CLK3 (gen) - CLK3 (gene)

CLK3
Dostupné struktury
PDB	Hledání ortologu: PDBe RCSB
Seznam id kódů PDB
	2EU9, 2EXE, 2WU6, 2WU7, 3RAW
Identifikátory
Aliasy	CLK3, PHPHCLK3 / 152, CDC jako kináza 3
Externí ID	OMIM: 602990 MGI: 1098670 HomoloGene: 101534 Genové karty: CLK3
Umístění genu (člověk)
Chr.	Chromozom 15 (lidský)
Konec	74,645,414 bp
Umístění genu (myš)
Chr.	Chromozom 9 (myš)
Konec	57,765,860 bp
Genová ontologie
Molekulární funkce	• aktivita transferázy; • vazba nukleotidů; • aktivita proteinkinázy; • kinázová aktivita; • aktivita proteinové serin / threoninkinázy; • GO: 0001948 vazba na proteiny; • aktivita proteinu serin / threonin / tyrosin kináza; • aktivita protein tyrosinkinázy; • ATP vazba; • identická vazba na protein; • Vazba RNA;
Buněčná složka	• cytoplazma; • jaderná skvrna; • membrána; • nukleoplazma; • Akrozom; • cytoskelet s mezivláknem; • cytoplazmatický váček; • buněčné jádro;
Biologický proces	• fosforylace; • fosforylace bílkovin; • regulace sestřihu RNA; • autofosforylace; • peptidyl-tyrosin fosforylace;
	Zdroje:Amigo / QuickGO
Ortology
	1198
	102414
	ENSG00000179335
	ENSMUSG00000032316
	P49761
	O35492
	NM_001130028; NM_001292; NM_003992
	NM_007713
	NP_001123500; NP_003983
	NP_031739
	Wikidata
Zobrazit / upravit člověka	Zobrazit / upravit myš

Dvojí specificita protein kinázy CLK3 je enzym že u lidí je kódován CLK3 gen.^[5]^[6]Gen CLK3 kóduje a serin / threonin typ protein kináza s nekonzervovanou N-terminál doména. Dlouhá a krátká izoforma (phclk3 a pclk3 / 152) je výsledkem alternativní sestřih a koexistovat v různých tkáních. Isoforma phclk3 / 152 postrádá kinázovou doménu.^[7]

Reference

^ ^A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000179335 - Ensembl, Květen 2017
^ ^A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032316 - Ensembl, Květen 2017
^ „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.
^ Hanes J, von der Kammer H, Klaudiny J, Scheit KH (leden 1995). "Charakterizace klonováním cDNA dvou nových lidských proteinových kináz. Důkaz porovnáním sekvencí nové rodiny savčích proteinových kináz". J Mol Biol. 244 (5): 665–72. doi:10.1006 / jmbi.1994.1763. PMID 7990150.
^ Talmadge CB, Finkernagel S, Sumegi J, Sciorra L, Rabinow L (prosinec 1998). "Chromozomální mapování tří genů kódujících lidskou LAMMER protein-kinázu". Hum Genet. 103 (4): 523–4. doi:10,1007 / s004390050861. PMID 9856501.
^ „Entrez Gene: CLK3 CDC-like kinase 3“.

Další čtení

Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: jednoduchá metoda k nahrazení struktury cap eukaryotických mRNA oligoribonukleotidy“. Gen. 138 (1–2): 171–4. doi:10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K a kol. (1997). "Konstrukce a charakterizace knihovny cDNA obohacené o celou délku a 5'-end". Gen. 200 (1–2): 149–56. doi:10.1016 / S0378-1119 (97) 00411-3. PMID 9373149.
Duncan PI, Stojdl DF, Marius RM a kol. (1998). „Proteinové kinázy Clk2 a Clk3 s dvojí specificitou regulují intranukleární distribuci proteinů SR a ovlivňují sestřih pre-mRNA“. Exp. Cell Res. 241 (2): 300–8. doi:10.1006 / excr.1998.4083. PMID 9637771.
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. (2003). „Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších cDNA sekvencí plné délky“. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 99 (26): 16899–903. doi:10.1073 / pnas.242603899. PMC 139241. PMID 12477932.
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T a kol. (2004). „Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky“. Nat. Genet. 36 (1): 40–5. doi:10.1038 / ng1285. PMID 14702039.
Hillman RT, Green RE, Brenner SE (2005). „Nedoceněná role pro dohled nad RNA“. Genome Biol. 5 (2): R8. doi:10.1186 / gb-2004-5-2-r8. PMC 395752. PMID 14759258.
Jin J, Smith FD, Stark C a kol. (2004). "Proteomická, funkční a doménová analýza in vivo 14-3-3 vazebných proteinů zapojených do cytoskeletální regulace a buněčné organizace". Curr. Biol. 14 (16): 1436–50. doi:10.1016 / j.cub.2004.07.051. PMID 15324660.
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA a kol. (2004). „Stav, kvalita a rozšíření projektu cDNA NIH v plné délce: Sbírka genů savců (MGC)“. Genome Res. 14 (10B): 2121–7. doi:10,1101 / gr. 2596504. PMC 528928. PMID 15489334.
Rual JF, Venkatesan K, Hao T a kol. (2005). „Směrem k mapě lidské interakční sítě protein-protein v měřítku proteomu“. Příroda. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038 / nature04209. PMID 16189514.
Olsen JV, Blagoev B, Gnad F a kol. (2006). „Globální, in vivo a místně specifická dynamika fosforylace v signálních sítích“. Buňka. 127 (3): 635–48. doi:10.1016 / j.cell.2006.09.026. PMID 17081983.
Wissing J, Jänsch L, Nimtz M a kol. (2007). „Proteomická analýza proteinových kináz metodou selektivní prefrakce cílové třídy a tandemové hmotnostní spektrometrie“. Mol. Buňka. Proteomika. 6 (3): 537–47. doi:10,1074 / mcp. T600062-MCP200. PMID 17192257.

externí odkazy

Clk kinázy duální specificity v americké národní lékařské knihovně Lékařské předměty (Pletivo)
Člověk CLK3 umístění genomu a CLK3 stránka s podrobnostmi o genu v UCSC Genome Browser.

Tento článek o gen na lidský chromozom 15 je pahýl. Wikipedii můžete pomoci pomocí rozšiřovat to.

[refGRCh38Ensembl-1] A ^b ^C GRCh38: Vydání souboru 89: ENSG00000179335 - Ensembl, Květen 2017

[refGRCm38Ensembl-2] A ^b ^C GRCm38: Vydání souboru 89: ENSMUSG00000032316 - Ensembl, Květen 2017

[3] „Human PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[4] „Myš PubMed Reference:“. Národní centrum pro biotechnologické informace, Americká národní lékařská knihovna.

[pmid7990150-5] Hanes J, von der Kammer H, Klaudiny J, Scheit KH (leden 1995). "Charakterizace klonováním cDNA dvou nových lidských proteinových kináz. Důkaz porovnáním sekvencí nové rodiny savčích proteinových kináz". J Mol Biol. 244 (5): 665–72. doi:10.1006 / jmbi.1994.1763. PMID 7990150.

[pmid9856501-6] Talmadge CB, Finkernagel S, Sumegi J, Sciorra L, Rabinow L (prosinec 1998). "Chromozomální mapování tří genů kódujících lidskou LAMMER protein-kinázu". Hum Genet. 103 (4): 523–4. doi:10,1007 / s004390050861. PMID 9856501.

[entrez-7] „Entrez Gene: CLK3 CDC-like kinase 3“.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]