člověk CNOT6 umístění genomu a CNOT6 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Další čtení

Okubo K, Itoh K, Fukushima A a kol. (1996). "Monitorování buněčné fyziologie pomocí profilů exprese a objevování genů specifických pro daný buněčný typ pomocí kompilovaných profilů exprese". Genomika. 30 (2): 178–86. doi:10.1006 / geno.1995,9887. PMID 8586417.
Nagase T, Ishikawa K, Kikuno R a kol. (2000). „Predikce kódujících sekvencí neidentifikovaných lidských genů. XV. Kompletní sekvence 100 nových cDNA klonů z mozku, které kódují velké proteiny in vitro“. DNA Res. 6 (5): 337–45. doi:10.1093 / dnares / 6.5.337. PMID 10574462.
Albert TK, Lemaire M, van Berkum NL a kol. (2000). "Izolace a charakterizace lidských ortologů kvasinkových komplexů CCR4-NOT". Nucleic Acids Res. 28 (3): 809–17. doi:10.1093 / nar / 28.3.809. PMC 102560. PMID 10637334.
Dupressoir A, Morel AP, Barbot W a kol. (2003). „Identifikace čtyř rodin proteinů souvisejících s endonukleázou závislých na yCCR4- a Mg2 + u vyšších eukaryot a charakterizace ortologů yCCR4 s konzervativní repeticí bohatou na leucin nezbytnou pro vazbu hCAF1 / hPOP2“. BMC Genomics. 2: 9. doi:10.1186/1471-2164-2-9. PMC 61044. PMID 11747467.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Chang TC, Yamashita A, Chen CY a kol. (2004). „UNR, nový partner proteinu vázajícího poly (A), hraje klíčovou roli v translačně vázaném obratu mRNA zprostředkovaném determinantem hlavní kódující oblasti c-fos“. Genes Dev. 18 (16): 2010–23. doi:10.1101 / gad.1219104. PMC 514181. PMID 15314026.
Oh JH, Yang JO, Hahn Y a kol. (2006). "Transkriptomová analýza lidské rakoviny žaludku". Mamm. Genom. 16 (12): 942–54. doi:10.1007 / s00335-005-0075-2. PMID 16341674. S2CID 69278.

Tento článek o gen na lidský chromozom 5 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000113300 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000020362 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid11889047-5] Chen J, Chiang YC, Denis CL (březen 2002). „CCR4, 3'-5 'poly (A) RNA a ssDNA exonukleáza, je katalytickou složkou cytoplazmatické deadenylázy“. EMBO J.. 21 (6): 1414–26. doi:10.1093 / emboj / 21.6.1414. PMC 125924. PMID 11889047.

[entrez-6] A ^b „Entrez Gene: transkripční komplex CNOT6 CCR4-NOT, podjednotka 6“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]